TLRシグナル伝達を決定するTIRドメイン間の相互作用の立体構造学的研究
TLRシグナル伝達を決定するTIRドメイン間の相互作用の立体構造学的研究
批准号:
16770079
负责人:
杤尾 豪人
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
中文摘要
本研究では、自然免疫系のアダプター分子MyD88の細胞機能の解明を目指し、MyD88に含まれるTIRドメインの立体構造及び機能の解析を行なった。1)立体構造解析溶液NMRで立体構造決定を行なうために、^<13>C,^<15>Nで標識したMyD88 TIRドメインを調製し、各種多核多次元核磁気共鳴(NMR)の測定を行ない、これらの測定データを基に^1H,^<13>C,^<15>N核の化学シフトの帰属作業、各種三次元NOESYの解析を行ない、二次構造要素の同定と^1H間の距離情報の取得を行なった。次に、これらのデータから、立体構造計算を行なった。得られたMyD88 TIRの立体構造は、既に構造が解かれているTLR1やTLR2のTIRドメインと類似しているが、ループ部分の長さや、一部のα-ヘリックスの配向などに差異があることがわかった。2)機能解析MyD88 TIRドメインの自然免疫シグナル伝達系における機能解析を行なうべく、HEK293培養細胞系でルシフェラーゼを使ったレポーターアッセイの系を立ち上げた。コントロールのHEK293細胞では、IL-18で刺激することにより自然免疫系のシグナル伝達経路を通してNF-κBが活性化されることを確認した。その一方で、野生型のMyD88 TIRドメインを過剰発現させた場合は、そのDominant Negative効果により、IL-18刺激後のNF-κBの活性が有意に下がることも確認した。現在、立体構造情報に基づいて、種々のアミノ酸置換を導入したMyD88 TIRドメイン変異体をこの細胞に発現させて、IL-18刺激後にNF-κBの活性を測定し、どの残基がシグナル伝達に重要なのかを調べている。この他にRAW264.7細胞を使ってリポ多糖による刺激を行なうアッセイ系も確立した。
英文摘要
本研究では、自然免疫系のアダプター分子MyD88の細胞機能の解明を目指し、MyD88に含まれるTIRドメインの立体構造及び機能の解析を行なった。1)立体構造解析溶液NMRで立体構造決定を行なうために、^<13>C,^<15>Nで標識したMyD88 TIRドメインを調製し、各種多核多次元核磁気共鳴(NMR)の測定を行ない、これらの測定データを基に^1H,^<13>C,^<15>N核の化学シフトの帰属作業、各種三次元NOESYの解析を行ない、二次構造要素の同定と^1H間の距離情報の取得を行なった。次に、これらのデータから、立体構造計算を行なった。得られたMyD88 TIRの立体構造は、既に構造が解かれているTLR1やTLR2のTIRドメインと類似しているが、ループ部分の長さや、一部のα-ヘリックスの配向などに差異があることがわかった。2)機能解析MyD88 TIRドメインの自然免疫シグナル伝達系における機能解析を行なうべく、HEK293培養細胞系でルシフェラーゼを使ったレポーターアッセイの系を立ち上げた。コントロールのHEK293細胞では、IL-18で刺激することにより自然免疫系のシグナル伝達経路を通してNF-κBが活性化されることを確認した。その一方で、野生型のMyD88 TIRドメインを過剰発現させた場合は、そのDominant Negative効果により、IL-18刺激後のNF-κBの活性が有意に下がることも確認した。現在、立体構造情報に基づいて、種々のアミノ酸置換を導入したMyD88 TIRドメイン変異体をこの細胞に発現させて、IL-18刺激後にNF-κBの活性を測定し、どの残基がシグナル伝達に重要なのかを調べている。この他にRAW264.7細胞を使ってリポ多糖による刺激を行なうアッセイ系も確立した。
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DOI:
10.1203/01.pdr.0000169984.89199.69
发表时间:
2005-08-01
期刊:
PEDIATRIC RESEARCH
影响因子:
3.6
作者:
[Hashimoto, K, Kato, Z, Kondo, N]
通讯作者:
Kondo, N
DOI:
10.1016/j.bbrc.2005.06.110
发表时间:
2005-08-26
期刊:
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
影响因子:
3.1
作者:
[Takasu, H, Jee, JG, Hiroaki, H]
通讯作者:
Hiroaki, H
High-throughput construction method of expression vector of peptides for NMR study suited for isotopic labeling.
适用于同位素标记的核磁共振研究肽表达载体的高通量构建方法。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Protein Eng Des Sel 17
影响因子:
--
作者:
[Tenno, T., Goda, N., Tateishi, Y., Tochio, H., Mishima, M., Hayashi, H., Shirakawa, M., Hiroaki, H.]
通讯作者:
H.
DOI:
10.1038/nature03634
发表时间:
2005-06-16
期刊:
NATURE
影响因子:
64.8
作者:
[Baba, D, Maita, N, Shirakawa, M]
通讯作者:
Shirakawa, M
DOI:
10.1074/jbc.m309448200
发表时间:
2004-02-06
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Fujiwara, K, Tenno, T, Shirakawa, M]
通讯作者:
Shirakawa, M
共 9 条
受容体によるシグナルタンパク質の多量化制御の構造生物学的研究
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批准号:23K27114
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.82万
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财政年份:2024
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
Structural studies on the regulation of signal protein multimerization by receptors
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批准号:23H02421
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2023
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
Toll様受容体を介するシグナル伝達経路の構造機能解析
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批准号:18770092
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2006
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
タンパク質タグの付加による細胞内タンパク質の局在・機能変換の構造学的研究
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批准号:17028046
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2005
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
磁気共鳴イメージング法を使った生体内遺伝子発現プロファイルのための新手法の開発
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批准号:16011250
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2004
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
プロテアソームS5aサブユニットによるポリユビキチン鎖認識の立体構造学的研究
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批准号:15032248
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2003
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
磁気共鳴イメージング法を使った生体内遺伝子発現プロファイルのための新手法の開発
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批准号:15011247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2003
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
磁気共鳴イメージング法を使った生体内遺伝子発現プロファイルのための新手法の開発
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批准号:14011243
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2002
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
転写伸長を制御する因子の立体構造及びRNAポリメラーゼとの相互作用の解析
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批准号:14780528
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2002
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
プロテオソームS5aサブユニットによるユビキチン様ドメイン認識の構造学的研究
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批准号:14037261
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2002
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负责人:杤尾 豪人
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依托单位:
国内基金
海外基金
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分子筛催化甲醇转化中活性位动态变化机制的固体NMR研究
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批准号:22502216
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:胡敏
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依托单位:
基于NMR研究磷脂酰肌醇磷酸酶SHIP2自抑制作用的分子机制
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批准号:22504159
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:王梓
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依托单位:
NMR研究尤文肉瘤相关融合基因EWS-FLI1 RNA的可变剪接调控机制
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批准号:22504158
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:何小玲
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依托单位:
基于细胞原位固体NMR的糖转运蛋白BjSemiSWEET动态转运机制研究
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批准号:22577099
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:谢华勇
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依托单位:
适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
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批准号:JCZRYB202500181
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
基于13C NMR的黄土高原半干旱区土壤有机碳稳定性对长期保护性耕作的响应机制
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批准号:32572472
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:李玲玲
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依托单位:
新颖高灵敏F-19 NMR光化学诱导动态核极化技术开发与活细胞应用探索
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批准号:22574165
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:柴兆斐
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依托单位:
新型Hoogsteen核酸链置换反应重启G四链体过氧化物酶活性的NMR研究
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批准号:32571393
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项目类别:面上项目
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资助金额:51.00万元
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批准年份:2025
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负责人:张钠
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依托单位:
低旋磁比固体MAS NMR信号检测关键技术与方法的研究
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批准号:22574167
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:张志
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依托单位:
双金属改性分子筛催化甲烷选择性氧化反应的固体NMR研究
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批准号:22572201
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:郝全果
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依托单位: