Analysis and regulation of non-canonical nucleic acids under intracellular conditions
Analysis and regulation of non-canonical nucleic acids under intracellular conditions
批准号:
18KK0164
负责人:
杉本 直己
金额:
$11.4万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-10-09 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究では、非標準核酸構造の安定性と立体構造を細胞内環境で解析し、非標準核酸構造による遺伝子発現制御機構を分子レベルで解明することを目的としている。令和4年度は細胞・個体レベルでの非標準核酸構造の形成による遺伝子発現制御機構を中心に研究を行った。その結果、本研究課題の主要な海外コラボレーターの一人である中国南京農業大学のXiaorong Fan教授と共同で、気候変動による外気温の上昇に伴いイネの収穫量を変動させる遺伝子を特定し、さらにこの遺伝子を制御する新規の小さなRNA(small RNA)を発見した(Sci. Adv., 8, eadc9785 (2022))。さらに、海外との共同研究成果として、非標準核酸構造を形成するRNAを用いた細胞内イメージング技術の開発を行った(Anal. Chem., 95, 976-985 (2022))。また、非標準核酸構造の一種であるグアニン四重鎖構造の水和に関する論文を発表した(Anal. Chem., 94, 7400-7407 (2022))。当該論文は、研究分担者の若手研究者(松本)が筆頭著者となり論文発表し、雑誌の表紙(Supplemental Cover)に採択されるなど、特筆すべき成果である。一方で、新型コロナウイルス感染症の規制が緩和されたこともあり、海外渡航を伴う研究計画を再開し、研究代表者の杉本が8th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acidsで招待講演を行った。当会議では、本研究課題の主要な海外コラボレーターの一人であるチェコMasaryk大学のLukas Trantirek博士も参加しお互いの成果を発表すると共に、共同研究に関する打ち合わせを行った。以上のように本事業に関する研究はおおむね順調に進展している。しかし、令和2年度から続く新型コロナウイルス感染症の影響により、非標準核酸構造の細胞内計測に関する計画の一部が令和4年度では未達成である。そのため、令和4年度で終了予定であった本事業をさらに1年延期し、令和5年度も国際共同研究を実施する。
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Crystallographic studies of ruthenium polypyridyl complexes bound to G-quadruplexes: Towards design, specificity, and function
与 G-四链体结合的钌聚吡啶配合物的晶体学研究:设计、特异性和功能
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[K. McQuaid, D. Cardin, J. Hall, N. Paterson, S. Takahashi, N. Sugimoto, C. Cardin]
通讯作者:
C. Cardin
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Koyabu D, Nojiri T., T. Endoh, Naoki Sugimoto]
通讯作者:
Naoki Sugimoto
Prediction method for DNA duplex stability in molecular crowding conditions
分子拥挤条件下DNA双链体稳定性的预测方法
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, H. Kateishi-Karimata, N. Sugimoto]
通讯作者:
N. Sugimoto
コルカタ大学(インド)
加尔各答大学(印度)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
国立NMRセンター(スロベニア)
国家核磁共振中心(斯洛文尼亚)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 50 条
Quantitative prediction of nucleic acid structures and functions affected by spaciotemporal environmental factors in cells
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批准号:22H04975
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$126.3万
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财政年份:2022
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
Quantitative analysis of rRNA foding triggered by specific molecular crowding in nucleolus
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批准号:19F19337
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2019
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
Development of tunable aptamers derived from natural riboswitches for making genetic control devices
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批准号:15F15345
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
細胞のガン化抑制に必要なテロメア核酸とテロメラーゼタンパク質の新規制御法の開発
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批准号:19655064
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2007
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
細胞内環境下における核酸相互作用エネルギーのデータベース化
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批准号:15656213
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2003
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
リボザイムの機能解明を目指したローリング・シンクロナイゼーション法の開発
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批准号:13022272
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
核酸認識だけでなくリボザイム機能を有する新規DNAチップの開発
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批准号:12878107
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2000
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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批准号:12019269
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:11116226
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1999
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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批准号:11132272
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
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批准号:10145254
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:10129228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1998
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:09235233
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
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批准号:08249242
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:08220267
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
酵素的触媒作用を有する機能性核酸分子の開発
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批准号:08878089
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1996
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:07230293
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1995
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
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批准号:06241279
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1994
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
RNAの高速構造変化と機能の関係
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批准号:05210210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1993
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
RNAの高速構造変化と機能の関係
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批准号:04226216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1992
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负责人:杉本 直己
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依托单位:
海外基金