ウエルシュ菌ゲノムにおける病原性調節ネットワークの包括的解析
ウエルシュ菌ゲノムにおける病原性調節ネットワークの包括的解析
批准号:
13206005
负责人:
清水 徹
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 --
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平成13年度は、ガス壊疽の起因菌、ウェルシュ菌の全ゲノム配列の決定および解析が終了し、その成果をPNASに報告した。3,031,430bpの染色体塩基配列が明らかとなり、染色体上には2,660の遺伝子が同定され、すべての遺伝子についてアノテーション作業を行い、それらの機能を分類した。約55%の遺伝子について機能が推測でき、残りについては機能未知の遺伝子として分類した。ウェルシュ菌はアミノ酸代謝系の遺伝子のほとんどが欠損し、外界からのアミノ酸獲得が不可欠なことが明かとなり、ウェルシュ菌の新たな病原遺伝子(少なくとも26種類)や従来より同定されている病原遺伝子によって宿主から栄養を取り込むことが病原性の本態であることが推察された。こうして明かとなった病原遺伝子の発現調節に関しては、二成分制御系、VirR/VirSシステムがグローバルな調節系として知られているが、本研究により新たな病原遺伝子制御機構が明かとなった。VirR/VirSシステムに調節される遺伝子、hyp7の解析を行なったところ、本遺伝子領域はα-毒素、κ-毒素遺伝子の発現を正に調節する二次的調節遺伝子であることが明かとなったが、その本体はhyp7遺伝子のコードするタンパクではなく、RNA(VR-RNA)そのものが毒素遺伝子の転写を調節することが明かとなった。ウェルシュ菌における転写調節RNAの報告は本研究が初めてであり、今後全ゲノムにおける同様の調節RNAの解析が期待される。また、本研究におけるウェルシュ菌ゲノムに存在する1uxS遺伝子の解析を通じて、1uxS遺伝子はウェルシュ菌からのオートインデューサー(AI-2)の産生に関与していることが明かとなった。1uxS遺伝子による細胞間情報伝達により、毒素遺伝子の1つであるθ-毒素遺伝子の転写が調節され、α-毒素、κ-毒素の産生も景響を受けていることが明かとなった。ウェルシュ菌の病原性発現に対して細胞間コミュニケーションが関与することが本研究ではじめて明かとなり、混合感染時における他の細菌とのコミュニケーションや本菌感染に対する治療法などの研究に非常に有用な知見が得られた。今後はウェルシュ菌ゲノム情報を利用したDNAチップの作製を行ない、本菌の病原性発現調節機構をよりグローバルに行なう予定である。
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T.Shimizu, et al.: "Complete genome sequence of Clostridium perfringens, an anaerobic flesh-eater"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99(2). 996-1001 (2002)
T.Shimizu 等人:“产气荚膜梭菌(一种厌氧食肉动物)的完整基因组序列”Proc.
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
K.Ohtani, et al.: "A novel RNA molecule regulates the expression of extracellular toxins in Clostridium perfringens"FEMS Microbiol. Lett.. (in press).
K.Ohtani 等人:“一种新型 RNA 分子调节产气荚膜梭菌细胞外毒素的表达”FEMS Microbiol。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
T.Shimizu, et al.: "Clostridial VirR/VirS regulon involves a regularory RNA molecule for expression of toxins"Mol. Microbiol.. 43(1). 257-265 (2002)
T.Shimizu 等人:“梭菌 VirR/VirS 调节子涉及用于表达毒素的常规 RNA 分子”Mol.
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
K.Ohtani, et al.: "The luxS gene is involved in cell-cell signaling for toxin production Clostridium perfringens"Mol. Microbiol.. (in press).
K.Ohtani 等人:“luxS 基因参与产气荚膜梭菌毒素产生的细胞间信号转导”Mol.
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
T.Shimizu, et al.: "Sequence heterogeneity of the ten rRNA operons in Clostridium perfringens"Syst. Appl. Microbiol.. 24. 149-156 (2001)
T.Shimizu 等人:“产气荚膜梭菌中 10 个 rRNA 操纵子的序列异质性”Syst。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
病原細菌の新規染色体複製システムの解明
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批准号:24659195
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.41万
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财政年份:2012
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负责人:清水 徹
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依托单位:
ウェルシュ菌ゲノムにおける病原性調節ネットワークの包括的解析
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批准号:12206015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:清水 徹
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依托单位:
ウェルシュ菌における二成分制御系 Virレギュロンの解析
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批准号:08670299
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:清水 徹
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依托单位:
ウェルシュ菌の病原遺伝子調節ネットワークの解析
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批准号:07670297
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1995
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负责人:清水 徹
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依托单位:
ウェルシュ菌における病原因子のグローバル制御機構の解析
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批准号:06770194
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:清水 徹
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依托单位:
ウェルシュ菌・theta-毒素遺伝子発現調節機構の分子生物学的解析
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批准号:05770181
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1993
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负责人:清水 徹
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依托单位:
ウェルシュ菌θ-毒素産生調節遺伝子(pfoR)の分子生物学的解析
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批准号:04770256
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1992
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负责人:清水 徹
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依托单位:
海外基金