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DNAアレイを用いた転写因子の標的配列同定法の開発

DNAアレイを用いた転写因子の標的配列同定法の開発
开发使用 DNA 阵列识别转录因子靶序列的方法
批准号:
12878131
负责人:
高橋 直樹
金额:
$1.41万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 --

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项目成果

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本研究は、転写因子の標的配列を明らかにする新しい方法を開発するというものである。転写因子の標的配列を同定する方法としては、ランダムな配列を含む合成オリゴヌクレオチドを、大腸菌発現系を用いて作製した蛋白を用い、抗体カラムやゲルシフトなどで精製をした後、ベクターにクローニングし、塩基配列を決定するという方法がある。しかしこの方法は、精製、クローニング、そして少なくとも数十の独立したクローンの塩基配列の決定と、かなり時間と手間がかかる方法である。本申請の方法は、DNAアレイとハイブリダイゼーションを用いるという方法であり、もしこの方法が確立すれば、きわめて短時間に多くの転写因子の標的配列を特定することができると考え以下の研究を行った。標的配列既知の酵母(MCM1,Matα2)、マウス(Hox)の転写因子に(His)6タグを結合した大腸菌発現コンストラクトを作製しタグ付き転写因子を調製した。MCM1,Matα2については、ランダムな配列を含むオリゴヌクレオチドの混合物から標的配列を濃縮できることをPCR法によって確認した。またDNAアレイによる未知結合配列の検出が可能かどうかは、1000スポットのアレイを試作し、数十倍以上の濃縮があれば検出ができることを確認した。
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会议论文
データ伝送エネルギーコスト低減を目指す高効率Si基板上半導体薄膜レーザ実現
  • 批准号:
    23KJ0935
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.15万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    高橋 直樹
  • 依托单位:
食品に含まれる催奇性の新しい検出法の開発
  • 批准号:
    19658051
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.24万
  • 财政年份:
    2007
  • 负责人:
    高橋 直樹
  • 依托单位:
Mab21遺伝子の性行動制御機構の解明
  • 批准号:
    19040005
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $4.16万
  • 财政年份:
    2007
  • 负责人:
    高橋 直樹
  • 依托单位:
2光子励起顕微鏡によるinvivo観察のための固定具の開発
  • 批准号:
    18920006
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
  • 资助金额:
    $0.42万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    高橋 直樹
  • 依托单位:
海外基金