Structure basis of maintenance DNA methylation

维持DNA甲基化的结构基础

• 批准号: 21247013
• 负责人: SHIRAKAWA Masahiro
• 金额: $ 10.48万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21247013/
• 关键词: DNAメチル化; エピジェネティック; ヒストン; X線結晶解析; NMR; エピジェネティクス; ヒストン修飾; 構造生物学

DNA methylation and histone modifications are epigenetic marks that maintain an epigenetic state in each differentiated cell. We investigated structures and functions of two key proteins in maintenance and regulation of DNA methylation patterns ; a hemi-methylated DNA binding protein, UHRF1 and one of methyl CpG binding domain proteins, MBD4. Our structural and biochemical data have shed light on a combinatorial recognition of two histone modifications by UHRF1. Furthermore our research have gained structural basis of versatile base recognition of MBD4.

DNA甲基化和组蛋白修饰是在每个分化细胞中维持表观遗传状态的表观遗传标记。我们研究了维持和调节DNA甲基化模式的两个关键蛋白的结构和功能;半甲基化DNA结合蛋白UHRF 1和甲基CpG结合结构域蛋白MBD 4。我们的结构和生化数据揭示了UHRF 1对两种组蛋白修饰的组合识别。为MBD 4的多功能碱基识别奠定了结构基础。

项目成果

Plenary Lecture

• DOI: 10.1159/000178138
• 发表时间: 2012-05
• 期刊: Journal of Diabetes Investigation
• 影响因子: 3.2

エピジェネティック制御における分子認識:DNAメチル化制御の構造生物学

表观遗传调控中的分子识别：DNA 甲基化调控的结构生物学

• 发表时间: 2010
• 期刊: 実験医学増刊
• 作者: 有吉眞理子;白川昌宏
• 通讯作者: 白川昌宏

Solution structure of a zinc-finger domain that binds to poly-ADP-ribose

• DOI: 10.1111/j.1365-2443.2009.01369.x
• 发表时间: 2010-02-01
• 期刊: GENES TO CELLS
• 影响因子: 2.1
• 作者: Isogai, Shin;Kanno, Shin-Ichiro;Shirakawa, Masahiro
• 通讯作者: Shirakawa, Masahiro

Purification, crystallization and preliminary crystallographic studies of Lys48-linked polyubiquitin chains

Lys48 连接的多聚泛素链的纯化、结晶和初步晶体学研究

• DOI: 10.1107/s1744309110018804
• 发表时间: 2010
• 期刊: Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun
• 作者: Morimoto;D.;Isogai;S.;Tenno;T.;Tochio;H.;Shirakawa;M.;Ariyoshi;M.
• 通讯作者: M.

Structural biology of epigenetic regulations and NMR observation of proteins in eukaryotic cells

表观遗传调控的结构生物学和真核细胞蛋白质的核磁共振观察

• 发表时间: 2010
• 作者: Y Kashiyam;A Yokoyama;Y Kinoshita;S Shoji;H Miyashita;T Shiratori;H Suga;K Ishikawa;A Ishikawa;I Inouye;K Ishida;D Fujinuma;K Aoki;M Kobayashi;S Nomoto;T Mizoguchi;H Tamiaki;Masahiro Shirakawa
• 通讯作者: Masahiro Shirakawa