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ゲノムBAC-DNAマイクロアレイによる癌関連領域の網羅的かつ高精度な解析

使用基因组 BAC-DNA 微阵列对癌症相关区域进行全面且高度准确的分析

基本信息

批准号：
15790728
负责人：
村山裕治
金额：
$ 1.98万
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15790728/
关键词：
遺伝子癌ゲノムマイクロアレイ CGH LOH 染色体 BAC

项目摘要

独自に構築した慶應BACライブラリーより7809クローンを用いて、全ゲノムの約3分の1をほぼ均等にカバーするBAC-DNAマイクロアレイを作製した。これを1枚のスライドガラス上にtriplicateでアレイし、搭載クローン数・品質ともに国内最高級のものを作製した。また、共同研究機関(慶應義塾大学医学部外科教室)より提供を受けているがん組織(食道、胃、肝、胆嚢、膵臓、乳腺)よりがん組織バンクを構築した。これら臨床サンプルをBAC-DNAマイクロアレイを用いて解析を行ったところ、いくつかの遺伝子が、がんで特異的に増減を示していることから、現在詳細に解析中である。またこれらマイクロアレイCGHより得られたデータを判りやすく表示し、変化のあるBACクローンに含まれる遺伝子を容易に参照・解析できるアプリケーションを開発した。マイクロアレイ実験の問題点であったダイナミックレンジや感度、再現性の改善を図るため、マイクロアレイ用基盤の開発を行い、特許申請を行った(平成16年4月2日付特許出願清水信義、浅川修一、村山裕治、「担持体、物質検出用器具とその製造方法、及び検出方法」)。この技術はメンブレンタイプのサンプル支持体を用いて、蛍光色素などでデュアルカラーでの検出を可能にするもので、マイクロアレイのみならず、すべてのハイブリダイゼーションの検出方法に、RI並みの感度と複数のサンプルの同時検出を可能にするものである。

If you are alone, you should be told that you should use BAC. You should use 7809 of your money. If you want to use it, you should use it. The whole thing is about 3 minutes. One minute. One day. One minute. One minute. One day. One minute. One minute. One day. One Please tell me that you need to pay attention to the number of triplicate employees and the highest-level employees in the country. The joint research institute (Department of surgery, Department of Medicine, Yaoshu University) provides reliable tissue (esophagus, stomach, liver, bile, gallbladder, breast). This is the first time that the BAC-DNA has been parsed. This is now in the process of parsing. You need to know that you need to know that the CGH is correct, and that it is easy to read and analyze the information that you need to know if you want to read the information. Please contact us with the following questions: the sensitivity, the improvement of the quality, the use of the basic equipment, and the special application of the bank (Pingcheng, April 2, 16, paid the special license to Shimizu Shimizu, Seiichi Asakawa, Yuji Murayama, "the carrier, the method of manufacturing the equipment used for the goods, and the method of the application". In order to improve the performance of the system, the technical information system, the light pigment system, the device, the sensor, the sensitivity, the accuracy, the sensitivity, the