プロテアソームS5aサブユニットによるポリユビキチン鎖認識の立体構造学的研究
プロテアソームS5aサブユニットによるポリユビキチン鎖認識の立体構造学的研究
批准号:
15032248
负责人:
杤尾 豪人
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
プロテアソームにより認識・分解されるためのシグナルとなるポリユビキチン鎖はユビキチンのLys48とCOOH末端によるイソペプチド結合を介してポリ化する。これとは別に、機能は不明瞭であるがLys63を介するポリユビキチン化も知られている。我々は、ユビキチン化酵素群(E1、E2)を使ったin vitro酵素反応により、Lys48リンク及びLys63リンクのジユビキチン及びテトラユビキチンを調製し、NMR、ESR、X線小角散乱法によってその立体構造を解析し、これらポリ化様式の違いによる立体構造の差異を明らかにした。これらの結果をまとめて論文を発表した。ユビキチンは様々准分子と相互作用、複合体形成を行なうことにより、多用な生物学的機能を発揮することが知られているが、その分子認識の鍵となるのは、種々のユビキチン結合モチーフである。これらは、現在までに数種類が知られているが、我々はそのうちの一つ、UBA (ubiquitin associated)ドメインとユビキチンの複合体の立体構造を溶液NMR法によって決定し、分子認識機構を原子分解能で解明した。これはユビキチン-UBA複合体の最初の構造決定である。この結果については、Structure誌に発表した。また、2003年にユビキチン結合モチーフであると示唆されたVHSドメインについてもユビキチンとの結合様式を原子分解能で調べるべく研究を開始した。STAM2蛋白質のVHSドメインの試料調製を行ない、NMRを使ってユビキチンとの相互作用実験を行なった。データの解析の結果、VHSの中の、どのアミノ酸残基がユビキチンと結合するかを明らかにした。
英文摘要
プロテアソームにより認識・分解されるためのシグナルとなるポリユビキチン鎖はユビキチンのLys48とCOOH末端によるイソペプチド結合を介してポリ化する。これとは別に、機能は不明瞭であるがLys63を介するポリユビキチン化も知られている。我々は、ユビキチン化酵素群(E1、E2)を使ったin vitro酵素反応により、Lys48リンク及びLys63リンクのジユビキチン及びテトラユビキチンを調製し、NMR、ESR、X線小角散乱法によってその立体構造を解析し、これらポリ化様式の違いによる立体構造の差異を明らかにした。これらの結果をまとめて論文を発表した。ユビキチンは様々准分子と相互作用、複合体形成を行なうことにより、多用な生物学的機能を発揮することが知られているが、その分子認識の鍵となるのは、種々のユビキチン結合モチーフである。これらは、現在までに数種類が知られているが、我々はそのうちの一つ、UBA (ubiquitin associated)ドメインとユビキチンの複合体の立体構造を溶液NMR法によって決定し、分子認識機構を原子分解能で解明した。これはユビキチン-UBA複合体の最初の構造決定である。この結果については、Structure誌に発表した。また、2003年にユビキチン結合モチーフであると示唆されたVHSドメインについてもユビキチンとの結合様式を原子分解能で調べるべく研究を開始した。STAM2蛋白質のVHSドメインの試料調製を行ない、NMRを使ってユビキチンとの相互作用実験を行なった。データの解析の結果、VHSの中の、どのアミノ酸残基がユビキチンと結合するかを明らかにした。
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Auesukaree C, Homma T, Tochio H, Shirakawa M, Kaneko Y, Harashima S.: "Intracellular phosphate serves as a signal for the regulation of the PHO pathway in Saccharomyces cerevisiae."Journal of Biological Chemistry. 279,17. 17289-17294 (2004)
Auesukaree C、Homma T、Tochio H、Shirakawa M、Kaneko Y、Harashima S.:“细胞内磷酸盐在酿酒酵母中充当调节 PHO 途径的信号。”生物化学杂志。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
High-throughput construction method of expression vector of peptides for NMR study suited for isotopic labeling.
适用于同位素标记的核磁共振研究肽表达载体的高通量构建方法。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Protein Eng Des Sel 17
影响因子:
--
作者:
[Tenno, T., Goda, N., Tateishi, Y., Tochio, H., Mishima, M., Hayashi, H., Shirakawa, M., Hiroaki, H.]
通讯作者:
H.
DOI:
10.1074/jbc.m312202200
发表时间:
2004-04-23
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Auesukaree, C, Homma, T, Harashima, S]
通讯作者:
Harashima, S
DOI:
10.1111/j.1365-2443.2004.00780.x
发表时间:
2004-10-01
期刊:
GENES TO CELLS
影响因子:
2.1
作者:
[Tenno, T, Fujiwara, K, Shirakawa, M]
通讯作者:
Shirakawa, M
DOI:
10.1074/jbc.m309448200
发表时间:
2004-02-06
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Fujiwara, K, Tenno, T, Shirakawa, M]
通讯作者:
Shirakawa, M
共 7 条
受容体によるシグナルタンパク質の多量化制御の構造生物学的研究
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批准号:23K27114
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.82万
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财政年份:2024
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
Structural studies on the regulation of signal protein multimerization by receptors
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批准号:23H02421
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2023
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
Toll様受容体を介するシグナル伝達経路の構造機能解析
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批准号:18770092
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2006
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
タンパク質タグの付加による細胞内タンパク質の局在・機能変換の構造学的研究
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批准号:17028046
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2005
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
磁気共鳴イメージング法を使った生体内遺伝子発現プロファイルのための新手法の開発
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批准号:16011250
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2004
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
TLRシグナル伝達を決定するTIRドメイン間の相互作用の立体構造学的研究
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批准号:16770079
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2004
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
磁気共鳴イメージング法を使った生体内遺伝子発現プロファイルのための新手法の開発
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批准号:15011247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2003
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
磁気共鳴イメージング法を使った生体内遺伝子発現プロファイルのための新手法の開発
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批准号:14011243
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2002
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
転写伸長を制御する因子の立体構造及びRNAポリメラーゼとの相互作用の解析
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批准号:14780528
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2002
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
プロテオソームS5aサブユニットによるユビキチン様ドメイン認識の構造学的研究
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批准号:14037261
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2002
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
海外基金