GC含量の異なる2種メタン産生菌リボソ-ム蛋白遺伝子の比較解析

两种不同GC含量产甲烷菌核糖体蛋白基因比较分析

• 批准号: 02680211
• 负责人: 水田 啓子
• 金额: --
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1990
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1990 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-02680211/
• 关键词: メタバクテリア; GC含量; リボソ-ム

当研究室では継続的にリボソ-ムに関わる業績を上げてきているが、当研究室からのを含め、多くの遺伝子解析の知見に依ると、メタバクテリアのリボソ-ム蛋白遺伝子構成は原核生物のレベルに留まっているにも関らず、発現蛋白自体は蛋白進化の真核化への著しい飛躍を既に成し遂げている(Itoh et al.1988 B.B.A.949:110;Otaka et al.1989 J Mol Evol 29:246;Itoh 1990 Eur Biochem 186:213).即ち、三大生物群は共通祖先から出たものであるが、メタバクテリア群はより真核生物に近い一群であると考えられるので、Methanobacterium thermoautotrophicum及びMethanobrevibacter arboriphilus A2を取り上げて、真核化構築機構解明に多くの手掛かりを得ることを期待するものである。M.therm.のGC含量52%、M.arbor.A2のそれは29.6%が知られているが、極めて異なる値にも関らず、予備的解析に依れば発現リボソ-ム蛋白質は極めて近いと見られるので、両者を対比させて解析することによってコドンユ-セイジ、温度耐性の問題を含ませて、原核生物ー真核生物間を結ぶ新たな知見が得られるものと2種を対象とした。先ず、夫々のリボソ-ム抽出条件が設定され、リボソ-ム及び、リボソ-ムRNA、DNAの種々の条件によるTmの測定がなされた。例えばM.arbor.リボソ-ムでは75℃に対してM.therm.では84℃を示したが、既に前者はこの温度では白濁、測定不可能であって、菌種の特性を明示した。リボソ-ム蛋白種の2DーPAGE解析条件が種々検討された。蛋白種全体配置が一枚のゲルプレイトに展開される条件では、概ね2種菌間のパタ-ンの差は殆んど認められないと判定された。これを踏まえて部分的分離度の高い条件が検討されている。条件設定が出来しだい、近似移動度のスポットからの蛋白抽出、部分配列決定が行なわれる予定である。一方2種菌夫々のDNAライブラリ-作成が準備されている。

When the research laboratory is involved in the development of a protein gene, the results of the research laboratory are improved. When the research laboratory is involved in the development of a protein gene, the knowledge of the analysis of multiple genes is improved. When the research laboratory is involved in the development of a protein gene, the protein gene composition is changed into a prokaryotic gene, and the protein gene itself is changed into a eukaryotic gene. When the research laboratory is involved in the development of a protein gene, the knowledge of a protein gene analysis is improved.(Itoh et al.1988 B.B.A.949:110;Otaka et al.1989 J Mol Evol 29:246;Itoh 1990 Eur Biochem 186:213). That is to say, the common ancestor of the three major biological groups has been selected from the group of eukaryotes, Methanobacterium thermotrophicum and Methanobacterium arboriphil A2, and the eukaryotic construction mechanism has been clarified. GC content of M.therm. 52%, M.arbor.A2 29.6%, M.arbor.A2 29.7%, M.arbor.A2 29.8%, M.arbor.A2 29.2 29.8%, M.arbor.A2 29.A2 29.8%, M.arbor.A2 29.2%, M.arbor.A2 29 Prokaryotes and eukaryotes are new to each other. The conditions for the extraction of RNA and DNA were set up and determined. For example, M.arbor. was found to be at 75℃ and M.therm. was found to be at 84℃. The former was found to be at a temperature of 75 ℃ and impossible to measure. The characteristics of the strain were clearly indicated. 2D PAGE analysis conditions for the protein species were discussed. All protein species are allocated to one or more bacteria. The conditions for development are as follows: The high resolution condition of the partial separation is discussed in this paper. Condition setting, approximate mobility, protein extraction, partial alignment, determination, etc. Two strains of bacteria were prepared for DNA purification.

项目成果

Hashimoto,T.,Otaka,E.,Mizuta,K.: "Molecular evolutionary data analysis based on the tertiary structures of proteins" Bulletin of the Biometric Soc.of Japan. 11. 91-105 (1990)

Hashimoto,T.、Otaka,E.、Mizuta,K.：“基于蛋白质三级结构的分子进化数据分析”日本生物识别协会通报。

Suzuki,K.,Hashimoto,T.,Otaka,E.: "Yeast ribosomal proteins:XI.Molecular analysis of two genes encoding YL41,an extremely small and basic ribosomal protein,from Saccharomyces cerevisiae" Current Genetics. 17. 185-190 (1990)

Suzuki,K.、Hashimoto,T.、Otaka,E.：“酵母核糖体蛋白：XI。编码 YL41（一种来自酿酒酵母的极小且基本的核糖体蛋白）的两个基因的分子分析”《当代遗传学》。