Analysis and regulation of non-canonical nucleic acids under intracellular conditions
细胞内条件下非规范核酸的分析和调控
基本信息
- 批准号:18KK0164
- 负责人:
- 金额:$ 11.4万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
- 财政年份:2018
- 资助国家:日本
- 起止时间:2018-10-09 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究では、非標準核酸構造の安定性と立体構造を細胞内環境で解析し、非標準核酸構造による遺伝子発現制御機構を分子レベルで解明することを目的としている。令和4年度は細胞・個体レベルでの非標準核酸構造の形成による遺伝子発現制御機構を中心に研究を行った。その結果、本研究課題の主要な海外コラボレーターの一人である中国南京農業大学のXiaorong Fan教授と共同で、気候変動による外気温の上昇に伴いイネの収穫量を変動させる遺伝子を特定し、さらにこの遺伝子を制御する新規の小さなRNA(small RNA)を発見した(Sci. Adv., 8, eadc9785 (2022))。さらに、海外との共同研究成果として、非標準核酸構造を形成するRNAを用いた細胞内イメージング技術の開発を行った(Anal. Chem., 95, 976-985 (2022))。また、非標準核酸構造の一種であるグアニン四重鎖構造の水和に関する論文を発表した(Anal. Chem., 94, 7400-7407 (2022))。当該論文は、研究分担者の若手研究者(松本)が筆頭著者となり論文発表し、雑誌の表紙(Supplemental Cover)に採択されるなど、特筆すべき成果である。一方で、新型コロナウイルス感染症の規制が緩和されたこともあり、海外渡航を伴う研究計画を再開し、研究代表者の杉本が8th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acidsで招待講演を行った。当会議では、本研究課題の主要な海外コラボレーターの一人であるチェコMasaryk大学のLukas Trantirek博士も参加しお互いの成果を発表すると共に、共同研究に関する打ち合わせを行った。以上のように本事業に関する研究はおおむね順調に進展している。しかし、令和2年度から続く新型コロナウイルス感染症の影響により、非標準核酸構造の細胞内計測に関する計画の一部が令和4年度では未達成である。そのため、令和4年度で終了予定であった本事業をさらに1年延期し、令和5年度も国際共同研究を実施する。
The purpose of this study is to analyze the stability of non-standard nucleic acid structures, the intracellular environment, the molecular mechanism of gene production and control of non-standard nucleic acid structures In 2010 and 2014, the Center for Research on the Formation of Non-standard Nucleic Acid Structures in Cells and Individuals The main results of this research project are as follows: Xiaorong Fan, professor of Nanjing Agricultural University, China, and a new regulation of small RNA (small RNA), which is associated with the increase of external temperature, the change of production yield, the change of gene expression, and the control of gene expression (Sci. Adv., 8, eadc9785 (2022))。The results of joint research conducted by China and overseas countries include the development of non-standard nucleic acid structures, RNA applications, and intracellular technology. Chem., 95, 976-985 (2022))。A new type of non-standard nucleic acid structure is proposed, which is called four-fold lock structure. Chem., 94, 7400-7407 (2022))。When the paper is submitted by the author of the paper, the researcher (Matsumoto), the author of the paper, the Supplemental Cover, the author of the paper, the author of the paper. The 8th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids was held in Beijing. Dr. Lukas Trantirek of Masaryk University participated in the conference and presented the results of the joint research. The above research related to this cause is progressing smoothly. Part of the project on the impact of novel nucleic acid infections and intracellular measurement of non-standard nucleic acid constructs was not completed in 2002 and 2004. This project is scheduled for completion in 2014, and will be extended in 2015
项目成果
期刊论文数量(75)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crystallographic studies of ruthenium polypyridyl complexes bound to G-quadruplexes: Towards design, specificity, and function
与 G-四链体结合的钌聚吡啶配合物的晶体学研究:设计、特异性和功能
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:K. McQuaid;D. Cardin;J. Hall;N. Paterson;S. Takahashi;N. Sugimoto;C. Cardin
- 通讯作者:C. Cardin
Functions of Nucleic Acids under Molecular Crowding Conditions
分子拥挤条件下核酸的功能
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Koyabu D;Nojiri T.;T. Endoh;Naoki Sugimoto
- 通讯作者:Naoki Sugimoto
Prediction method for DNA duplex stability in molecular crowding conditions
分子拥挤条件下DNA双链体稳定性的预测方法
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:S. Ghosh;S. Takahashi;T. Ohyama;T. Endoh;H. Kateishi-Karimata;N. Sugimoto
- 通讯作者:N. Sugimoto
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杉本 直己其他文献
水和イオン液体中で機能する新規 DNA 配列センシングシステムの構築
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- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
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杉本 直己
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利用新生 RNA 转录耦合折叠设计 RNA 结构开关
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
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杉本 直己
核酸二次構造を標的としたドロップレットの分解
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- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
鶴田 充生;取井 猛流;小畠 一起;川内 敬子;建石 寿枝;杉本 直己;三好 大輔 - 通讯作者:
三好 大輔
絵で見てわかるナノDDS(題:第1章 5)天然高分子 核酸「エネルギーデータに基づく核酸医薬の設計」)
图解纳米DDS(标题:第1章5)天然高分子核酸《基于能量数据的核酸药物设计》)
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
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甲元 一也
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含有多个氢键单元的环状聚合物的合成
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
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- 作者:
杉本 直己;松井 淳;杉本 直己;杉本 直己・大道 達雄;三好 大輔・杉本 直己;杉本 直己・三好 大輔;手塚育志;杉本 直己・甲元 一也;杉本 直己・松井 淳;杉本 直己;手塚育志;佐藤 竹弥;森 直樹;石川 和孝 - 通讯作者:
石川 和孝
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22H04975 - 财政年份:2022
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11132272 - 财政年份:1999
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- 批准号:
24KJ1373 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.4万 - 项目类别:
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$ 11.4万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows