光合成関連遺伝子群の体系的同定

光合作用相关基因的系统鉴定

• 批准号: 12024101
• 负责人: 杉浦 昌弘
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 2000
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12024101/
• 关键词: ラン藻; 光合成; ゲノム; mRNA; in vitro転写系; タバコ; 植物; DNA

(1)Anacystis nidulans6301ゲノム解析Anacystis nidulans6301(2.7Mbp)の全ゲノムDNAをλDashIIで作製した全ゲノムをカバーする約500個のλクローンを分離、同定し、ゲノム全領域をほぼカバーするcontigを作製した。全領域をカバーする最小のλクローンは約200個である。平行して、451個のλクローンの両末端の塩基配列を決定し遺伝子解析を行った。これは全ゲノムに対して、2562kbp/902=2.8kbpで平均2.8kbp毎にsequence tagを作製したことになる。これらのsequence tagより現在のところ581個の遺伝子が同定された。平成12年に入り、(株)島津製作所ジェノミックリサーチ室と共同でショットガン法で、同社の開発したDNAシーケンサー「RISA384」を用いて解析を行った。平成12年12月には冗長度5のデータを得て、現在その結合編集を行っている。(2)植物光合成関連mRNAの濃縮収光性クロロフィル結合タンパク質mRNA群をモデル系として解析を行った。タバコin vitro転写系をも併用して、転写様式を同定して、他の光合成関連遺伝子mRNAの濃縮に利用できるデータを得た。

(1)Anacystis nidulans6301ゲノム analyze Anacystis Nidulans6301 (Mbp) 2.7 の full ゲ ノ ム DNA を lambda DashII で cropping し た full ゲ ノ ム を カ バ ー す る about 500 の lambda ク ロ ー ン を separation, with fixed し, ゲ ノ ム full-scope を ほ ぼ カ バ ー す る contig を cropping し た. The minimum of the entire domain をカバ をカバ する する is approximately 200 である. Parallel て, 451 <s:1> λ -ロ ロ ロ ロ <s:1> <s:1> terminal <s:1> base arrangement を determines the 伝 subvector analysis を row った. こ れ は full ゲ ノ ム に し seaborne て, 2562 KBP / 902 = 2.8 KBP で average 2.8 KBP in their に sequence tag を cropping し た こ と に な る. <s:1> れら <s:1> sequence tagよ よ よ now と と ろ ろ581 heritage 伝 items が are fixed された. に into り, pp.47-53 12 years (strains) shimadzu ジ ェ ノ ミ ッ ク リ サ ー チ chamber と common で シ ョ ッ ト ガ で ン method, with the club の 発 し た DNA シ ー ケ ン サ ー "RISA384" を い analytical line を っ て た. December 12 Heisei に に length 5 <s:1> デ タを タを て, present そ を combined with compilation を lines って る る る る. (2) the plant photosynthesis masato even mRNA の enrichment 収 optical ク ロ ロ フ ィ ル combining タ ン パ ク qualitative mRNA group を モ デ ル department と し analytical line を っ て た. タ バ コ in vitro planning write department を も and し て, planning to write with others in type を し て, he の synthetic masato even survived 伝 mRNA の enrichment に using で き る デ ー タ を た.

项目成果

Sugiura,M.: "Nucleic Acids. In "Biochemistry & Molecular Biology of Plants""American Society of Plant Physiologists. 50 (2000)

Sugiura,M.：“核酸。在“生物化学”中

Sugiura,M.: "Phytogene sequence : From cyanobacteia to plastids. In "From Symbiosis to Eukaryotism-Endocytobiology VII""Univ Geneva Press. 16 (2000)

Sugiura,M.：“植物基因序列：从蓝藻到质体。在“从共生到真核-内细胞生物学 VII””，日内瓦大学出版社。

Sugita,C.: "A novel nucleic acid-binding protein in the cyanobacterium Synechococcus sp. PCC6301."Mol.Gen.Genet.. 263. 655-663 (2000)

Sugita,C.：“蓝细菌聚球藻 PCC6301 中的一种新型核酸结合蛋白。”Mol.Gen.Genet.. 263. 655-663 (2000)

Nakamura T.: "Chloroplast ribonucleoproteins function as a stabilizing factor of ribosomefree mRNAs in the stroma."J.Biol.Chem.. 276. 147-152 (2001)

Nakamura T.：“叶绿体核糖核蛋白作为基质中无核糖体 mRNA 的稳定因子发挥作用。”J.Biol.Chem.. 276. 147-152 (2001)

Yukawa,Y.: "The TATA motif, the CAA motif and the Poly(T) transcription termination motif are all important for transcription re-initiation on plant tRNA genes."Plant Journal. 22. 439-447 (2000)

Yukawa,Y.：“TATA 基序、CAA 基序和 Poly(T) 转录终止基序对于植物 tRNA 基因的转录重新启动都很重要。”《植物杂志》。