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Microarrayを利用したDNAメチル化のゲノムスキャンニング

Microarrayを利用したDNAメチル化のゲノムスキャンニング
使用微阵列对 DNA 甲基化进行基因组扫描
批准号：
12024202
负责人：
畑田 出穂
金额：
$1.92万
依托单位：
Gunma University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2000 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12024202/
关键词：
メチル化MicroarrayDNAチップゲノム

项目摘要

项目成果

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DNAのメチル化すなわちシトシンの5位のメチル化による遺伝子発現抑制は発生、分化、癌化、ゲノムインプリンティング、X染色体の不活性化など様々な重要な生物学的現象に関与していることがわかってきている。しかしながらメチル化による制御がどのような遺伝子、細胞、時期に起こっているかを網羅的に解析し、生物学的現象を統合的に理解しようという試みはいまだなされていない。全ゲノムの塩基配列決定が終了しつつある現在、どのようにして特定の細胞で特定の時期に特定の遺伝子にのみに発現が限られ、発生分化が進んでいくかを知ることが次の課題となってきている。従って発生分化の各ステージにおいてメチル化を網羅的に調べ、どのような遺伝子が発現抑制されるかを調べることは重要である。申請者は以前からゲノムのメチル化の網羅的解析が重要であると考え、以前からゲノムの2次元電気泳動法を用いたRestriction Landmark Genome Scannning法を開発し研究に用いてきた。しかしこの方法は操作が複雑なため汎用性に欠ける欠点があった。そこで申請者、汎用性の高い方法としてDNAチップを用いたメチル化の網羅的解析法を開発を試み成功した。この方法は簡単に述べるとゲノム中のメチル化されているSmaI認識部位のみを増幅、蛍光標識しDNAチップ上に固定したクローン化されたSmaI断片とハイブリダイズすることにより、メチル化されているSmaI認識部位を検出する技術である。これから、この方法を用いて、発生、分化などにおける遺伝子のメチル化の変化を網羅的に解析し、統合的に理解することができる。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Schwienbacher C: "Abnormal RNA expression of 11p15 imprinted genes and kidney developmental genes in Wilms' tumor"Cancer Res.. 60. 1521-1525 (2000)
Schwienbacher C：“肾母细胞瘤中 11p15 印记基因和肾脏发育基因的异常 RNA 表达”Cancer Res.. 60. 1521-1525 (2000)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Hatada I: "Genomic imprinting and Beckwith-Wiedemann syndrome"Histol Histopathol. 15. 309-312 (2000)
Hatada I：“基因组印记和 Beckwith-Wiedemann 综合征”Histol Histopathol。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
KMT2変異子宮体癌の脆弱性を狙い撃つ革新的複合免疫療法の開発
  • 批准号：
    24K02582
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.81万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    畑田 出穂
  • 依托单位：
    Gunma University
網羅的エピゲノムデータのモチーフ解析によるmiRNAの転写制御への関与の検討
  • 批准号：
    20016002
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $5.44万
  • 财政年份：
    2008
  • 负责人：
    畑田 出穂
  • 依托单位：
    Gunma University
マイクロアレイによる肺癌のメチル化網羅的解析と診断・治療のターゲットの検討
  • 批准号：
    20012009
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $7.17万
  • 财政年份：
    2008
  • 负责人：
    畑田 出穂
  • 依托单位：
    Gunma University
プロモーターメチル化アレイによる肺癌のゲノムワイドなエピジェネティク解析
  • 批准号：
    18012010
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $6.27万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    畑田 出穂
  • 依托单位：
    Gunma University
国内基金
海外基金
基于标准样品的Microarray与RNA-seq噪声分析与消除
  • 批准号：
    31601085
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    18.0万元
  • 批准年份：
    2016
  • 负责人：
    郁颖
  • 依托单位：
    复旦大学
用microarray技术和表达序列标签（EST）技术鉴定Bt水稻对稻田蜘蛛优势种群生存的影响
  • 批准号：
    31272339
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    81.0万元
  • 批准年份：
    2012
  • 负责人：
    王智
  • 依托单位：
    湖南农业大学