酵母ゲノムにおいてクロマチン構造を介した転写調節機構の解明

阐明酵母基因组染色质结构介导的转录调控机制

• 批准号: 08274217
• 负责人: 清水 光弘
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Tokyo University of Pharmacy and Life Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08274217/
• 关键词: クロマチン; ヌクレオソーム; 転写制御; リプレッサー; DNAの高次構造; Z-DNA; 出芽酵母; ゲノム

1.Rme1pによる新しい転写抑制機構-Activator Exclusion at a DistanceRme1pは,S.cerevisiae一倍体において減数分裂の開始を阻害する,という重要な機能を担っている.我々は,Rme1pによる転写抑制機構として,遠隔的にactivatorsの結合を阻害することを明らかにした.そして,この機構を「activator exclusion」と名付け,Rme1pが染色体上で転写不活性なクロマチンドメインを構築する,というモデルを提唱した.activator exclusionには,グローバルな転写因子Rgr1pとSin4pが必要であり,この抑制機構にクロマチン構造が関与していることが示唆された.そこで,Rme1pによる転写抑制とクロマチン構造との関係について調べた結果,(1)IME1遺伝子上流においてポジショニングしたヌクレオソームを介してRme1pの2つの結合部位が空間的に近くに配置されること,(2)CYC1-lacZミニ染色体上で,activatorsの結合部位近傍のヌクレオソームの構築にRme1pが関与していること,が示唆された.現在,クロマチン構造と転写抑制との関係について解析を進めている.2.クロマチンの構築におけるDNAの高次構造の役割in vivoでの特殊はDNA配列によるヌクレオソームの排除機構を明らかにするために、種々の(A)_nならびにZ-DNA配列の影響について検討した.(A)_n配列が15bp以上に長くなると、その領域近傍からヌクレオソームは排除された.一方、Z-DNAを容易に形成する(CG)_n配列はヌクレオソーム形成を阻害したが,(CA)_n配列は大きな影響を及ぼさなかった.以上の結果は、塩基配列に固有なDNA構造が,in vivoでのヌクレオソーム形成の重要な因子の一つであることを示している。

1. Activator Exclusion at a DistanceRme1p,S.cerevisiae haploids are responsible for the inhibition of meiosis initiation and important functions. I'm going to write about the inhibition mechanism of Rme1p, and the inhibition mechanism of the combination of distant activators. The mechanism is called "activator exclusion," and Rme1p is a chromosome that contains an inactive gene. The mechanism is called "activator exclusion," and Rme 1p is a chromosome that contains an inactive gene. The results show that: (1) the upstream of Rme1p gene is regulated by the close spatial distribution of Rme1 p 2 binding sites;(2)CYC1-lacZ is regulated by the close spatial distribution of Rme1p 2 binding sites;(3) the upstream of Rme1 p gene is regulated by the close spatial distribution of Rme1p 2 binding sites; and (4) the upstream of Rme1p gene is regulated by the close spatial distribution of Rme1p 2 binding sites. Now, the analysis of the relationship between structure and inhibition of DNA in vivo is progressing. 2. The structure of DNA in vivo is special. The exclusion mechanism of DNA in vivo is clear. The effect of Z-DNA alignment is discussed. (A)_n alignment is more than 15bp in length, and the field is close to it. One side, Z-DNA is easy to form,(CG)_n alignment is easy to form,(CA)_n alignment is easy to form, and (CA)_n alignment is easy to form. These results indicate that the DNA structure inherent in gene alignment is one of the important factors in the formation of gene alignment in vivo.

项目成果

Mitsuhiro Shimizu,W.Li,H.Shindo & A.P.Mitchell: "Transcriptional repression at a distance through exclusion of activator binding in vivo." Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.94. 790-795 (1997)

清水光宏,W.Li,H.Shindo