遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
批准号:
11116226
负责人:
杉本 直己
金额:
$0.9万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 --
中文摘要
リボザイムは、核酸の切断や連結反応などの触媒機能を有するRNA分子である。さらにリボサイムと同様に機能を有する機能性DNA(デオキシリボザイム)も、インビトロ選択法などを用いて人工的に作られている。このような機能性核酸は、その機能の重要性や、遺伝子発現・タンパク質機能との関連などから、エイズやガンなどの遺伝子を切断する新しいタイプの分子として、またあらゆる生体反応を触媒できる可能性を秘めた新しい機能性材料として期待されている。本研究では、新たな機能を有するデオキシリボサイムの開発を試みた。その結果、RNA切断機能を有するカルシウムイオン特異的な小型デオキシリボサイムの開発に成功した。我々はPb^<2+>イオンによって12塩基からなる基質RNAを部位特異的に切断する小型リボサイムの開発を行っていたが、今回新たにRNAを部位特異的に切断するデオキシリボサイム(bGCCTGGCA-G_1G_2C_3T_4A_5G_6C_7T_8A_9C_<10>A_<11>A_<12>C_<13>G_<14>A_<15>GTCCCT;下線はループ部位を示す)を基本型とし、ダウンサイジング法によるデオキシリボサイムの小型化と各種金属イオンによる活性効率の検討を行った。その結果、基本型デオキシリボザイムのループから4塩基を取り除いた11塩基(dG_1G_2C_3T_4A_9C_<10>A_<11>A_<12>C_<13>G_<14>A_<15>)からなる小型デオキシリボザイムを創製できた。また、この小型デオキシリボザイムは、Ca^<2+>存在下でのみ活性を示すカルシウムイオン特異的な新型核酸酵素であることもわかった。
英文摘要
リボザイムは、核酸の切断や連結反応などの触媒機能を有するRNA分子である。さらにリボサイムと同様に機能を有する機能性DNA(デオキシリボザイム)も、インビトロ選択法などを用いて人工的に作られている。このような機能性核酸は、その機能の重要性や、遺伝子発現・タンパク質機能との関連などから、エイズやガンなどの遺伝子を切断する新しいタイプの分子として、またあらゆる生体反応を触媒できる可能性を秘めた新しい機能性材料として期待されている。本研究では、新たな機能を有するデオキシリボサイムの開発を試みた。その結果、RNA切断機能を有するカルシウムイオン特異的な小型デオキシリボサイムの開発に成功した。我々はPb^<2+>イオンによって12塩基からなる基質RNAを部位特異的に切断する小型リボサイムの開発を行っていたが、今回新たにRNAを部位特異的に切断するデオキシリボサイム(bGCCTGGCA-G_1G_2C_3T_4A_5G_6C_7T_8A_9C_<10>A_<11>A_<12>C_<13>G_<14>A_<15>GTCCCT;下線はループ部位を示す)を基本型とし、ダウンサイジング法によるデオキシリボサイムの小型化と各種金属イオンによる活性効率の検討を行った。その結果、基本型デオキシリボザイムのループから4塩基を取り除いた11塩基(dG_1G_2C_3T_4A_9C_<10>A_<11>A_<12>C_<13>G_<14>A_<15>)からなる小型デオキシリボザイムを創製できた。また、この小型デオキシリボザイムは、Ca^<2+>存在下でのみ活性を示すカルシウムイオン特異的な新型核酸酵素であることもわかった。
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N.Sugimoto: "Effect of metal ions and sequence of deoxyribozymes on their RNA cleavage activity"J.Chem.Soc.,Perkin Trans.2. 1381-1386 (1999)
N.Sugimoto:“金属离子和脱氧核酶序列对其 RNA 裂解活性的影响”J.Chem.Soc.,Perkin Trans.2。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
N.Sugimoto: "A novel screening method for combinatorial chemistry for low affinity interactions"Chem.Commun.. 677-678 (1999)
N.Sugimoto:“低亲和力相互作用的组合化学的新颖筛选方法”Chem.Commun.. 677-678 (1999)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
N.Sugimoto: "α-β structural Transition of Short Oligopeptides by Water/Organic Solvent Titration"Chem.Lett.. 637-638 (1999)
N.Sugimoto:“通过水/有机溶剂滴定法实现短寡肽的 α-β 结构转变”Chem.Lett.. 637-638 (1999)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
J.Zou: "Effect of copper ion on conformations of short alanine-based peptides with single Trp/His stacking interactions"Protein and Peptide Lett.. 6. 373-378 (1999)
J.Zou:“铜离子对具有单色氨酸/组氨酸堆积相互作用的短丙氨酸肽构象的影响”Protein and Peptide Lett.. 6. 373-378 (1999)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
S.Nakano: "Nucleic Acid Duplex Stability:Influence of Base Composition on Cation Effect"Nucleic Acids Res.. 27. 2957-2965 (1999)
S.Nakano:“核酸双链体稳定性:碱基组成对阳离子效应的影响”核酸研究 27. 2957-2965 (1999)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
Quantitative prediction of nucleic acid structures and functions affected by spaciotemporal environmental factors in cells
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批准号:22H04975
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$126.3万
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财政年份:2022
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
Quantitative analysis of rRNA foding triggered by specific molecular crowding in nucleolus
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批准号:19F19337
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2019
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
Analysis and regulation of non-canonical nucleic acids under intracellular conditions
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批准号:18KK0164
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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资助金额:$11.4万
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财政年份:2018
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
Development of tunable aptamers derived from natural riboswitches for making genetic control devices
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批准号:15F15345
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
細胞のガン化抑制に必要なテロメア核酸とテロメラーゼタンパク質の新規制御法の開発
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批准号:19655064
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2007
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
細胞内環境下における核酸相互作用エネルギーのデータベース化
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批准号:15656213
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2003
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
リボザイムの機能解明を目指したローリング・シンクロナイゼーション法の開発
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批准号:13022272
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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批准号:12019269
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
核酸認識だけでなくリボザイム機能を有する新規DNAチップの開発
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批准号:12878107
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2000
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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批准号:11132272
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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批准号:10145254
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:10129228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1998
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:09235233
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:08249242
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:08220267
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
酵素的触媒作用を有する機能性核酸分子の開発
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批准号:08878089
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:07230293
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1995
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:06241279
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1994
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
RNAの高速構造変化と機能の関係
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批准号:05210210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1993
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
RNAの高速構造変化と機能の関係
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批准号:04226216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1992
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
国内基金
海外基金
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基于合成生物标志物的超多重RNA数字化检测平台用于肿瘤精准诊断和分期评估
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:程子译
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依托单位:
RNA m6A修饰通过调控FDX1介导的铜死亡参与补阳还五汤抗脑缺血再灌注损伤作用机制的研究
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批准号:2026JJ81091
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:刘亮
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依托单位:
免标记CRISPR-RNA适配体与门逻辑分子诊断新方法研究
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批准号:2026JJ50010
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:应站明
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依托单位:
Dead-box解旋酶DDX23通过调控RNA高级结构促进肝癌细胞恶性生物学行为的分子机制研究
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批准号:JCZRLH202600588
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
基于基因编辑技术解析丹酚酸B靶向SAMHD1调控心肌线粒体RNA稳态干预心衰的分子机制研究
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批准号:JCZRLH202601084
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
RNA 结合蛋白HuR与VEGF-D联合调控舌鳞癌侵袭及转移机制的研究
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批准号:2026JJ80684
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:龚攀
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依托单位:
基于异质人群多源数据识别单细胞 RNA数量性状风险位点的统计学方法研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:蔡铭轩
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依托单位:
uN2CpolyG蛋白经ALYREF蛋白介导RNA转运异常在神经元核内包涵体病发病中的作用及机制研究
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批准号:2026JJ60587
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:张思哲
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依托单位:
病毒非编码RNA多样性图谱构建及其生物发生与致病机制研究
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批准号:2026JJ60389
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:傅萍
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依托单位:
核糖核酸酶RNase E与其抑制因子RebA通过液-液相分离调控蓝藻RNA代谢的分子机制
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批准号:JCZRQNB202600879
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位: