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葉緑体から核への遺伝子移行を説明する翻訳不適合説の実験的検証

葉緑体から核への遺伝子移行を説明する翻訳不適合説の実験的検証
解释基因从叶绿体到细胞核转移的翻译不相容理论的实验验证
批准号：
19657072
负责人：
杉浦 昌弘
金额：
$1.86万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2007
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2007 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19657072/
关键词：
葉緑体タバコ翻訳mRNAリボソームタンパク質遺伝子in vitro系共生ラン藻進化

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项目成果

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葉緑体はラン藻様の原核生物が宿生細胞に共生して生じた。この祖先原核ゲノムは、一部を葉緑体に残し大部分は核に移行した。我々は、翻訳系の変化に対応できなくなった遺伝子が核に移行したという「翻訳不適合説」を立て、この説の検証を我々のタバコ葉緑体融in vitro翻訳系を用いて試みた。1.タバコ核由来のrbcS mRNAの翻訳速度の測定(中邨)約1.8kbのタバコ葉緑体rbcL mRNAの翻訳速度を蛍光リジンtRNAの取込みで測定したが、長すぎて翻訳されにくかった。3'末端側を順次欠失させて翻訳効率を上げ、約3分の2を欠失して158コドンにしたものが良い結果を得たので、この短縮rbcL mRNAを使うことにした。一方、核コードのrbcS mRNAはトランジット配列と成熟SSをコードするので、SSコード領域のみを葉緑体rbcL mRNAのLSコード領域と置き換えたキメラmRNAを作製した。この両mRNAのin vitro翻訳を試みたが、再現性ある結果がまだ出ていない。2,対照実験としての他種のmRNAの調査と調製(杉浦)対照実験として、葉緑体コードのリボソームタンパク質S2と核コードのリボソームタンパク質L23の遺伝子をまず候補とした。本調査中に、葉緑体のリボソームタンパク質Sl6遺伝子がシロイヌナズナの核にもあり、その産物がミトコンドリアと葉緑体へも移行するとの報告が出たので(Ueda et al.2008)タバコ葉緑体Sl6 mRNAを用いてin vitro翻訳を行っている。タバコのESTも蓄積中なので核ゲノムのS8遺伝子を探索中である。本計画は完了までに至らなかったが、引き続き研究費を申請して研究を続行する予定である。
期刊论文(7)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Unique mechanisms of translation in higher plant chloroplasts.
高等植物叶绿体中独特的翻译机制。
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Sugiura, M., M. Yukawa, H. Kuroda, M. Nakamura]
通讯作者： M. Nakamura
Selection of synonymous codons for better expression of recombinant proteins in tobacco chloroplasts
选择同义密码子以更好地在烟草叶绿体中表达重组蛋白
DOI： --
发表时间： 2008
期刊： Plant Biotechnology (in press)
影响因子： --
作者： [Nakamura, M., M. Sugiura]
通讯作者： M. Sugiura
A survey of expressed tRNA genes in the chromosome I of Arabidopsis using an RNA polymerase III-dependent in vitro transcription system
使用 RNA 聚合酶 III 依赖性体外转录系统调查拟南芥染色体 I 中表达的 tRNA 基因
DOI： --
发表时间： 2007
期刊： Gene 392
影响因子： --
作者： [Yukawa, Y., T. Mizutani, K. Akama and M. Sugiura]
通讯作者： K. Akama and M. Sugiura
The complete structure of the cucumber (Cucumis sativus L.) chloroplast genome: its composition and comparative analysis.
DOI： 10.2478/s11658-007-0029-7
发表时间： 2007
期刊： Cellular & molecular biology letters
影响因子： 8.3
作者： [Plader W, Yukawa Y, Sugiura M, Malepszy S]
通讯作者： Malepszy S
共 8 条
    RNAエディティングによるゲノム情報の変換システム - 葉緑体ゲノムでの網羅的解析
    • 批准号：
      16011251
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $4.16万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    植物in vitro RNAスプライシング系の開発
    • 批准号：
      16657017
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.79万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    RNAエディティングによるゲノム情報の変換システム-葉緑体ゲノムでの解析-
    • 批准号：
      15011101
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.84万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    RNAエディティングによる遺伝情報の変換システム―葉緑体ゲノムでの網羅的解析
    • 批准号：
      14011101
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.9万
    • 财政年份：
      2002
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    海外基金