プロモーターメチル化アレイによる肺癌のゲノムワイドなエピジェネティク解析
使用启动子甲基化阵列对肺癌进行全基因组表观遗传学分析
基本信息
- 批准号:18012010
- 负责人:
- 金额:$ 6.27万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2006
- 资助国家:日本
- 起止时间:2006 至 2007
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
DNAメチル化をはじめとするエピジェネティクな変化は癌抑制遺伝子の不活性化など癌化において重要な働きをしている。そこで癌におけるメチル化の変化を網羅的に調べることは重要である。我々はMIAMI法と呼ばれるマイクロアレイを用いたメチル化の網羅的解析法を開発してきた。この方法ではメチル化感受性制限酵素Hpa IIと、そのメチル化非感受性のアイソシゾマーのMsp Iを用いてメチル化を正確に検出する。我々は、この方法を用いて肺癌の網羅的解析をおこなった。その結果、未分化型の癌でよりメチル化している遺伝子の多いことや、マイクロRNAをコードする領域の近傍においてメチル化の変化がよくみられることがわかった。また予後不良に関連したメチル化も多数みいだすことができた。それらの中にはEpithelial-Mesenchymal Transition(EMT;上皮間葉移行)に関与するものもいくつか含まれていた。上皮間葉移行とは1980年代初めにElizabeth Hayらが提唱した、上皮細胞が間葉系様細胞に形態変化する現象であり、初期胚発生における原腸陥入、神経提細胞の運動や器官形成過程特に、心臓や腎臓また口蓋形成での重要性がこれまでに明らかとなっている。一方、EMTの獲得が運動性の充進や細胞外基質の蓄積をもたらすことから、癌細胞の浸潤や線維症との関連も示唆されている。今後、これらの遺伝子の肺癌におけるはたらきを明らかにすることにより、治療や診断への発展が期待される。
DNA メ チ ル change を は じ め と す る エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ク な variations change は cancer inhibition of heritage 伝 の son not activeness な ど canceration に お い て important な 働 き を し て い る. Youdaoplaceholder0 で で the に modulation of the におけるメチ transformation of the を net of the cancer におけるメチ を is べる べる と と である is である である is である である is と is である is である is important である. I 々 は と MIAMI method called ば れ る マ イ ク ロ ア レ イ を with い た メ チ ル の snare of analytic method を open 発 し て き た. こ の way で は メ チ ル change sensitivity limit enzyme Hpa II と, そ の メ チ ル change of susceptibility の ア イ ソ シ ゾ マ ー の Msp I を with い て メ チ ル change を right に 検 out す る. I use the 々 and <s:1> <s:1> method を to analyze the <s:1> て lung cancer <s:1> snare をお and なった なった なった. そ の results, undifferentiated type の carcinoma で よ り メ チ ル change し て い る posthumous son 伝 の more い こ と や, マ イ ク ロ RNA を コ ー ド す の る field near alongside に お い て メ チ ル change の variations change が よ く み ら れ る こ と が わ か っ た. Youdaoplaceholder0 gives the subsequent adverse に association <s:1> たメチ たメチ に to <s:1> and <s:1> to <s:1> majority み だす とがで とがで とがで た た た. In そ れ ら の に は Epithelial - Mesenchymal Transition (EMT; Epithelial Mesenchymal Transition) に masato and す る も の も い く つ か containing ま れ て い た. Epithelial-mesenchymal transition と と early 1980s めにElizabeth Hay ら が mention sing し た, epithelial cells between が leaf is others に morphology variations す る phenomenon で あ り, born in the early embryo 発 に お け る archenteron 陥 into cells, god 経 の movement や organ formation, に is crucial, the heart や renal viscera ま た flap forming で の importance が こ れ ま で に Ming ら か と な っ て い る. Side, EMT の get が motility の fill with や accumulation of extracellular matrix の を も た ら す こ と か ら, cancer cells の infiltrating や line d と の masato even も in stopping さ れ て い る. Son in the future, こ れ ら の heritage 伝 の lung cancer に お け る は た ら き を Ming ら か に す る こ と に よ り, treatment や diagnosis へ の 発 exhibition が expect さ れ る.
项目成果
期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
MeCP2-dependent repression of an imprinted miR-184 released by depolarization
- DOI:10.1093/hmg/ddn011
- 发表时间:2008-04-15
- 期刊:
- 影响因子:3.5
- 作者:Nomura, Tasuku;Kimura, Mika;Hatada, Izuho
- 通讯作者:Hatada, Izuho
One Argonaute family member, Eif2c2 (Agog), is essential for development and appears not to be involved in DNA methylation.
Argonaute 家族成员之一 Eif2c2 (Agog) 对于发育至关重要,并且似乎不参与 DNA 甲基化。
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Morita S;Horii T;Kimura M;Goto Y;Ochiya T & Hatada I^*.
- 通讯作者:Ochiya T & Hatada I^*.
Genomic imprinting in Dicerl-hypomorphic mice.
Dicerl 亚形小鼠的基因组印记。
- DOI:
- 发表时间:2006
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Fukasawa M;Morita S;Kimura M;Horii T;Ochiya T;Hatada I
- 通讯作者:Hatada I
Geome-wide demethylation during neural differentiation of P19 embryonal carcinoma cells
P19胚胎癌细胞神经分化过程中全基因组去甲基化
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hatada I,Morita S;Kimura M;Horii T;Yamashita R & Nakai K
- 通讯作者:Yamashita R & Nakai K
One Argonaute family member, Eif2c2 (Ago2), is essential for development and appears not to be involved in DNA methylation
- DOI:10.1016/j.ygeno.2007.01.004
- 发表时间:2007-06-01
- 期刊:
- 影响因子:4.4
- 作者:Morita, Sumiyo;Horii, Takuro;Hatada, Izuho
- 通讯作者:Hatada, Izuho
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畑田 出穂其他文献
KMT2欠損によるエピゲノム異常はヒト子宮内膜がん細胞で上皮関連遺伝子の発現を障害する
KMT2缺陷引起的表观基因组异常损害人子宫内膜癌细胞中上皮相关基因的表达
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小林 良祐;川端 麗香;杉山 真言;横堀 武彦;森田 純代;堀居 拓郎;西山 正彦;畑田 出穂 - 通讯作者:
畑田 出穂
エピゲノム改変動物を用いたFibroblast growth factor 21(FGF21)遺伝子DNAメチル化の機能的意義解明
使用表观基因组修饰动物阐明成纤维细胞生长因子 21 (FGF21) 基因 DNA 甲基化的功能意义
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
辻本 和峰;橋本 貢士;榛澤 望;川堀 健一;袁 勲梅;長岡 勇也;仁科 博史;畑田 出穂;山田 哲也;小川 佳宏 - 通讯作者:
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DOHaD 学説とエピゲノム記憶
DOHaD理论和表观基因组记忆
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
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- 作者:
辻本 和峰;橋本 貢士;榛澤 望;川堀 健一;袁 勲梅;長岡 勇也;仁科 博史;畑田 出穂;山田 哲也;小川 佳宏;橋本貢士 - 通讯作者:
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2ステップ法によるfloxマウス作製支援の状況と効率化に向けた試み
采用两步法生产flox小鼠的现状及提高效率的尝试
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小林 良祐;堀居 拓郎;末友 恵理子;木村 美香;森田 純代;畑田 出穂 - 通讯作者:
畑田 出穂
CRISPR/dCas9 系による Fibroblast growth factor 21 遺伝子特異的 DNA 脱メチル化の導入
使用 CRISPR/dCas9 系统引入成纤维细胞生长因子 21 基因特异性 DNA 去甲基化
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
辻本 和峰;橋本 貢士;榛澤 望;川堀 健一;袁 勲梅;長岡 勇也;仁科 博史;畑田 出穂;山田 哲也;小川 佳宏;橋本貢士;Koshi Hashimoto;橋本貢士 - 通讯作者:
橋本貢士
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- 资助金额:
$ 6.27万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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- 批准号:
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- 资助金额:
$ 6.27万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists