DNAチップを用いたハイスループットなメチル化検出システム

使用DNA芯片的高通量甲基化检测系统

• 批准号: 15023211
• 负责人: 畑田 出穂
• 金额: $ 2.37万
• 依托单位: Gunma University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15023211/
• 关键词: メチル化; 癌抑制遺伝子; エピジェネティク; 癌; マイクロアレイ

近年、様々な癌抑制遺伝子や癌関連遺伝子が異常なメチル化により不活性化されることが報告され、癌化においてメチル化をはじめとするエピジェネティクな変化の重要性が認識されるようになってきた。そこで癌においてエピジェネティクな変化の網羅的解析法の開発が必要とされている。我々はこれまでにDNAチップを用いたハイスループットなゲノムDNAのメチル化解析法-Methylation AmplificationDNA Chip(MAD)法を開発した。この方法ではゲノム中のメチル化された部位を特異的に増幅しDNAチップにハイブリダイズすることによりメチル化を検出する。今回、この方法の改良により汎用化、実用化をはかった。この方法は非常に効率良く、感度が高いメチル化検出法であることがわかった。またメチル化の変化は発現量の関係ないので非常に低発現量の遺伝子への適用も可能であると考えられる。用いる制限酵素を4塩基認識のものにしたためほぼすべての遺伝子への適用が可能になった。そこで現在、1万種類の遺伝子を固定したチップを作成を予定している。また従来考えられていたより癌で高メチル化になっている遺伝子の割合が高いこともわかった。これはチップに固定した遺伝子が癌抑制遺伝子および癌抑制遺伝子となり得る遺伝子であることによるのかもしれない。すべての癌細胞で共通してメチル化されている遺伝子のほとんどは肺癌でLOHが報告されているローカスと一致していることは、このようなアプローチにより発癌に関与する遺伝子を同定できることを示唆している。

In recent years, others 々 な carcinoma inhibition but 伝 son や masato even heritage 伝 child abnormal が な メ チ ル change に よ り not activeness さ れ る こ と が report さ れ, canceration に お い て メ チ ル change を は じ め と す る エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ク な - the importance が の さ れ る よ う に な っ て き た. Youdaoplaceholder0 が で cancer にお てエピジェネティ てエピジェネティ な な analytical method for the development of な necessary とされて る る る る. I 々 は こ れ ま で に DNA チ ッ プ を with い た ハ イ ス ル ー プ ッ ト な ゲ ノ ム DNA の メ チ ル resolve chromatography - Methylation AmplificationDNA Chip method (MAD) を open 発 し た. こ の way で は ゲ ノ ム in の メ チ ル change さ れ を た parts of specific に raised し DNA チ ッ プ に ハ イ ブ リ ダ イ ズ す る こ と に よ り メ チ ル change を 検 out す る. This time, the <s:1> <s:1> method <e:1> is improved to generalize the によ and make it practical: を った った った った. The <s:1> <s:1> method <e:1> is very に, has a good く and a high が sensitivity, and is a <s:1> メチ and 検 output method である とがわ and った った. The relationship between the frequency of またメチ に and the frequency of に is な. The frequency of <s:1> is で. The frequency of で is very に. The frequency of 伝 is へ. The applicable frequency of <s:1> may be であると. The production of the を4 base of the restricted enzyme by る る recognizes the <s:1> <s:1> <s:1> に たためほぼすべて たためほぼすべて たためほぼすべて 伝, the 伝 seed へ, the が applicable が, possible になった. Youdaoplaceholder0 を で で now, 10,000 kinds of cultural heritage 伝 を fixed <s:1> たチップを are made into を designated て て る る る る. Examine え ま た 従 ら れ て い た よ り carcinoma で high メ チ ル change に な っ て い る heritage 伝 son の cut and high が い こ と も わ か っ た. こ れ は チ ッ プ に fixed し た heritage 伝 child が cancer inhibition but 伝 お よ び cancer inhibition of heritage 伝 son と な り have る heritage 伝 son で あ る こ と に よ る の か も し れ な い. す べ て の cancer common で し て メ チ ル change さ れ て い る posthumous son 伝 の ほ と ん ど は lung cancer で LOH が report さ れ て い る ロ ー カ ス と consistent し て い る こ と は, こ の よ う な ア プ ロ ー チ に よ り 発 carcinoma に masato and す る heritage 伝 を son be で き る こ と を in stopping し て い る.

项目成果

尾畑やよい, 河野友宏, 畑田出穂: "生殖細胞の再プログラム化"実験医学増刊 細胞の万能性と再プログラム化. 21・8. 117-123 (2003)

小田弥生、河野智博、旗田伊豆穗：“生殖细胞的重编程”实验医学特别版细胞多功能性和重编程。 117-123（2003）。