ヒト染色体6qに存在する癌抑制遺伝子群の同定

人类染色体 6q 上肿瘤抑制基因的鉴定

• 批准号: 14026011
• 负责人: 小川 誠司
• 金额: $ 1.98万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14026011/
• 关键词: リンパ系腫瘍; 6q; アレイCGH; BAC; Blimp1; メチル化

6番染色体長腕の欠失はリンパ系造血器腫瘍で最も高頻度に観察される染色体異常の一つである。我々はこれまでにFISH法を用いた欠失解析によって、その標的遺伝子の候補の一つとしてBlimP1遺伝子を同定したが、6qには少なくとも6つの独立した欠失集積領域が確認されており、同領域には複数の癌抑制遺伝子の存在が想定される。そこで、本研究では、Blimp1の機能解析を進めるとともに、ゲノムアレイCGHを用いて網羅的に欠失領域の高解像度地図を作製することにより、6qの癌抑制遺伝子群を網羅的に同定することを計画した。(1)Blimp1の機能解析では、Blimp1のプロモーター領域のメチル化の解析により、本遺伝子の不活化がホモ接合性欠失や点突然変異のみでなく、CpGアイランドのメチル化によっても生ずることを明らかにするとともに、本蛋白が核内では二量体として存在し、300kDおよび350kDの蛋白と結合していることを明らかにした。また、Cre-LoxPシステムを用いたBlimP-1の条件的遺伝子欠損マウスの作成を行った。(2)CGHの基礎条件の検討とプローブDNAの調製p15/p16遺伝子座およびFISH法により欠失の状態を検討済みの領域、さらにX染色体およびY染色体に固有な塩基配列をプローブDNAとしてCGHの条件を検討し、以下の至適条件を決定した。(1)DNA:超音波処理による断片化を施したBAC/PAC DNA、2)DNA濃度2.0g/l以上、(3)Spotting溶液:3xSSC/1.5MTrimethylglycine溶液、(4)スライド:Corning GAPS aminosilan-corted slide、(5)Blocking : NPM法、(6)Labelling : post labelによるNick translation、(7)making : 80μg/2μgprobe、(8)Hybridization : 2xSSC, 10%dextran, 50% formamide。一方、6qのBAC/PACコンティグのDNA調製については、6q15-23領域のコンティグを校正する1250個のPAC/BACクローンの大量調製をほぼ完了した。次年度以降、実際の腫瘍検体を用いてアレイCGHによる解析を行う。

6. Chromosome abnormalities were detected most frequently in hematopoietic tumors. We use FISH to identify the presence of multiple cancer suppressor genes in the same domain, and to identify the presence of multiple cancer suppressor genes in the same domain. In this study, the function analysis of Blimp1 was carried out in the same way as that of CGH. (1) Functional analysis of Blimp1, analysis of Blimp1 protein domain, inactivation of this protein, sudden change of junction, CpG protein domain, protein Cre-Lox P-1 is used to create a condition for loss. (2) The basic conditions for CGH were discussed. The modulation of p15/p16 gene loci and FISH method were used to investigate the missing state, the X chromosome and the Y chromosome. (1)DNA: ultrasonic fragmentation;(2)DNA concentration above 2.0g/l;(3)Spotting solution:3xSSC/1.5M Trimethylglycine solution;(4) Sample:Corning GAPS aminosilan-corded slide;(5)Blocking : NPM method;(6)Labelling : post label: Nick translation;(7)Making : 80μg/2μ g probe;(8)Hybridization : 2xSSC, 10%dextran, 50% formamide. A large number of BAC/BAC modulations were completed in the field of BAC/PAC modulations in the square, 6q and 6q15 -23 regions. Next year, the analysis of the actual and actual tumor model was carried out.

项目成果

Hangaishi A, Ogawa S, et al.: "Mutations of Chk2 in primary hematopoietic neoplasms"Blood. 99. 3075-3077 (2002)

Hangaishi A、Okawa S 等人：“原发性造血肿瘤中 Chk2 的突变”血液。

Oiao Y, Ogawa S, et al.: "Identification of a Novel Fusion Gene, TTL, Fused to ETV6 in Acute Lymphoblastic Leukemia with t(12;13)(p13;q14), And Its Implication in Leukemogenesis"Leukemia. (in press). (2003)

Oiao Y、Okawa S 等人：“在具有 t(12;13)(p13;q14) 的急性淋巴细胞白血病中与 ETV6 融合的新型融合基因 TTL 的鉴定及其在白血病发生中的意义”白血病。

Saito A, Ogawa S, et al.: "Establishment of a quantitative method for detecting mixed chimerism using fluorescence-based PCR amplification of short tandem repeat markers after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in a Japanese population"Jap

Saito A、Okawa S 等人：“在日本人群中进行同种异体造血干细胞移植后，使用基于荧光的 PCR 扩增短串联重复标记物来检测混合嵌合现象的定量方法”

Nakamura F, Ogawa S, Izutsu K, et al.: "Should Young Patients with e19a2 type bcr/abl rearrangement undergo stem cell transplantation"Leukemia and Lymphoma. 44. 381-382 (2003)

Nakamura F、Okawa S、Izutsu K 等人：“患有 e19a2 型 bcr/abl 重排的年轻患者是否应该接受干细胞移植”白血病和淋巴瘤。

Ogawa S, Hangaishi A, Hirai, H: "Identification of candidate tumor suppressor genes from critical deletions of long arm of chromosome 6 in hematopoietic neoplasm."International Congress Series. 1246. 251-260 (2002)

Okawa S、Hangaishi A、Hirai、H：“从造血肿瘤中 6 号染色体长臂的关键缺失中鉴定候选肿瘤抑制基因。”国际大会系列。