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プロモーターメチル化アレイによる肺癌のゲノムワイドなエピジェネティク解析

プロモーターメチル化アレイによる肺癌のゲノムワイドなエピジェネティク解析
使用启动子甲基化阵列对肺癌进行全基因组表观遗传学分析
批准号:
18012010
负责人:
畑田 出穂
金额:
$6.27万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007

项目摘要

项目成果

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DNAメチル化をはじめとするエピジェネティクな変化は癌抑制遺伝子の不活性化など癌化において重要な働きをしている。そこで癌におけるメチル化の変化を網羅的に調べることは重要である。我々はMIAMI法と呼ばれるマイクロアレイを用いたメチル化の網羅的解析法を開発してきた。この方法ではメチル化感受性制限酵素Hpa IIと、そのメチル化非感受性のアイソシゾマーのMsp Iを用いてメチル化を正確に検出する。我々は、この方法を用いて肺癌の網羅的解析をおこなった。その結果、未分化型の癌でよりメチル化している遺伝子の多いことや、マイクロRNAをコードする領域の近傍においてメチル化の変化がよくみられることがわかった。また予後不良に関連したメチル化も多数みいだすことができた。それらの中にはEpithelial-Mesenchymal Transition(EMT;上皮間葉移行)に関与するものもいくつか含まれていた。上皮間葉移行とは1980年代初めにElizabeth Hayらが提唱した、上皮細胞が間葉系様細胞に形態変化する現象であり、初期胚発生における原腸陥入、神経提細胞の運動や器官形成過程特に、心臓や腎臓また口蓋形成での重要性がこれまでに明らかとなっている。一方、EMTの獲得が運動性の充進や細胞外基質の蓄積をもたらすことから、癌細胞の浸潤や線維症との関連も示唆されている。今後、これらの遺伝子の肺癌におけるはたらきを明らかにすることにより、治療や診断への発展が期待される。
期刊论文(13)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1093/hmg/ddn011
发表时间: 2008-04-15
期刊: HUMAN MOLECULAR GENETICS
影响因子: 3.5
作者: [Nomura, Tasuku, Kimura, Mika, Hatada, Izuho]
通讯作者: Hatada, Izuho
One Argonaute family member, Eif2c2 (Agog), is essential for development and appears not to be involved in DNA methylation.
Argonaute 家族成员之一 Eif2c2 (Agog) 对于发育至关重要,并且似乎不参与 DNA 甲基化。
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Genomics. 89
影响因子: --
作者: [Morita S, Horii T, Kimura M, Goto Y, Ochiya T & Hatada I^*.]
通讯作者: Ochiya T & Hatada I^*.
Genomic imprinting in Dicerl-hypomorphic mice.
Dicerl 亚形小鼠的基因组印记。
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Cytogenet Genome Res. 113(1-4)
影响因子: --
作者: [Fukasawa M, Morita S, Kimura M, Horii T, Ochiya T, Hatada I]
通讯作者: Hatada I
Geome-wide demethylation during neural differentiation of P19 embryonal carcinoma cells
P19胚胎癌细胞神经分化过程中全基因组去甲基化
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: J Hum Genet 53
影响因子: --
作者: [Hatada I,Morita S, Kimura M, Horii T, Yamashita R & Nakai K]
通讯作者: Yamashita R & Nakai K
12
    KMT2変異子宮体癌の脆弱性を狙い撃つ革新的複合免疫療法の開発
    • 批准号:
      24K02582
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.81万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      畑田 出穂
    • 依托单位:
    網羅的エピゲノムデータのモチーフ解析によるmiRNAの転写制御への関与の検討
    • 批准号:
      20016002
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $5.44万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      畑田 出穂
    • 依托单位:
    マイクロアレイによる肺癌のメチル化網羅的解析と診断・治療のターゲットの検討
    • 批准号:
      20012009
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $7.17万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      畑田 出穂
    • 依托单位:
    脱メチル化ターゲット配列データベースの作成と共通モチーフの解明
    • 批准号:
      18016003
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.8万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      畑田 出穂
    • 依托单位:
    海外基金