遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割

核酸的具体结构和金属离子在基因表达中的作用

基本信息

  • 批准号:
    11116226
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.9万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 财政年份:
    1999
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1999 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

リボザイムは、核酸の切断や連結反応などの触媒機能を有するRNA分子である。さらにリボサイムと同様に機能を有する機能性DNA(デオキシリボザイム)も、インビトロ選択法などを用いて人工的に作られている。このような機能性核酸は、その機能の重要性や、遺伝子発現・タンパク質機能との関連などから、エイズやガンなどの遺伝子を切断する新しいタイプの分子として、またあらゆる生体反応を触媒できる可能性を秘めた新しい機能性材料として期待されている。本研究では、新たな機能を有するデオキシリボサイムの開発を試みた。その結果、RNA切断機能を有するカルシウムイオン特異的な小型デオキシリボサイムの開発に成功した。我々はPb^<2+>イオンによって12塩基からなる基質RNAを部位特異的に切断する小型リボサイムの開発を行っていたが、今回新たにRNAを部位特異的に切断するデオキシリボサイム(bGCCTGGCA-G_1G_2C_3T_4A_5G_6C_7T_8A_9C_<10>A_<11>A_<12>C_<13>G_<14>A_<15>GTCCCT;下線はループ部位を示す)を基本型とし、ダウンサイジング法によるデオキシリボサイムの小型化と各種金属イオンによる活性効率の検討を行った。その結果、基本型デオキシリボザイムのループから4塩基を取り除いた11塩基(dG_1G_2C_3T_4A_9C_<10>A_<11>A_<12>C_<13>G_<14>A_<15>)からなる小型デオキシリボザイムを創製できた。また、この小型デオキシリボザイムは、Ca^<2+>存在下でのみ活性を示すカルシウムイオン特異的な新型核酸酵素であることもわかった。
RNA molecules that function as catalysts for the production of nucleic acids The functional DNA(DNA), DNA selection, and DNA sequencing were used to determine the identity of the species. The importance of functional nucleic acids and their functions, the discovery of genes, the identification of their functions and their relationships, the isolation of genes, the creation of new molecules, the possibility of biological reaction catalysts, the discovery of new functional materials, and the expectation of new functional materials. This study attempts to develop new functions. As a result, the RNA cleavage function has been successfully developed in a small and specific manner. We have developed A novel approach to RNA site-specific cleavage, which is based on the Pb &lt;2+&gt; region. We have also developed a new approach to RNA site-specific cleavage, which is based on the pb &lt;2+&gt; region (bGCCTGGCA-G_1G_2C_3T_4A_5G_6C_7T_8A_9C_ A<10><11>_<12>C_<13>G_<14>A_<15>GTCCCT; lower line region). As a result, the basic model of the system was created by selecting the 11-base (dG_1G_2C_3T_4A_9C_<10>A<11>_<12>C_<13>G_<14>A_<15>) from the 4-base. A novel nuclease specific for small and medium-sized organisms is shown to be active in the presence of Ca^&lt;2+&gt;.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
N.Sugimoto: "Effect of metal ions and sequence of deoxyribozymes on their RNA cleavage activity"J.Chem.Soc.,Perkin Trans.2. 1381-1386 (1999)
N.Sugimoto:“金属离子和脱氧核酶序列对其 RNA 裂解活性的影响”J.Chem.Soc.,Perkin Trans.2。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
N.Sugimoto: "A novel screening method for combinatorial chemistry for low affinity interactions"Chem.Commun.. 677-678 (1999)
N.Sugimoto:“低亲和力相互作用的组合化学的新颖筛选方法”Chem.Commun.. 677-678 (1999)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
N.Sugimoto: "α-β structural Transition of Short Oligopeptides by Water/Organic Solvent Titration"Chem.Lett.. 637-638 (1999)
N.Sugimoto:“通过水/有机​​溶剂滴定法实现短寡肽的 α-β 结构转变”Chem.Lett.. 637-638 (1999)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
J.Zou: "Effect of copper ion on conformations of short alanine-based peptides with single Trp/His stacking interactions"Protein and Peptide Lett.. 6. 373-378 (1999)
J.Zou:“铜离子对具有单色氨酸/组氨酸堆积相互作用的短丙氨酸肽构象的影响”Protein and Peptide Lett.. 6. 373-378 (1999)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S.Nakano: "Nucleic Acid Duplex Stability:Influence of Base Composition on Cation Effect"Nucleic Acids Res.. 27. 2957-2965 (1999)
S.Nakano:“核酸双链体稳定性:碱基组成对阳离子效应的影响”核酸研究 27. 2957-2965 (1999)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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杉本 直己其他文献

水和イオン液体中で機能する新規 DNA 配列センシングシステムの構築
构建在水合离子液体中发挥作用的新型DNA序列传感系统
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  • 发表时间:
    2013
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    0
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    建石 寿枝;杉本 直己
  • 通讯作者:
    杉本 直己
新生RNAの転写共役フォールディングを利用したRNA構造スイッチの設計
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 通讯作者:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    杉本 直己
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  • 发表时间:
    2022
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  • 作者:
    鶴田 充生;取井 猛流;小畠 一起;川内 敬子;建石 寿枝;杉本 直己;三好 大輔
  • 通讯作者:
    三好 大輔
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图解纳米DDS(标题:第1章5)天然高分子核酸《基于能量数据的核酸药物设计》)
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    0
  • 作者:
    杉本 直己;甲元 一也
  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 通讯作者:
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Quantitative prediction of nucleic acid structures and functions affected by spaciotemporal environmental factors in cells
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    22H04975
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    2022
  • 资助金额:
    $ 0.9万
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  • 批准号:
    19F19337
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    2019
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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  • 资助金额:
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  • 资助金额:
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細胞のガン化抑制に必要なテロメア核酸とテロメラーゼタンパク質の新規制御法の開発
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    19655064
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 0.9万
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    Grant-in-Aid for Exploratory Research
細胞内環境下における核酸相互作用エネルギーのデータベース化
细胞内环境核酸相互作用能数据库
  • 批准号:
    15656213
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
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  • 批准号:
    13022272
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
核酸認識だけでなくリボザイム機能を有する新規DNAチップの開発
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  • 批准号:
    12878107
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 0.9万
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インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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  • 批准号:
    12019269
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 0.9万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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  • 批准号:
    11132272
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 0.9万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)

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基于多模态嵌入的RNA远程同源模板识别方法研究
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相似海外基金

RNA分子の集合によるリボザイム活性発現モデルの構築
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  • 批准号:
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  • 财政年份:
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  • 资助金额:
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    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
RNA分解産物をリサイクルするリガーゼリボザイムの創出
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    22K19118
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.9万
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    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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  • 批准号:
    20K14599
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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  • 批准号:
    19K06579
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Creation of a novel functional RNA that converts adenosine to inosine by deamination reaction
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  • 批准号:
    19K20405
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    2019
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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基于 RNA 的遗传开关,使用控制 RNA 结构和功能的合成小分子配体
  • 批准号:
    18H02107
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
A large-scale screening system for self-cleaving ribozymes using structured RNA libraries
使用结构化 RNA 文库的大规模自切割核酶筛选系统
  • 批准号:
    17J09014
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Exploration of coenzyme-biding RNA to find novel functions of vitamins
探索辅酶结合RNA以发现维生素的新功能
  • 批准号:
    15K12347
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    2015
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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伪天然RNA结构作为构建具有几何形状的功能性RNA纳米结构的有前途的模块
  • 批准号:
    15K05561
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
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