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メダカヒレ再生関連遺伝子の網羅的スクリーニングとゲノムマッピング

青鳉鳍再生相关基因的全面筛选及基因组图谱

基本信息

批准号：
13202020
负责人：
工藤明
金额：
$ 3.84万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13202020/
关键词：
EST メダカヒレ再生ゲノムマッピング

项目摘要

1.ESTクローンとその解析再生芽が形成され、幹細胞が分化開始する時期であるメダカヒレ再生3日目のcDNAライブリーを構築し、遺伝研において10000シークエンスが終了した。その結果8901個のシークエンスが得られ、そのうち3454種類の遺伝子が含まれ、1個しかシークエンスがなかったものが2323個あり全体の67.2%を占めた。最も再生が盛んな切断後10日目のESTシークエンスとRNA in-situによる発現解析の結果、クローン13c18はヒレ切断2日目より発現を開始し、再生芽に特異的発現を示すことが明らかになった。さらに再生の進行に伴い伸張ヒレの先端の未分化な再生芽領域に継続的に発現を示すものの、未切断ヒレには発現は見られない。またこの発現パターンは再生芽形成に関与すると考えられるfgfr1に一致し、13c18は再生の開始に重要な機能を持っている。2.メダカ遺伝子のゲノムマッピング (1)胸びれを欠くpl (pectoral fin-less)変異体と、赤血球の形成に欠損を示すwho (white out)変異体について、マッピングを行った。plはLG10に位置することがわかり、0.2cM以内の場所に3種類のDNAマーカーを同定した。whoはLG12にマップされ、0.5cM以内に位置するDNAマーカーを1つ同定した。plとwhoの原因遺伝子を同定するために、それぞれのDNAマーカーをもつBACクローンを単離して、染色体歩行を開始した。また心臓形成に異常を示すrbiやbhtについてもマッピングを試みている。(2)血管で発現するfli、心臓で発現するtbx5、骨形成に関与するbmp1などの37個の遺伝子について、染色体地図上にマッピングを行った。現在解析中の突然変異の近傍にマッピングされた遺伝子はなく、原因遺伝子の候補は得られていない。引き続きESTのマッピングを進めている。

1. EST analysis of regeneration bud formation, stem cell differentiation start period, 3 days of cDNA regeneration, research and development of more than 10000 years, the end. 8901 The results of EST analysis and RNA in-situ analysis on the 10th day after the most successful regeneration, EST analysis and RNA in-situ analysis on the 13th day after the most successful regeneration, EST analysis and RNA in-situ analysis on the 2nd day after the most successful The regeneration process is accompanied by elongation and development of undifferentiated buds at the tip. The development of this new plant is related to the formation of regeneration buds and the maintenance of important functions in the initiation of regeneration. 2. The number of cells in a cell is 1. The number of cells in a cell is 1. The location of pl LG10 is the same for 3 kinds of DNA within 0.2cM. Who is LG12, 0.5cM or less? Pl, who is responsible for DNA sequencing, and BAC sequencing. The formation of abnormal conditions in the heart of the heart, the formation of abnormal conditions in the heart of the heart (2)Blood vessel development, heart development, tbx5, bone formation, bmp1, 37 gene development, chromosome development Now analyze the sudden change in the near future, the cause of the change in the candidate引き続きESTのマッピングを进めている。