DNAチップを用いたハイスループットなメチル化検出システム
DNAチップを用いたハイスループットなメチル化検出システム
批准号:
15023211
负责人:
畑田 出穂
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 --
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英文摘要
近年、様々な癌抑制遺伝子や癌関連遺伝子が異常なメチル化により不活性化されることが報告され、癌化においてメチル化をはじめとするエピジェネティクな変化の重要性が認識されるようになってきた。そこで癌においてエピジェネティクな変化の網羅的解析法の開発が必要とされている。我々はこれまでにDNAチップを用いたハイスループットなゲノムDNAのメチル化解析法-Methylation AmplificationDNA Chip(MAD)法を開発した。この方法ではゲノム中のメチル化された部位を特異的に増幅しDNAチップにハイブリダイズすることによりメチル化を検出する。今回、この方法の改良により汎用化、実用化をはかった。この方法は非常に効率良く、感度が高いメチル化検出法であることがわかった。またメチル化の変化は発現量の関係ないので非常に低発現量の遺伝子への適用も可能であると考えられる。用いる制限酵素を4塩基認識のものにしたためほぼすべての遺伝子への適用が可能になった。そこで現在、1万種類の遺伝子を固定したチップを作成を予定している。また従来考えられていたより癌で高メチル化になっている遺伝子の割合が高いこともわかった。これはチップに固定した遺伝子が癌抑制遺伝子および癌抑制遺伝子となり得る遺伝子であることによるのかもしれない。すべての癌細胞で共通してメチル化されている遺伝子のほとんどは肺癌でLOHが報告されているローカスと一致していることは、このようなアプローチにより発癌に関与する遺伝子を同定できることを示唆している。
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科研奖励(0)
会议论文
尾畑やよい, 河野友宏, 畑田出穂: "生殖細胞の再プログラム化"実験医学増刊 細胞の万能性と再プログラム化. 21・8. 117-123 (2003)
小田弥生、河野智博、旗田伊豆穗:“生殖细胞的重编程”实验医学特别版细胞多功能性和重编程。 117-123(2003)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
KMT2変異子宮体癌の脆弱性を狙い撃つ革新的複合免疫療法の開発
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批准号:24K02582
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2024
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
網羅的エピゲノムデータのモチーフ解析によるmiRNAの転写制御への関与の検討
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批准号:20016002
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.44万
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财政年份:2008
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
マイクロアレイによる肺癌のメチル化網羅的解析と診断・治療のターゲットの検討
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批准号:20012009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.17万
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财政年份:2008
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
プロモーターメチル化アレイによる肺癌のゲノムワイドなエピジェネティク解析
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批准号:18012010
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$6.27万
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财政年份:2006
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
脱メチル化ターゲット配列データベースの作成と共通モチーフの解明
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批准号:18016003
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.8万
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财政年份:2006
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
卵胞培養系を用いたハイスループット遺伝子機能解析
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批准号:16011205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.71万
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财政年份:2004
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
成長期卵母細胞におけるSETドメインを持つ遺伝子の網羅的解析
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批准号:15011204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2003
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
インプリンティングを指標とした糖尿病関連遺伝子の検索
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批准号:13204009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2001
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
インプリンティングを指標とした癌関連遺伝子の組織的単離法
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批准号:12213020
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.69万
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财政年份:2000
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
Microarrayを利用したDNAメチル化のゲノムスキャンニング
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批准号:12024202
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2000
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
インプリンティンブを指標とした糖尿病関連遺伝子の検索
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批准号:12204028
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
インプリンティングを利用した癌抑制遺伝子の組織的単離法
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批准号:11138212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1999
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
インプリンティングの分子機構の解明
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批准号:11780487
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1999
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
X染色体不活性化をおこなう機能的RNA-Xistの標的の探索
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批准号:11155203
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1999
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
サイクリン依存性キナーゼインヒビターp57KIP2の小児癌への関与の検討
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批准号:08264247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1996
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
サイクリン依存性キナーゼインヒビターp57KIP2の小児癌への関与の検討
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批准号:08264247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1996
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
遺伝的刷り込み現象を示す遺伝子SP2のトランスジェニックマウスによる解析
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批准号:06780572
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
ヒト肝臓癌における発癌遺伝子の活性化機構の分子生物学的研究
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批准号:01790605
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (Research Fellowship)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1989
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负责人:畑田 出穂
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依托单位:
海外基金