マイクロアレイによる肺癌のメチル化網羅的解析と診断・治療のターゲットの検討

利用微阵列综合分析肺癌甲基化并考虑诊断和治疗靶点

• 批准号: 20012009
• 负责人: 畑田 出穂
• 金额: $ 7.17万
• 依托单位: Gunma University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20012009/
• 关键词: エピジェネティクス; メチル化; マイクロアレイ; miRNA; DNAメチル化

DNAメチル化をはじめとするエピジェネティクな変化は、癌化において癌抑制遺伝子の不活性化などをとおし重要な働きをしている。申請者らはこれまでにマイクロアレイを用いたDNAメチル化の網羅的解析技術を用いて肺癌でメチル化の変化を示す遺伝子をみいだしてきている。これらにはmiR-29などをはじめmicroRNA(miRNA)がコードされる領域が多く含まれている。miRNAと癌との関連は近年、重要な話題のひとつであるとともに、それが小分子であることから治療への可能性を秘めた注目すべき研究対象である。しかしながら逆に不安定な小分子のRNAであるがゆえ臨床サンプルを用いた研究、診断の対象としてむつかしい。そこで本研究ではmiRNA自体ではなく、それをコードする安定なDNAのメチル化を対象として網羅的解析をおこなった。miRNAコード領域の上流25kbを含むアレイを用いて解析をおこなったところmiR-29をはじめ多くの領域で癌においてメチル化の変化がおこっていていることがわかり、癌におけるmiRNA解析の有用なツールとなることがわかった。

DNA メ チ ル change を は じ め と す る エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ク な - は and cancerization に お い て cancer inhibition of heritage 伝 の son not activeness な ど を と お し important な 働 き を し て い る. Applicants ら は こ れ ま で に マ イ ク ロ ア レ イ を with い た DNA メ チ analytical technology of ル の snare を with い て lung cancer で メ チ ル change の variations change を shown す heritage 伝 son を み い だ し て き て い る. こ れ ら に は miR - 29 な ど を は じ め micrornas (miRNA) が コ ー ド さ れ が る field contains many く ま れ て い る. Micrornas と carcinoma と の masato even は topic in recent years, important な の ひ と つ で あ る と と も に, そ れ が small molecule で あ る こ と か ら treatment へ の possibility を secret め た attention す べ き research like で seaborne あ る. し か し な が ら inverse に unrest な small molecule の RNA で あ る が ゆ え clinical サ ン プ ル を with い た research, diagnosis の like と seaborne し て む つ か し い. そ こ で this study で は micrornas autologous で は な く, そ れ を コ ー ド す る settle な DNA の メ チ ル change を like と seaborne し て snare parsing を お こ な っ た. Micrornas コ ー の high-class ド field contains 25 KB を む ア レ イ を with い て parsing を お こ な っ た と こ ろ miR - 29 を は じ め more く の field で carcinoma に お い て メ チ ル change の variations change が お こ っ て い て い る こ と が わ か り, cancer に お け る micrornas parsing の useful な ツ ー ル と な る こ と が わ か っ た.

项目成果

Methyl-CpG targeted recruitment of p300 reactivates tumor suppressor genes in human cancer cells

• DOI: 10.1016/j.bbrc.2009.01.010
• 发表时间: 2009-02-20
• 期刊: BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
• 影响因子: 3.1
• 作者: Fukushige, Shinichi;Kondo, Emiko;Horii, Akira
• 通讯作者: Horii, Akira

Profiling of DNA methylation targets

DNA 甲基化靶标分析

• 发表时间: 2008
• 作者: Aoyagi T;et al.;Shizuo Akira;T.Matsumoto;Hatada I
• 通讯作者: Hatada I

A comparative analysis of the transcriptome and signal pathways in hepatic differentiation of human adipose mesenchymal stem cells

• DOI: 10.1111/j.1742-4658.2008.06287.x
• 发表时间: 2008-03-01
• 期刊: FEBS JOURNAL
• 影响因子: 5.4
• 作者: Yamamoto, Yusuke;Banas, Agnieszka;Ochiya, Takahiro
• 通讯作者: Ochiya, Takahiro

Astrocyte-specific genes are generally demethylated in neural precursor cells prior to astrocytic differentiation.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0003189
• 发表时间: 2008-09-11
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Hatada I;Namihira M;Morita S;Kimura M;Horii T;Nakashima K
• 通讯作者: Nakashima K

Dicer is required for maintaining adult pancreas.

维护成年胰腺需要迪切尔。

• DOI: 10.1371/journal.pone.0004212
• 发表时间: 2009
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Morita S;Hara A;Kojima I;Horii T;Kimura M;Kitamura T;Ochiya T;Nakanishi K;Matoba R;Matsubara K;Hatada I
• 通讯作者: Hatada I