ゲノムBAC-DNAマイクロアレイによる疾患関連遺伝子の網羅的・高精度な解析

使用基因组 BAC-DNA 微阵列全面且高度准确地分析疾病相关基因

• 批准号: 15012248
• 负责人: 村山 裕治
• 金额: $ 4.1万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15012248/
• 关键词: 遺伝子; 癌; ゲノム; マイクロアレイ; CGH; LOH; 染色体; BAC

染色体の(部分)増幅・欠失による癌や遺伝病、各種症候群などの原因関連領域を迅速かつ網羅的に解明するBAC-DNAマイクロアレイを作製することを目指して、所属研究室では慶應BACライブラリーよりランダムにクローンの末端シーケンスを決定し、ヒトゲノム完成シーケンス上へのマッピングを行っている。現在までに、8500クローンのマッピングが完了し、全ゲノムの約3分の1がカバーされている。本研究ではWilliam症候群(7q11.23;約1.6Mb欠失)の約3Mbにおける領域中で、このマッピングされたクローンの配置を解析したところ、14クローン(平均長150kb)が確認され、クローン同士の重なりを考慮しても約2分の1の領域をカバーしていた。現在、Smith-Magenis症候群(17p11.2;欠失)、Prader-Willi症候群(15q11-13;欠失)、DiGeorge症候群(22q11.2;欠失)の各領域においてもクローンの配置を詳細に解析している。一方、独自に設計したアダプターを用いてBACクローンDNAをPCRで均一に増幅する方法を確立し、21番染色体をカバーする258個のBACクローンの増幅を終え、現在マイクロアレイを作製中である。また、シグナル検出上の課題として感度やダイナミックレンジの改善を目指した。ニトロセルロース膜固定化スライドガラス上にBAC-DNAを固定したところ、高いS/N比で検出する方法を確立することができた。さらに、金属粒子を用いた標識法を導入することにより、蛍光色素を使う方法と比べ高感度の検出を可能にした。その結果一桁低いプローブ濃度でも同等のS/N比のシグナルを得ることができた。

Chromosomal abnormalities (partial) are missing. The cause of each syndrome is cancer. The cause of the disease is the cause of the disease. In the field, there is a rapid access to the web. The BAC-DNA is used. The target is the target, the laboratory is responsible for the BAC, and the terminal is responsible for the determination. Please tell me that you have completed your visit and that you have completed your visit. At present, 8500 per cent of the time is over, and the whole price is about 3 minutes. In this study, William syndrome (7q11.23; about 1.6Mb deficiency) was analyzed in the field of 3Mb syndrome, 14 years old (average length of 150kb) was confirmed, and the number of participants in the field was about 2 percent. At present, Smith-Magenis syndrome (17p11.2; deficiency), Prader-Willi syndrome (15q11-13; deficiency), DiGeorge syndrome (22q11.2; deficiency). On the one hand, the device was designed independently, using the uniform BAC PCR method to make sure that it was registered. There were 258 BAC images on 21 chromosomes, which are now in the process of being checked. Please make sure that you can improve your vision and improve your vision. In this paper, the membrane immobilization method is used to determine the accuracy of the membrane immobilization method. The film is immobilized and the BAC-DNA is fixed on the membrane. The method is more likely to be more sensitive than the high sensitivity by using the "header" method, the "light pigment" and the "light pigment". The results show that the average temperature is lower than that of low temperature, and the same temperature is better than that of low temperature.