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線状ゲノム大腸菌の作製と解析

线性基因组大肠杆菌的创建和分析

基本信息

批准号：
18058023
负责人：
堀内嵩
金额：
$ 3.33万
依托单位：
National Institute for Basic Biology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

動植物のゲノムは線状であるのに対し、細菌のゲノムは一部の例外を除き環状である。その理由は分かっていない。この謎を明らかにするため、我々は本特定研究期間において、大腸菌の環状ゲノムの線状化に世界で初めて成功した。作成した線状ゲノムDNAの末端部分はヘアピン構造を有しており、これが末端部分を分解から防いでいる。面白いことに線状ゲノム大腸菌は、環状ゲノム株と同じように生育した。両者の諸性質の比較を行ったところ、環状ゲノムで必然的に生じる2量体ゲノム(線状ゲノムでは起こらない)を単量体に変換するdifと呼ばれるシステムは、予想通り線状ゲノム株では不要であった。一方、線状ゲノムの末端の位置によって生育速度が変化した。つまり複製開始点からの両腕が同じ長さの場合だと、環状ゲノム菌と同じ生育速度を示すが、両腕の長さの違いに比例して生育が悪くなり、極端に異なると菌は生存できなかった。一方、線状ゲノムの両末端は、分裂直後は細腹の両極に位置することが判明した。今後、環状から線状へのゲノムの変換の瞬間を動的に捉えることで、細菌ゲノムの全体構造の特性を明かにしたい。この線状ゲノム大腸菌を作成するには、大腸菌に感染する溶原化ファージのN15と呼ばれる溶原化ウイルスを利用した。このファージは大腸菌内で線状DNAの状態で溶原化する。以上の解析から、自然界においても、大腸菌に溶原化したN15ファージのゲノム線状化システムを介して線状ゲノムの大腸菌が生まれてもなんら不思議でないと推察された。

The animals and plants have a linear shape, and bacteria have a partial exception except for a circular shape. The reason for this is to divide and divide. This mystery is clear, and we are beginning to succeed in this particular study period, when E. coli is circular and linear. The terminal part of the DNA is divided into two parts. The surface of the bacteria is white and the shape of the bacteria is circular. A comparison of the properties of a single substance is made between a linear substance and a cyclic substance. The position of the end of a square, linear shape changes the fertility rate. The reproduction start point is different from that of the original one. The reproduction speed is different from that of the original one. The reproduction speed is different from that of the original one. A square, linear shape, the end of the line, the split straight back, the thin belly and the pole position are determined. From now on, the characteristics of the whole structure of the ring shape and the change of the instantaneous movement of the bacteria will be clarified. This line of coliform bacteria is used for lysogenesis. The state of linear DNA in E. coli is lysogenic. The above analysis, nature, Escherichia coli lysogenesis, N15, and the use of linear transformation of the system, linear transformation of the system, Escherichia coli production, and other factors.