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インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発

利用体外选择法和combichem法开发超分子识别装置

基本信息

批准号：
10145254
负责人：
杉本直己
金额：
$ 1.15万
依托单位：
Konan University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1998
资助国家：
日本
起止时间：
1998 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、触媒機能を有する核酸(リボザイム)を高機能性生体分子のお手本として捉え、生体分子認識の観点から、その高次構造に及ぼす環境因子の重要性を、分子レベルで考察する。さらに、その結果に基づき、コンビナトリアルケミストリー法(ファージディスプレイ法を含む)及びインビトロ選択の手法を用いて、“情報"と“機能"をあわせもつ超機能性分子を開発することを目的とする。本年度は、DNA認識能を有する機能性ペプチドの開発に重点を置いた。タンパク質によるDNAの認識は、非常に重要な相互作用の1つである。しかしながら多数の相互作用から目的の相互作用を観測するのは一般に困難であり、タンパク質を用いたDNAの認識機構の解明は捗々しくない。一方、オリゴペプチドの化学合成法はすでに確立されており、望みのペプチドを大量に入手することが可能である。さらに、ペプチドはアミノ酸の置換や非天然アミノ酸の導入などの操作も比較的行いやすく、タンパク質の性質の解明や他の分子との相互作用を調べる上で有効である。本研究では、DNAの組換えを行うRecAタンパク質に注目し、このタンパク質のL2とへリックスG領域のアミノ酸配列(195-218領域)を持つ24残基のモデルペプチド(L2-Gペプチド)を化学合成し、このペプチドによるDNA認識能力を調べた。その結果、このペプチドは、一本鎖DNAを特異的に認識できることが明らかになった(二本鎖DNAに対してよりも結合定数にして1000倍も大きい)。また、このペプチドを利用して一本鎖DNA分離カラムの作製もできた。

This research is based on the catalytic function of nucleic acid (リボザイム) and a highly functional biological molecule. The key points in the understanding of biological molecules, the importance of higher-order structures and environmental factors, and the investigation of molecules. It's the sameトリー法(ファージディスプレイ法をincludingむ) and びインThe use of "Intelligence" and "Function" as well as the use of "super-functional molecules" and "opening" of super-functional molecules. This year, the focus of DNA understanding can be achieved through functional development. The understanding of the nature of DNA is very important and the interaction of DNA is very important. The interaction between the majority and the purpose It's difficult to understand the structure of DNA, and it's difficult to understand the structure of DNA. On the one hand, the chemical synthesis method of オリゴペチドのchemical synthesis method has been established, and it is possible to obtain a large amount of みのペプチドをすることが. Lines of comparison between さらに、ペプチドはアミノacidのreplacementやnon-natural アミノacidのimportなどのoperationもやすく, タンパク性の解clarification, や His molecule, and とのinteraction, を Adjustment, べる, でeffective, である. This study was carried out on the basis of the research on DNA group replacement, RecA タンパクquality, attention, and このタンパク性のL2とへリックスG field のアミノ acid arrangement (195 -218 field) をhold つ24 residue のモデルペプチド (L2-G ペプチド) をchemical synthesis し, このペプチドによるDNA recognition ability をadjusted べた.そのRESULT, このペプチドは, 1 lock DNAをSpecial にKnowledge できることが明らかになった(二本 lockDNAに対してよりもcombination fixed number にして1000 times large きい).また、このペプチドをUsing the して一码DNA isolation カラムのもできた.