膜タンパク質の高効率立体構造解析をめざした発現系作成から結晶化までのシステム構築
膜タンパク質の高効率立体構造解析をめざした発現系作成から結晶化までのシステム構築
批准号:
17681026
负责人:
永田 宏次
金额:
$19.55万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
中文摘要
平成18年度は、平成17年度に引き続き原核生物の膜タンパク質を大腸菌を宿主として発現させる系について検討する一方で、新たに真核生物の膜タンパク質を酵母を宿主として発現させる系について検討した。原核生物の膜タンパク質については、好熱細菌Thermus thermophilusと好熱古細菌Aeropyrum pernix岳の膜タンパク質、各53個、計106個について、pBAD(araBADプロモーター、Invitrogen)とpET-Mistic(T7プロモーター、枯草菌Bacillus subtilis由来の4回膜貫通型膜タンパク質Mistic(Roosild et al.,2005)との融合タンパク質発現ベクター、Novagen製品を改変)とに組み込むことを計画したが、一部の膜タンパク質遺伝子のベクターへの導入に難航し、結局pBADベクターに27個の膜タンパク質遺伝子を組み込み、その発現確認実験を行った。その結果、Flagタグ抗体を用いたWestern blotで、27個のうち15個の膜タンパク質について発現が確認された。特に、複数の輸送体膜タンパク質の発現量が非常に高いことが示され、結晶化用試料の調製が可能になった。真核生物の膜タンパク質については、ヒト、カイコガ、線虫、シロイヌナズナ、酵母の膜タンパク質、約50個を対象とした。膜タンパク質発現量の確認を効率のよく行うため、[α-mating factorのシグナル配列]-[膜タンパク質]-[GFP]を酵母S.cerevisiaeで発現させるベクターを構築した。現在、上記真核生物の膜タンパク質の発現確認を進めている。
英文摘要
平成18年度は、平成17年度に引き続き原核生物の膜タンパク質を大腸菌を宿主として発現させる系について検討する一方で、新たに真核生物の膜タンパク質を酵母を宿主として発現させる系について検討した。原核生物の膜タンパク質については、好熱細菌Thermus thermophilusと好熱古細菌Aeropyrum pernix岳の膜タンパク質、各53個、計106個について、pBAD(araBADプロモーター、Invitrogen)とpET-Mistic(T7プロモーター、枯草菌Bacillus subtilis由来の4回膜貫通型膜タンパク質Mistic(Roosild et al.,2005)との融合タンパク質発現ベクター、Novagen製品を改変)とに組み込むことを計画したが、一部の膜タンパク質遺伝子のベクターへの導入に難航し、結局pBADベクターに27個の膜タンパク質遺伝子を組み込み、その発現確認実験を行った。その結果、Flagタグ抗体を用いたWestern blotで、27個のうち15個の膜タンパク質について発現が確認された。特に、複数の輸送体膜タンパク質の発現量が非常に高いことが示され、結晶化用試料の調製が可能になった。真核生物の膜タンパク質については、ヒト、カイコガ、線虫、シロイヌナズナ、酵母の膜タンパク質、約50個を対象とした。膜タンパク質発現量の確認を効率のよく行うため、[α-mating factorのシグナル配列]-[膜タンパク質]-[GFP]を酵母S.cerevisiaeで発現させるベクターを構築した。現在、上記真核生物の膜タンパク質の発現確認を進めている。
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Crystal structure of monomeric sarcosine oxidase from Bacillus sp. NS-129 revcals multiple conformations at the active-site loop.
芽孢杆菌属单体肌氨酸氧化酶的晶体结构。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Proceedings of the Japan Academy, Ser.B 81
影响因子:
--
作者:
[Nagata, K et al.(計11名)]
通讯作者:
K et al.(計11名)
DOI:
10.1002/prot.20778
发表时间:
2006-02-01
期刊:
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
影响因子:
2.9
作者:
[Miyakawa, T, Lee, WC, Tanokura, M]
通讯作者:
Tanokura, M
Crystal structure of the short-chain flavin reductase HpaC from Sulfolobus tokodaii strain 7.
Sulfolobus tokodaii 菌株 7 的短链黄素还原酶 HpaC 的晶体结构。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Proceedings of the Japan Academy, Ser.B 81
影响因子:
--
作者:
[Okai, M., Kudo, N., Nagata, K., Lee, W.C., Kamo, M., Tanokura, M.]
通讯作者:
M.
DOI:
10.2183/pjab.81.459
发表时间:
2005-12-01
期刊:
PROCEEDINGS OF THE JAPAN ACADEMY SERIES B-PHYSICAL AND BIOLOGICAL SCIENCES
影响因子:
3.1
作者:
[Maruoka, S, Lee, WC, Tanokura, M]
通讯作者:
Tanokura, M
Crystallization and preliminary X-ray analysis of human S100A13
人S100A13的结晶和初步X射线分析
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Acta Crystallographica Section F 62
影响因子:
--
作者:
[Fabiana, Lica, Imai]
通讯作者:
Imai
共 12 条
複数のジスルフィド結合を含む組換タンパク質の高効率巻き戻し系の確立と立体構造解析
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批准号:14780470
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2002
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负责人:永田 宏次
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依托单位:
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
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批准号:11142205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:永田 宏次
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依托单位:
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
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批准号:10161203
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1998
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负责人:永田 宏次
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依托单位:
長期記憶に関わる転写因子CREBのリン酸化による活性制御の分子機構の解明
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批准号:09780556
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1997
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负责人:永田 宏次
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依托单位:
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
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批准号:09265219
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:永田 宏次
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依托单位:
長期記憶に関わる転写因子CREBのリン酸化による活性制御の分子機構の解明
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批准号:08780571
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1996
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负责人:永田 宏次
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依托单位:
カイコ前胸腺刺激ホルモンのNMRによる立体構造解析と機能相関
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批准号:08276218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:永田 宏次
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依托单位:
国内基金
海外基金
嗜热菌Thermus thermophilus HB8铁硫簇SUF合成途径的研究
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批准号:31070067
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项目类别:面上项目
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资助金额:33.0万元
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批准年份:2010
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负责人:刘晓晴
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依托单位: