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ウェルシュ菌ゲノムにおける病原性調節ネットワークの包括的解析

ウェルシュ菌ゲノムにおける病原性調節ネットワークの包括的解析
产气荚膜梭菌基因组毒力调控网络的综合分析
批准号:
12206015
负责人:
清水 徹
金额:
$0.0万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 --

项目摘要

项目成果

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平成12年度は、ガス壊疽の起因菌、ウェルシュ菌の全ゲノム配列の決定が終了し、3,031,430bpの染色体塩基配列が明らかとなった。ウェルシュ菌染色体のG+C含量は28.5%と著しく低く、計10個のrRNA遺伝子と96個のtRNAが存在していた。また、芽胞形成に関与する遺伝子も計62個が同定され、芽胞形成菌としての特徴が明らかとなった。2,660の遺伝子が同定され、すべての遺伝子についてアノテーション作業を行い、それらの機能を分類した。約55%の遺伝子について機能が推測でき、残りについては機能未知の遺伝子として分類した。これらの作業を通じて、ウェルシュ菌はアミノ酸代謝系の遺伝子のほとんどが欠損しており、外界からのアミノ酸獲得が不可欠なこと、嫌気性菌の大きな特徴であるTCA cycleが欠損し、発酵系の遺伝子群が存在すること、ATPaseとしてF-typeとV-typeの両方を持つこと、輸送系の遺伝子がゲノムサイズに比して豊富に存在し、外界からの物質の取込みに寄与していること、などが新たな知見として得られた。ウェルシュ菌の新たな病原遺伝子候補としては、従来より同定されている遺伝子の他に、数種の溶血毒素遺伝子、腸管毒素に類似した毒素遺伝子、2つのシアリダーゼ遺伝子、さらに5つのヒアルロニダーゼ遺伝子が新たに発見された。これらの遺伝子のゲノム上の位置はいわゆるpathogenicity islandを形成せず、染色体上にちりばめられて存在していた。これらの病原遺伝子群のうち、5つのヒアルロニダーゼの遺伝子の発現をウェルシュ菌total RNAを用いて検討した結果、5つのヒアルロニダーゼ遺伝子のうち、3つがウェルシュ菌の二成分制御系VirR/VirSシステムによって負に転写調節されていることが明らかとなった。また、グルコース存在下においてヒアルロニダーゼ遺伝子の発現を調べると、明らかなカタボライト抑制が見られることが明らかとなった。このことは、ウェルシュ菌のヒアルロニダーゼ遺伝子群が環境や細胞内情報伝達系によって発現制御を受けることを示しており、本菌の病原性発現に密接に関わっていることを示すものと考えられた。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Tohru Shimizu: "Genomic Map of Clostridium perfringens Strain13"Microbiol.and Immunol.. 45(2). 179-189 (2001)
Tohru Shimizu:“产气荚膜梭菌菌株 13 的基因组图谱”微生物学和免疫学.. 45(2)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Saera Banu: "Identification of novel VirR/VirS-regulated genes in Clostoridium perfringens"Molecular Microbiology. 35(4). 854-864 (2000)
Saera Banu:“产气荚膜梭菌中新型 VirR/VirS 调节基因的鉴定”分子微生物学。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Kaori Ohtani: "Genetic Analysis of the ycgJ-metB-cysK-ygaG Operon Negative Regulated bi the VirR/VirS System in Clostoridium perfringens"Microbiol.and Immunol.. 44(6). 525-528 (2000)
Kaori Ohtani:“产气荚膜梭菌中 VirR/VirS 系统对 ycgJ-metB-cysK-ygaG 操纵子负调节的遗传分析”微生物学和免疫学 44(6)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
病原細菌の新規染色体複製システムの解明
  • 批准号:
    24659195
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.41万
  • 财政年份:
    2012
  • 负责人:
    清水 徹
  • 依托单位:
ウエルシュ菌ゲノムにおける病原性調節ネットワークの包括的解析
  • 批准号:
    13206005
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
  • 资助金额:
    $4.16万
  • 财政年份:
    2001
  • 负责人:
    清水 徹
  • 依托单位:
ウェルシュ菌における二成分制御系 Virレギュロンの解析
  • 批准号:
    08670299
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $1.28万
  • 财政年份:
    1996
  • 负责人:
    清水 徹
  • 依托单位:
ウェルシュ菌の病原遺伝子調節ネットワークの解析
  • 批准号:
    07670297
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $1.34万
  • 财政年份:
    1995
  • 负责人:
    清水 徹
  • 依托单位:
海外基金