ヒト6番染色体に存在する新規癌抑制遺伝子の同定と単離

位于人类6号染色体上的新型抑癌基因的鉴定和分离

• 批准号: 13214026
• 负责人: 小川 誠司
• 金额: $ 2.69万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13214026/
• 关键词: 6番染色体長腕; 悪性リンパ腫; FISH; 癌抑制遺伝子; ホモ接合性欠失; GIRK2遺伝子; Blimp-1遺伝子; 造血器腫瘍

ヒト6番染色体長腕の欠失は悪性リンパ腫をはじめとした造血器腫瘍や種々の固形腫瘍で高頻度に認められる異常である。こうした染色体の欠失領域には癌抑制遺伝子座が存在することが存在することが想定されている。本研究の目的は、多数の造血器腫瘍について6番染色体長腕上の整列化されたゲノムクローンを用いたFISH法による欠失解析によりヒト6番染色体長腕の欠失の標的領域を同定することにより、欠失の責任遺伝子を明らかにし、6番染色体長腕の欠失による腫瘍化の機序を解明することである。6q14から6q23に存在する64個のゲノムプローブを用いて造血器腫瘍細胞株140例、造血器腫瘍患者検体232例の計372例について欠失解析を行った。欠失は66検体に観察され、D1(D6S449 and AFMA084ZE9)、D2(D6S447 and WI-5694)、D3(WI-4066 and D6Sl698)、D4(WI-4964 and WI-9588)、D5(CHLC.GATA23B17 and WI-4227)の計5つの独立した欠失領域が同定され、6番染色体長腕には複数の癌抑制遺伝子座が存在する可能性が示唆された。欠失頻度はD6S283を含む約500kbの領域(D2)とWI4066を含む約500kbの領域(D3)で最も高くついでAFMA074zG9を含む約300kbの欠失領域(D1)で高い欠失頻度が観察された。D1の欠失領域についてはこの欠失全体を含むPAC/BACコンティグを作成し、その全塩基配列を決定した。得られた塩基配列をもとにBLAST searchを行った結果、同最小欠失領域にコードされる唯一の構造遺伝子としてglutamate/kinate receptorの一つであるGIRK2遺伝子が同定された。一方、D2領域に関しては、PAC101M23によるFISH解析の結果、ATL由来細胞株においてホモ接合性欠失が認められたため、さらにサザン法を用いた詳細な欠失解析の結果、悪性リンパ腫由来の3つの造血器腫瘍細胞株で同領域のホモ接合性欠失が認められた。これら3つの細胞株で共通にホモ接合性欠失を認める領域には唯一の構造遺伝子して、B細胞の終末分化に必須の遺伝子と考えられているBlimp1がコードされていることが明らかとなった。患者腫瘍検体におけるBlimp1遺伝子の腫瘍特異的変異の解析から、3例の患者においてBlimp1の腫瘍特異的変異が同定され、本遺伝子がD3領域における標的癌抑制遺伝子である可能性が強く示唆された。

The chromosome length of the chromosome 6 is not long, and the sex is abnormal. The presence of cancer suppressor loci in the absence of chromosome deletion is not an option. The aim of this study was to identify the missing target region of chromosome 6 by FISH in most hematopoietic tumors and to elucidate the mechanism of tumorigenesis of chromosome 6. There were 64 samples from 6q14 to 6q23, and 140 hematopoietic tumor cell lines, 232 hematopoietic tumor patients, and 372 samples from 6q23. Missing 66-body inspection, D1 (D6S449 and AFMA084ZE 9), D2 (D6S447 and WI-5694), D3 (WI-4066 and D6S1698), D4 (WI-4964 and WI-9588), D5 (CHLC.GATA23B17 and WI-4227), respectively. The missing frequency is from D6S283 to about 500 kb (D2) and WI 4066 to about 500 kb (D3). AFMA074 zG9 to about 300 kb (D1). D1 's missing area is determined by the missing area's PAC/BAC matrix. The result of BLAST search is the same as that of GIRK2 gene. The results of FISH analysis in D2 domain, PAC 101 M23 domain, ATL derived cell line, PAC 101 M23 domain, PAC 101 domain, PAC 101 M23 domain, PAC 101 domain, PAC 101 M23 domain, PAC 101 M23 domain, PAC 101 domain, PAC 101 M23 domain The cell lines of these three species are commonly known for their lack of zygosity, and for their unique structural genes, which are essential for terminal differentiation of B cells. Analysis of tumor-specific variation in Blimp1 gene in patients with tumor-related diseases, identification of tumor-specific variation in Blimp1 gene in 3 patients, and strong indication of the possibility of target cancer suppressor gene in D3 domain.

项目成果

半下石 明: "Mutations of Chk2 in Primary Hematopoietic Neoplasms"Blood. (in press).

Akira Hanshitaishi：“原发性造血肿瘤中 Chk2 的突变”血液（正在出版）。

今井陽一: "Mutations of the Smad4 gene in acute myelogeneous leukemia and their functional implications in leukemogenesis"Oncogene. 20. 88-96 (2001)

Yoichi Imai：“急性髓性白血病中 Smad4 基因的突变及其在白血病发生中的功能意义”Oncogene 20. 88-96 (2001)。

王 莉莉: "The breakpoint analysis of unbalanced t(1;7)(q10;p10) translocation"Exp. Hematology. 29. 14-14 (2001)

王丽丽：“不平衡 t(1;7)(q10;p10) 易位的断点分析”Exp. 29. 14-14 (2001)。

上 昌広: "Use of real-time PCR on blood samples for diagnosis of invasive aspergillosis"Clinical Infectious Diseases. 33. 1504-1512 (2001)

Masahiro Kami：“使用实时 PCR 检测血液样本来诊断侵袭性曲霉病”《临床传染病》33. 1504-1512 (2001)。