酵母ゲノムにおいてクロマチンを介した転写抑制機構の解明

阐明酵母基因组中染色质介导的转录抑制机制

• 批准号: 10159213
• 负责人: 清水 光弘
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Meisei University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10159213/
• 关键词: クロマチン; ヌクレオソーム; 転写制御; リプレッサー; 蛋白質-DNA相互作用; ヒストンの脱アセチル化; 出芽酵母; ゲノム

Rme1pは,IMElの転写を抑制することによって,出芽酵母の減数分裂開始を制御している.最近我々は,Rme1pによる転写抑制機構を「activator exclusion at a distance」と名付け,Rme1pが転写抑制クロマチンドメインを形成するというモデルを提唱した.このドメインの分子間相互作用を明らかにする目的で,Rme1pの機能ドメインを解析した.300アミノ酸残基から成るRme1pにおいて,DNA結合ドメインは171-300残基にマップされ,DNA結合には3つのZn-fingersだけでは十分ではなく,C-末端285-300残基が必須であることが実証された.さらに,点変異蛋白質の解析から,DNA結合に重要な残基として,287Arg,290Lysと288Phe,292Leu,295He,296Leuが同定され,この領域が両親媒性α-へリックスを形成して,DNA結合ドメインを安定化することが示唆された.一方,Rme1pと相互作用する因子の遺伝学的スクリーニングにおいて,クロマチンリモデリング関連因子が候補として得られ,Rme1pとクロマチンとの繋がりを調べている.一方,昨年度までに,高次DNA構造がゲノム上でのヌクレオソーム編成の重要な因子の一つであることを示した.例えば,比較的長い(dA)_n・(dT)_n,(dG)_n・(dC)_nとZ-DNA配列である(CG)_nは,in vivoでヌクレオソームを排除する.出芽酵母ゲノムにおいて,n≧10の(dA)_n配列は2495個存在し,そのうち1760個はORFの500bp上流に局在している.この値は全ORFの1/4にも相当する.n≧20の配列はゲノム中に130個し,ORFの500bp上流では95個存在している.この結果から,ヌクレオソーム排除配列が,ヌクレオソームフリーの領域から成るプリセットプロモーターのcis-elementとして働くことを提唱した.

Rme1p,IMEl, inhibition of meiosis initiation in budding yeast. Recently,Rme1p has been called "activator exclusion at a distance." Rme1p is called "activator exclusion at a distance." For the purpose of clarifying molecular interactions, Rme1p function is analyzed at residues 171-300,DNA binding at residues 171-300,DNA binding at residues 3 and Zn-fingers at residues 285-300 at the C-terminal. In addition, the analysis of different proteins shows that residues 287Arg,290Lys, 288Phe,292Leu,295He,296Leu are important for DNA binding. On the one hand,Rme1p is a candidate for the interaction factor genetic algorithm, and Rme1p is a candidate for the interaction factor genetic algorithm. On the other hand, in the past year, high-order DNA structure has been shown to be an important factor in the organization of DNA. For example, compare the length of (dA)_n·(dT)_n,(dG)_n·(dC)_n Z-DNA alignment (CG)_n,in vivo budding yeast,n ≥ 10 (dA)_n alignment, 2495 exist, n ≥ 1760 ORFs and 500bp upstream. This value corresponds to 1/4 of the total ORFs.n ≥ 20 ORFs are arranged in the middle of the ORF, 130 ORFs are arranged in the upper 500bp, and 95 ORFs are arranged in the middle. The results are as follows: 1. The layout of the system is different from that of the system. 2. The system is different from that of the system.

项目成果

Mitsuhiro Shimizu et al.,: "Genomic footprinting of the yeast zinc finger protein Rme1p and its roles in repression of the meiotic activator IME1." Nucleic Acids Res.26. 2319-2336 (1998)

Mitsuhiro Shimizu 等人：“酵母锌指蛋白 Rme1p 的基因组足迹及其在抑制减数分裂激活剂 IME1 中的作用。”