インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
批准号:
10145254
负责人:
杉本 直己
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 --
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本研究では、触媒機能を有する核酸(リボザイム)を高機能性生体分子のお手本として捉え、生体分子認識の観点から、その高次構造に及ぼす環境因子の重要性を、分子レベルで考察する。さらに、その結果に基づき、コンビナトリアルケミストリー法(ファージディスプレイ法を含む)及びインビトロ選択の手法を用いて、“情報"と“機能"をあわせもつ超機能性分子を開発することを目的とする。本年度は、DNA認識能を有する機能性ペプチドの開発に重点を置いた。タンパク質によるDNAの認識は、非常に重要な相互作用の1つである。しかしながら多数の相互作用から目的の相互作用を観測するのは一般に困難であり、タンパク質を用いたDNAの認識機構の解明は捗々しくない。一方、オリゴペプチドの化学合成法はすでに確立されており、望みのペプチドを大量に入手することが可能である。さらに、ペプチドはアミノ酸の置換や非天然アミノ酸の導入などの操作も比較的行いやすく、タンパク質の性質の解明や他の分子との相互作用を調べる上で有効である。本研究では、DNAの組換えを行うRecAタンパク質に注目し、このタンパク質のL2とへリックスG領域のアミノ酸配列(195-218領域)を持つ24残基のモデルペプチド(L2-Gペプチド)を化学合成し、このペプチドによるDNA認識能力を調べた。その結果、このペプチドは、一本鎖DNAを特異的に認識できることが明らかになった(二本鎖DNAに対してよりも結合定数にして1000倍も大きい)。また、このペプチドを利用して一本鎖DNA分離カラムの作製もできた。
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Naoki Sugimoto: "Reaction Field for Efficient Porphyrin Metallation Catalysis Producedby Self-assembly of a Short DNA Oligonucleotide" Chemical Communications. 1533-1535 (1998)
Naoki Sugimoto:“短 DNA 寡核苷酸自组装产生的高效卟啉金属化催化反应场”化学通讯。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Naoki Sugimoto: "Effect of Cu^<2+> on the Complex Formation between a Deoxyribozyme and its Substrates" Nucleosides & Nucleotides. 17. 565-574 (1998)
Naoki Sugimoto:“Cu^<2> 对脱氧核酶及其底物之间复合物形成的影响”核苷
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Shu-ichi Nakano: "Single-stranded DNA Recognition of a 24-mer Peptide Derived from RecA Protein" Bulletin of the Chemical Society of Japan. 71. 2205-2210 (1998)
Shu-ichi Nakano:“来自 RecA 蛋白的 24 聚体肽的单链 DNA 识别”日本化学会通报。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Junji Kawakami: "In Vitro Selection of Aptamers that Recognize a Monosaccharide" Analytica Chimica Acta. 365. 95-100 (1998)
Junji Kawakami:“识别单糖的适体的体外选择”Analytica Chimica Acta。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Naoki Sugimoto: "Effect of Cation Concentration on Duplex Stability of Nucleic Acids with Unnatural Base Pairs" Nucleic Acids Res.,Symp.Series. 39. 121-122 (1998)
Naoki Sugimoto:“阳离子浓度对非天然碱基对核酸双链体稳定性的影响”核酸研究,症状系列。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
Quantitative prediction of nucleic acid structures and functions affected by spaciotemporal environmental factors in cells
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批准号:22H04975
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$126.3万
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财政年份:2022
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
Quantitative analysis of rRNA foding triggered by specific molecular crowding in nucleolus
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批准号:19F19337
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2019
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
Analysis and regulation of non-canonical nucleic acids under intracellular conditions
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批准号:18KK0164
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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资助金额:$11.4万
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财政年份:2018
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
Development of tunable aptamers derived from natural riboswitches for making genetic control devices
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批准号:15F15345
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
細胞のガン化抑制に必要なテロメア核酸とテロメラーゼタンパク質の新規制御法の開発
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批准号:19655064
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2007
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
細胞内環境下における核酸相互作用エネルギーのデータベース化
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批准号:15656213
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2003
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
リボザイムの機能解明を目指したローリング・シンクロナイゼーション法の開発
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批准号:13022272
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
核酸認識だけでなくリボザイム機能を有する新規DNAチップの開発
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批准号:12878107
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2000
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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批准号:12019269
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:11116226
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1999
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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批准号:11132272
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:10129228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1998
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:09235233
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:08249242
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:08220267
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
酵素的触媒作用を有する機能性核酸分子の開発
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批准号:08878089
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:07230293
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1995
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:06241279
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1994
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
RNAの高速構造変化と機能の関係
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批准号:05210210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1993
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
RNAの高速構造変化と機能の関係
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批准号:04226216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1992
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
海外基金