利用体外选择法和combichem法开发超分子识别装置-猫眼课题宝

利用体外选择法和combichem法开发超分子识别装置

批准号：

11132272

负责人：

杉本直己

金额：

$1.28万

依托单位：

Konan University

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)

财政年份：

1999

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

1999 至 --

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11132272/

关键词：

リボザイム RNA DNA 金属イオンデオキシリボザイムカルシウムイオン速度定数核酸切断

项目摘要

项目成果

杉本直己的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要

翻译

点击翻译按钮获取中文摘要

英文摘要

リボザイムは、核酸の切断や連結反応などの触媒機能を有するRNA分子である。さらにリボサイムと同様の機能を有する機能性DNA(デオキシリボザイム)も、インビトロ選択法などを用いて人工的に作られている。本研究では、新たな機能を有するデオキシリボサイムの開発を試みた。その結果、RNA切断機能を有するカルシウムイオン特異的な小型デオキシリボサイムの開発に成功した。我々はPb^<2+>イオンによって12塩基からなる基質RNAを部位特異的に切断する小型リボサイムの開発を行っていたが、今回新たにRNAを部位特異的に切断するデオキシリボサイム(bGCCTGGCA-G_1G_2C_3T_4A_5G_6C_7T_8A_9C_<10>A_<11>A_<12>C_<13>G_<14>A_<15>GTCCCT;下線はループ部位を示す)を基本型とし、ダウンサイジング法によるデオキシリボサイムの小型化と各種金属イオンによる活性効率の検討を行った。その結果、基本型デオキシリボザイムのループから4塩基を取り除いた11塩基(dG_1G_2C_3T_4A_9C_<10>A_<11>A_<12>C_<13>G_<14>A_<15>)からなる小型デオキシリボザイムを創製できた。また、この小型デオキシリボザイムは、Ca^<2+>存在下でのみ活性を示すカルシウムイオン特異的な新型核酸酵素であることもわかった。さらに、二次反応速度定数(kcat/Km)を算出した結果、基本型デオキシリボザイムの金属イオン間のkcat/Kmの差は約5倍であるのに対して、この変異型デオキシリボザイムでは約20倍に向上していることが明らかとなった。つまりループ内の塩基配列及び金属イオンの種類の両方により、RNA切断反応性を制御できる可能性がある。

期刊论文(1)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

N.Sugimoto: "A novel screening method for combinatorial chemistry for low affinity interactions"Chem.Commun.. 677-678 (1999)

N.Sugimoto：“低亲和力相互作用的组合化学的新颖筛选方法”Chem.Commun.. 677-678 (1999)

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Quantitative prediction of nucleic acid structures and functions affected by spaciotemporal environmental factors in cells

批准号：

22H04975
项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
资助金额：

$126.3万
财政年份：

2022
负责人：

杉本直己
依托单位：

Konan University

Quantitative analysis of rRNA foding triggered by specific molecular crowding in nucleolus

批准号：

19F19337
项目类别：

Grant-in-Aid for JSPS Fellows
资助金额：

$1.41万
财政年份：

2019
负责人：

杉本直己
依托单位：

Konan University

Analysis and regulation of non-canonical nucleic acids under intracellular conditions

批准号：

18KK0164
项目类别：

Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
资助金额：

$11.4万
财政年份：

2018
负责人：

杉本直己
依托单位：

Konan University