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核酸認識だけでなくリボザイム機能を有する新規DNAチップの開発

核酸認識だけでなくリボザイム機能を有する新規DNAチップの開発
开发出不仅可以识别核酸还具有核酶功能的新型DNA芯片
批准号：
12878107
负责人：
杉本 直己
金额：
$1.34万
依托单位：
Konan University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2000
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2000 至 2001
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12878107/
关键词：
非天然核酸デオキシリボサイムDNAチップリボサイム核酸高次構造ジーンチップペプチド核酸RNA切断反応リボザイムデオキシリボザイムRNA切断活性カルシウムイオン金属イオンダウンサイジングアビジン-ビオチン相互作用

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项目成果

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核酸の未知の機能が次々と発見され、生体系の共有結合の切断に対して触媒機能を有するデオキシリボザイムが注目されている。このデオキシリボザイムは、金属イオンの助けを借りながら遺伝子を"認識"し、さらに切断するという"機能"を有する分子である。一方、遺伝子の機能を迅速かつ簡便に解明する手法の1つに、DNAチップ法がある。これは、相補的な核酸同士が互いに"認識"することを利用した技術である。しかしながら、"機能"を有するDNAチップの開発は未だなされていない。このような機能性分子をチップ上に固定化できれば、相補鎖認識だけでなく機能も併せ持つ機能性DNAチップとして活用できるという期待が高まっている。本研究では、短鎖デオキシリボザイムを機能性分子として捉え、核酸の"認識"と切断の"機能"を併せ持つ超分子認識素子(デオキシリボザイム素子)の開発について検討した。インビトロ選択法により見いだされたデオキシリボザイムの活性部位のダウンサイジングを行い、ループ内の塩基配列及び金属イオンの種類の両方により、RNA切断反応性を制御できるCa^<2+>依存型短鎖デオキシリボサイムを開発した。この短鎖デオキシリボザイムを利用した超分子認識素子を創製するために、短鎖デオキシリボザイムの5'末端をアビジン-ビオチン相互作用を利用してカラムに固定化した。このデオキシリボザイム素子を用いて、Ca^<2+>存在下で切断部位がヘアピン・ループ構造内にあるRNAの切断反応を行った結果、RNA切断活性がヘアピン・ループの塩基数に依存することがわかった。
期刊论文(13)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Naoki Sugimoto: "Stabilization Factors Affecting Duplex Formation of Peptide Nucleic Acid with DNA"Biochemistry. 40. 8444-8451 (2001)
Naoki Sugimoto：“影响肽核酸与 DNA 双链体形成的稳定因素”生物化学。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Tatsuo Ohmichi: "Kinetic Property of Bulged Helix Formation : Analysis of Kinetic Behavior Using Nearest-Neighbor Parameters"J.Am.Chem.Soc.. 122. 11286-11294 (2000)
Tatsuo Ohmichi：“凸出螺旋形成的动力学特性：使用最近邻参数分析动力学行为”J.Am.Chem.Soc.. 122. 11286-11294 (2000)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Junji Kwakami: "Thermodynamic Stability of Base Pairs between 2-Hydroxyadenine and Incoming Nucleotide Incorporation Specificity During Replication"Nucleic Asids Res.. 29. 3289-3296 (2001)
Junji Kwakami：“复制过程中 2-羟基腺嘌呤和传入核苷酸掺入特异性之间的碱基对的热力学稳定性”Nucleic Asids Res.. 29. 3289-3296 (2001)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Jin Zou: "A role of the Trp-His interaction in the conformational switch between α-helix and β-sheet in short alanine-based peptides"J.Chem.Soc.,Perkin Trans.2. 2135-2140 (2000)
Jin Zou：“Trp-His 相互作用在短丙氨酸肽中 α-螺旋和 β-折叠之间的构象转换中的作用”J.Chem.Soc.，Perkin Trans.2 2135-2140 (2000)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 13 条
    Quantitative prediction of nucleic acid structures and functions affected by spaciotemporal environmental factors in cells
    • 批准号：
      22H04975
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
    • 资助金额：
      $126.3万
    • 财政年份：
      2022
    • 负责人：
      杉本 直己
    • 依托单位：
      Konan University
    Quantitative analysis of rRNA foding triggered by specific molecular crowding in nucleolus
    • 批准号：
      19F19337
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.41万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      杉本 直己
    • 依托单位：
      Konan University
    Analysis and regulation of non-canonical nucleic acids under intracellular conditions
    • 批准号：
      18KK0164
    • 项目类别：
      Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
    • 资助金额：
      $11.4万
    • 财政年份：
      2018
    • 负责人：
      杉本 直己
    • 依托单位：
      Konan University
    Development of tunable aptamers derived from natural riboswitches for making genetic control devices
    • 批准号：
      15F15345
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.47万
    • 财政年份：
      2015
    • 负责人：
      杉本 直己
    • 依托单位：
      Konan University
    海外基金