出芽酵母の全プロテインホスファターゼ遺伝子二重破壊変異株の作製と機能解析

酿酒酵母全蛋白磷酸酶基因双破坏突变体的构建及功能分析

基本信息

  • 批准号:
    12024213
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2000 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

タンパク質のリン酸化・脱リン酸化は、細胞機能の代表的な制御様式である。ゲノムの全塩基配列から、出芽酵母には、117種のプロテインキナーゼ(PKase)、32種のプロテインホスファターゼ(PPase)が存在すると推定されている。一方、出芽酵母では約250種のリン酸化タンパクが報告されているが、それらがどのようなPKaseによってリン酸化され、どのようなPPaseによって脱リン酸化されるかについては、断片的な知見が得られているに過ぎない。本研究では、「真核生物におけるタンパク質のリン酸化・脱リン酸化による細胞機能制御の全体像」を明らかにすることを目指して、出芽酵母の32種のPPaseについて、単独破壊株だけでなく、全ての組合わせの二重破壊株を作成し、その網羅的な表現型解析から、それぞれのPPaseが、どのような細胞生理に関わっているかを明らかにすることを目的とした。まず、W303-1A(a接合型)株から形質転換法で単一破壊株を作成した。その結果、32個のうち2個(CDC14、GLC7)が必須遺伝子であり、残りの30種のPPase遺伝子破壊株は生育可能であることが分かった。遺伝子破壊が致死でない30種のPPaseについて、接合型の異なる破壊株をそれぞれ作成し、全ての組合わせ(435通り)で交雑とランダム胞子分離法法により二重破壊株を作成した。その結果、430組みの二重破壊株が生存可能であり、5組みの二重破壊株(Δsit4Δptc1、Δsit4Δptc3、Δsit4Δptc4、Δsit4Δppg1、Δsit4Δynr022c)が致死であることがわかった。また、二重破壊株が生育可能であった430株について、網羅的な表現型の解析を目指した。その結果、現在までに調べた温度感受性、炭素源資化性、塩感受性、薬剤感受性表現型について、約100株がなんらかの表現型を示した。そこで、それらの全てについて、野生型株と雑種二倍体を作成し、四分子分析を行なったところ、Δpph21Δpph22およびΔppz1Δppz2二重破壊株が示す37oCでの増殖遅延表現型、またΔptc2Δmsg5二重破壊株が示すNaCl、CaCl2感受性表現型、Δptp2Δmsg5二重破壊株が示すCaCl2感受性の表現型が実際に二重破壊によって引き起こされていることがわかった。本研究によって世界で初めて構築されたPPase二重破壊株のシリーズを利用して、今後は、さらに多くの表現型を網羅的に解析し、それぞれのPPaseがどのような細胞生理に関与するかを明らかにしたい。また、PPase破壊株における約250あるリン酸化タンパク質のリン酸化レベルの解析(ホスホプロテオーム解析)も行う予定である。
The regulation of cell function is the key to the development of cell function. The total base alignment of the species, budding yeast, 117 species of PKase and 32 species of PPase are presumed to exist. About 250 species of budding yeasts were identified and reported. PKase was identified and purified. PPase was identified and purified. In this study, we focused on the phenotypic analysis of PPases from 32 species of budding yeasts, isolated strains, complete combinations, double breaks, and ensembles in eukaryotes. The purpose of this study is to investigate the relationship between the two genes. W303-1A(a-conjugating type) strain was produced by the method of morphological transformation. The results were 32 (CDC14, GLC7) and 30 (PPase 7). 30 kinds of PPase were isolated from each other, and all kinds of PPase were isolated from each other. The results showed that 430 groups of double broken plants could survive, 5 groups of double broken plants (Δsit4Δptc1, Δsit4Δptc3, Δ sit 4 Δ ptc 4, Δsit4Δppg1, Δsit4Δynr022c) could die. There are 430 plants with high fertility potential and a comprehensive analysis of their phenotypes. As a result, about 100 phenotypes of plants with temperature sensitivity, carbon source sensitivity, carbon sensitivity and carbon sensitivity were shown. The diploids of wild type and wild type strains were prepared, tetramolecular analysis was performed, Δpph21Δpph22 and Δppz1Δppz2 double disruption strains showed the propagation delay phenotype at 37 ℃, Δptc2Δmsg5 double disruption strains showed the NaCl and CaCl2-sensitive phenotype, Δ ptp2Δ msg 5 double disruption strains showed the CaCl2-sensitive phenotype. This research is aimed at utilizing the research materials of PPase double mutants that have been constructed for the first time in the world, and will be used to analyze many phenotypes in the future. It is clear that PPase is related to cell physiology. The PPase gene was detected at about 250 ℃.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

原島 俊其他文献

農芸化学の事典(鈴木昭憲・荒井綜一編)(ゲノムプロジェクトと生物情報科学)
农业化学百科全书(由铃木昭典和新井宗一编辑)(基因组计划和生物信息学)
  • DOI:
  • 发表时间:
    2003
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Mizukami A.;Nagamori E.;Takakura Y.;Matsunaga S.;Kaneko Y.;Kajiyama S.;Harashima S.;Kobayashi A.;Fukui K.;原島 俊;原島 俊;原島 俊
  • 通讯作者:
    原島 俊
高温・酸ストレス条件下でのPKC1 GAS1過剰発現出芽酵母による高効率エタノール発酵
在高温和酸胁迫条件下使用过表达酿酒酵母的 PKC1 GAS1 进行高效乙醇发酵
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    杉山峰崇;大原佑介;荒木泰治;則木奈都子;笹野 佑;原島 俊
  • 通讯作者:
    原島 俊
出芽酵母におけるゲノム網羅的な染色体部分重複と表現型解析
酿酒酵母的全面染色体重复和表型分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    杉山峰崇;Waranya Natesuntorn;松原裕樹;林 達也;原島 俊
  • 通讯作者:
    原島 俊
出芽酵母プロテインホスファターゼのゲノムサイエンス
酿酒酵母蛋白磷酸酶的基因组科学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    笹野 佑;Yeon-Hee Kim;杉山 峰崇;原島 俊;原島 俊
  • 通讯作者:
    原島 俊
高温耐性出芽酵母C3723株におけるCDC19-C遺伝子による高温耐性化
高温耐受酿酒酵母菌株 C3723 CDC19-C 基因的高温耐受性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    木村駿太;王 琨;○笹野 佑;杉山峰崇;原島 俊
  • 通讯作者:
    原島 俊

原島 俊的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('原島 俊', 18)}}的其他基金

出芽酵母において高次倍数性の限界はいかにして決まっているか
酿酒酵母中高倍性的限度是如何确定的?
  • 批准号:
    23K18013
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
出芽酵母におけるゲノムの再構成技術の開発と応用
酿酒酵母基因组重建技术的开发及应用
  • 批准号:
    19658132
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
出芽酵母におけるゲノムの再編技術の開発と有用菌株育種への応用
酿酒酵母基因组重排技术的开发及其在有用菌株选育中的应用
  • 批准号:
    06F06450
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
出芽酵母プロテインホスファターゼの機能ゲノム科学
酿酒酵母蛋白磷酸酶的功能基因组学
  • 批准号:
    16013227
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
出芽酵母プロテインホスファターゼの機能ゲノム科学
酿酒酵母蛋白磷酸酶的功能基因组学
  • 批准号:
    15013231
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
出芽酵母プロテインホスファターゼの機能ゲノム科学
酿酒酵母蛋白磷酸酶的功能基因组学
  • 批准号:
    02F00523
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
出芽酵母プロテインホスファターゼの機能ゲノム科学
酿酒酵母蛋白磷酸酶的功能基因组学
  • 批准号:
    14014224
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
出芽酵母の全プロテインホスファターゼ遺伝子二重破壊株のトランスクリプトーム、プロテオーム解析
酿酒酵母所有蛋白磷酸酶基因双破坏菌株的转录组和蛋白质组分析
  • 批准号:
    13206039
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
ゲノムの大規模改変技術の開発とゲノム構築原理の解明
大规模基因组修饰技术发展及基因组构建原理阐明
  • 批准号:
    12206052
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
出芽酵母全プロテインホスファターゼ遺伝子二重破壊株の作製と機能解析
酿酒酵母总蛋白磷酸酶基因双破坏菌株的构建及功能分析
  • 批准号:
    11149215
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)

相似海外基金

プロテインホスファターゼPPM1Kの質的変化に着目した肥満介入戦略
关注蛋白磷酸酶PPM1K质变的肥胖干预策略
  • 批准号:
    24K14627
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
植物水ストレス応答におけるB3-RAFキナーゼの新たな制御機構
B3-RAF激酶在植物水分胁迫反应中的新调控机制
  • 批准号:
    23K05800
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
タンパク質リン酸化を介した植物の環境適応機構の解明
通过蛋白质磷酸化阐明植物的环境适应机制
  • 批准号:
    22KJ1616
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ミトコンドリア局在ホスファターゼによるミトコンドリア機能とストレス応答の制御
线粒体定位磷酸酶对线粒体功能和应激反应的调节
  • 批准号:
    23K06117
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Functional optimization and establishment of comprehensive evaluation of membrane-permeable aptamers for drug development using AI technology
利用AI技术进行药物开发的透膜适配体功能优化及综合评价建立
  • 批准号:
    22H02917
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Analysis on protein phosphatases that regulate turnover of ethylene biosynthesis ACC synthase
调节乙烯生物合成 ACC 合酶周转的蛋白磷酸酶分析
  • 批准号:
    21H02185
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
プロテインホスファターゼPP2Cεが制御する小胞体ダイナミクスの機構解明
蛋白磷酸酶PP2Cε控制内质网动力学的机制
  • 批准号:
    21K05508
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
プロテインホスファターゼ2Aによる平滑筋収縮増強・張力保持促進のメカニズム
蛋白磷酸酶2A增强平滑肌收缩和促进张力维持的机制
  • 批准号:
    21K06785
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Identification of cancer suppressor genes that suppress tumorigenesis by mutant KRAS- involvement in pancreatic cancer
鉴定通过突变 KRAS 参与胰腺癌抑制肿瘤发生的抑癌基因
  • 批准号:
    20K07436
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Activation mechanisms of B2/B3 Raf kinases in plant stress responses
B2/B3 Raf 激酶在植物逆境反应中的激活机制
  • 批准号:
    20K06680
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了