课题基金 / 基金详情

エピジェネティクスの基本動作原理に基づくメチロームの合成

エピジェネティクスの基本動作原理に基づくメチロームの合成
基于表观遗传学基本操作原理的甲基化组合成
批准号：
22K19276
负责人：
伊藤 隆司
金额：
$4.16万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2022-06-30 至 2024-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19276/
关键词：
ゲノム編集DNAメチル化合成生物学酵母

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
出芽酵母ゲノム中にメチル化を導入（開始）し、拡張・制限・維持を行うのが本研究の挑戦である。これらを行うためのゲノム領域を出芽酵母ゲノム中に創出するために、λファージゲノム48.5 kbをそっくりそのままho遺伝子座位に挿入することを試みた。具体的には、Cas9によるゲノム編集によって、48.5 kbのλDNAを挿入しようとしたが、所期の成果を得られなかった。そこで48.5 kbを相互にオーバーラップした６つの断片に分けてPCRによって調製し、それらを同時にゲノム編集に用いることを試みた。当初、選択を容易にするべく栄養選択マーカーを持たせた形で実施して、６断片が想定された順番通りに挿入されたことを示す結果が得られた。更に、条件を最適化したところ、選択マーカーなしでのλDNAの挿入にも成功したことが示唆された。最終的には、ナノポアシーケンシングを行って、所期の通りにλDNAをゲノム中に挿入できたことを確認した。更に、導入したDNAメチル化の維持を行うために、維持メチル化酵素DNMT5の人工遺伝子の合成を行い、それらを発現する株の作成を進行中である。これらのゲノム改変を効率的に進めるために、以前に開発した遺伝子編集プラスミドシリーズを拡張し、３遺伝子座の同時編集も高い効率で進める系を確立した。
英文摘要
出芽酵母ゲノム中にメチル化を導入（開始）し、拡張・制限・維持を行うのが本研究の挑戦である。これらを行うためのゲノム領域を出芽酵母ゲノム中に創出するために、λファージゲノム48.5 kbをそっくりそのままho遺伝子座位に挿入することを試みた。具体的には、Cas9によるゲノム編集によって、48.5 kbのλDNAを挿入しようとしたが、所期の成果を得られなかった。そこで48.5 kbを相互にオーバーラップした６つの断片に分けてPCRによって調製し、それらを同時にゲノム編集に用いることを試みた。当初、選択を容易にするべく栄養選択マーカーを持たせた形で実施して、６断片が想定された順番通りに挿入されたことを示す結果が得られた。更に、条件を最適化したところ、選択マーカーなしでのλDNAの挿入にも成功したことが示唆された。最終的には、ナノポアシーケンシングを行って、所期の通りにλDNAをゲノム中に挿入できたことを確認した。更に、導入したDNAメチル化の維持を行うために、維持メチル化酵素DNMT5の人工遺伝子の合成を行い、それらを発現する株の作成を進行中である。これらのゲノム改変を効率的に進めるために、以前に開発した遺伝子編集プラスミドシリーズを拡張し、３遺伝子座の同時編集も高い効率で進める系を確立した。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
構造多型への構成的アプローチ：Cas9ニッケースとスプリントDNAによる誘導
  • 批准号：
    24K02015
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.9万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    伊藤 隆司
  • 依托单位：
    Kyushu University
選択性の高いタンパク質間相互作用制御化合物の探索技術
  • 批准号：
    20651052
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.05万
  • 财政年份：
    2008
  • 负责人：
    伊藤 隆司
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
半導体デバイスの超微細化に向けた革新的な高濃度極浅接合形成技術の創出
  • 批准号：
    19656085
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.05万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    伊藤 隆司
  • 依托单位：
    Tohoku University
生きた細胞で代謝調節を視覚化する技術
  • 批准号：
    18651094
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.24万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    伊藤 隆司
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
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