膜タンパク質の高効率立体構造解析をめざした発現系作成から結晶化までのシステム構築
从表达系统创建到结晶的系统构建,用于高效膜蛋白三维结构分析
基本信息
- 批准号:17681026
- 负责人:
- 金额:$ 19.55万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
- 财政年份:2005
- 资助国家:日本
- 起止时间:2005 至 2006
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
平成18年度は、平成17年度に引き続き原核生物の膜タンパク質を大腸菌を宿主として発現させる系について検討する一方で、新たに真核生物の膜タンパク質を酵母を宿主として発現させる系について検討した。原核生物の膜タンパク質については、好熱細菌Thermus thermophilusと好熱古細菌Aeropyrum pernix岳の膜タンパク質、各53個、計106個について、pBAD(araBADプロモーター、Invitrogen)とpET-Mistic(T7プロモーター、枯草菌Bacillus subtilis由来の4回膜貫通型膜タンパク質Mistic(Roosild et al.,2005)との融合タンパク質発現ベクター、Novagen製品を改変)とに組み込むことを計画したが、一部の膜タンパク質遺伝子のベクターへの導入に難航し、結局pBADベクターに27個の膜タンパク質遺伝子を組み込み、その発現確認実験を行った。その結果、Flagタグ抗体を用いたWestern blotで、27個のうち15個の膜タンパク質について発現が確認された。特に、複数の輸送体膜タンパク質の発現量が非常に高いことが示され、結晶化用試料の調製が可能になった。真核生物の膜タンパク質については、ヒト、カイコガ、線虫、シロイヌナズナ、酵母の膜タンパク質、約50個を対象とした。膜タンパク質発現量の確認を効率のよく行うため、[α-mating factorのシグナル配列]-[膜タンパク質]-[GFP]を酵母S.cerevisiaeで発現させるベクターを構築した。現在、上記真核生物の膜タンパク質の発現確認を進めている。
In 2018 and 2017, the development of prokaryotic membrane proteins and Escherichia coli hosts was discussed. In 2017, the development of eukaryotic membrane proteins and yeast hosts was discussed. Prokaryote membrane types include 53 membrane types each, 106 membrane types, pBAD(araBAD), Invitrogen), pET-Mistic(T7), Bacillus subtilis derived from 4-loop membrane types, Thermus thermophilus and Aeropyrum pernix (Roosild et al., 2005) The integration of 27 membrane components into Novagen's product development plan and Novagen's product development plan was completed. The results showed that 15 of the 27 samples were identified by Western blot. In particular, the amount of emission of a plurality of carrier films is very high, indicating that the preparation of crystallization samples is possible. Eukaryotic membrane proteins, such as yeast, etc. The efficiency of membrane quality production was confirmed by the construction of [α-mating factor]-[membrane quality]-[GFP] yeast S.cerevisiae. Now, the identification of eukaryotic membrane formation and quality development is reported.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crystal structure of monomeric sarcosine oxidase from Bacillus sp. NS-129 revcals multiple conformations at the active-site loop.
芽孢杆菌属单体肌氨酸氧化酶的晶体结构。
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nagata;K et al.(計11名)
- 通讯作者:K et al.(計11名)
Crystal structure of the YjgF/YER057c/UK114 family protein from the hyperthermophilic Archaeon Sulfolobus tokodaii strain 7
- DOI:10.1002/prot.20778
- 发表时间:2006-02-01
- 期刊:
- 影响因子:2.9
- 作者:Miyakawa, T;Lee, WC;Tanokura, M
- 通讯作者:Tanokura, M
Crystal structure of the short-chain flavin reductase HpaC from Sulfolobus tokodaii strain 7.
Sulfolobus tokodaii 菌株 7 的短链黄素还原酶 HpaC 的晶体结构。
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Okai;M.;Kudo;N.;Nagata;K.;Lee;W.C.;Kamo;M.;Tanokura;M.
- 通讯作者:M.
Crystal structure of glutamine amidotransferase from Pyrococcus horikoshii OT3
- DOI:10.2183/pjab.81.459
- 发表时间:2005-12-01
- 期刊:
- 影响因子:3.1
- 作者:Maruoka, S;Lee, WC;Tanokura, M
- 通讯作者:Tanokura, M
Crystallization and preliminary X-ray analysis of human S100A13
人S100A13的结晶和初步X射线分析
- DOI:
- 发表时间:2006
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Fabiana;Lica;Imai
- 通讯作者:Imai
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
永田 宏次其他文献
新規 phosphoserine phosphatase の性状解析と生物内分布
新型磷酸丝氨酸磷酸酶的表征和生物分布
- DOI:
- 发表时间:
2012 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
千葉 洋子;堀田 彰一朗;大塚 淳;新井 博之;永田 宏次;石井 正治;田之倉 優;五十嵐 泰夫 - 通讯作者:
五十嵐 泰夫
腸球菌のクォーラムセンシングを制御する環状ペプチドフェロモン(GBAP)の構造および機能解析
控制肠球菌群体感应的环肽信息素 (GBAP) 的结构和功能分析
- DOI:
- 发表时间:
2009 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西口 賢三;永田 宏次;佐藤 まみ;田之 倉優;園元 謙二;中山 二郎 - 通讯作者:
中山 二郎
腸球菌のquorum sensing自己誘導ペプチド(GBAP)の構造-機能相関研究
肠球菌群体感应自诱导肽(GBAP)的结构与功能关系研究
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西口 賢三;中山 二郎;永田 宏次;田之 倉優;園元 謙二 - 通讯作者:
園元 謙二
ポリフェノール修飾タンパク質によるヒストン結合を介した細胞保護作用
多酚修饰蛋白通过组蛋白结合的细胞保护作用
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
山口 公輔;板倉 正典;北澤 麗磨;林 世映;永田 宏次;柴田 貴広;赤川 貢;内田 浩二 - 通讯作者:
内田 浩二
海洋病原菌Vibrio metschnikoviili の鉄吸収と増殖を阻害する化合物のスパイス抽出物からの探索
从香料提取物中寻找抑制铁吸收和海洋病原体梅奇尼科维利弧菌生长的化合物
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
陸 鵬;王 夢瑶;神谷 岳洋;張 米敏;岡本 研;鈴木 道生;朝倉 富子;藤原 徹;永田 宏次 - 通讯作者:
永田 宏次
永田 宏次的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('永田 宏次', 18)}}的其他基金
複数のジスルフィド結合を含む組換タンパク質の高効率巻き戻し系の確立と立体構造解析
含多个二硫键重组蛋白高效解旋体系的建立及三维结构分析
- 批准号:
14780470 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
家蚕前胸激素的结构分析及功能关系
- 批准号:
11142205 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
家蚕前胸激素的结构分析及功能关系
- 批准号:
10161203 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
長期記憶に関わる転写因子CREBのリン酸化による活性制御の分子機構の解明
阐明长期记忆相关转录因子CREB磷酸化活性调节的分子机制
- 批准号:
09780556 - 财政年份:1997
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
家蚕前胸激素的结构分析及功能关系
- 批准号:
09265219 - 财政年份:1997
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
長期記憶に関わる転写因子CREBのリン酸化による活性制御の分子機構の解明
阐明长期记忆相关转录因子CREB磷酸化活性调节的分子机制
- 批准号:
08780571 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
カイコ前胸腺刺激ホルモンのNMRによる立体構造解析と機能相関
蚕前胸激素的NMR结构分析及功能相关性
- 批准号:
08276218 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
相似国自然基金
嗜热菌Thermus thermophilus HB8铁硫簇SUF合成途径的研究
- 批准号:31070067
- 批准年份:2010
- 资助金额:33.0 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Identification and analysis of endogenous strong promoters in the extreme thermophile Thermus thermophilus using whole-genome shotgun approach.
使用全基因组鸟枪法鉴定和分析极端嗜热栖热菌的内源性强启动子。
- 批准号:
21K05376 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
RUI: Transcription Factor Discovery in the Extremophile Thermus Thermophilus
RUI:在嗜热栖热菌中发现转录因子
- 批准号:
2041202 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Standard Grant
Metabolic control via protein acylation in Thermus thermophilus
通过嗜热栖热菌中蛋白质酰化的代谢控制
- 批准号:
17J40083 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
RUI: Transcription Factor Discovery in the Extremophile Thermus Thermophilus
RUI:在嗜热栖热菌中发现转录因子
- 批准号:
1714778 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Standard Grant
DNA scission activity of Thermus thermophilus Argonaute with artificial nucleic acids
人工核酸对嗜热栖热菌 Argonaute 的 DNA 切割活性
- 批准号:
16K14032 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Elucidation of mechanisms for genomic integrity through establishing novel tools for genetic analysis in Thermus thermophilus.
通过建立嗜热栖热菌遗传分析的新工具来阐明基因组完整性的机制。
- 批准号:
26340029 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Metabolic regulation via protein acylation in Thermus thermophilus
嗜热栖热菌中通过蛋白质酰化进行的代谢调节
- 批准号:
26870113 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Type IV pilus machinery of Thermus thermophilus
嗜热栖热菌的 IV 型菌毛机械
- 批准号:
26450102 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Biogenesis of ß-barrel proteins from Thermus thermophilus: Structure and mechanism (A03)
嗜热栖热菌 β-桶蛋白的生物发生:结构和机制 (A03)
- 批准号:
211179581 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别:
Collaborative Research Centres
FREEZING 70S CRYSTALS FROM THERMUS THERMOPHILUS UNDER PRESSURE
在压力下冷冻来自嗜热菌的 70S 晶体
- 批准号:
8363566 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 19.55万 - 项目类别: