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Characterization of Evolutional Turn-over of species-specific alternative promoters

Characterization of Evolutional Turn-over of species-specific alternative promoters
物种特异性替代启动子进化周转的表征
批准号：
18681029
负责人：
SUZUKI Yutaka
金额：
$18.72万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18681029/
关键词：
プロモーター分子進化発現制御完全長cDNA転写開始点種特異性転写活性可能実験的検証転写活性化能

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项目成果

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motif expression decomposition (MED)モデルを用いて、プロモーター活性の予測可能性を検討したところ、相関係数で0.8程度の精度で予測を行うことが可能であった。10-foldのクロスバリデーションを行ったところ、本予測系は、データセットに対して、十分な再現性と許容範囲をもったものであることを確認することができた。また、プロモーター配列中にランダムな突然変異の導入系の開発を行い、約5%程度の突然変異を簡便に導入することが可能となった。実際にEF1A1を用いて、最大10%の点突然変異の導入により、同プロモーターの活性が0.03倍から6.5倍まで改変できることを確認しており、用途に応じたプロモーターを創成することがある程度可能になったと考えている。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Intrinsic promoter activities of primary DNA sequences in the human genome
人类基因组中初级 DNA 序列的内在启动子活性
DOI： --
发表时间： 2007
期刊： DNA Research 14(2)
影响因子： --
作者： [Sakakibara, Y. (Takagi, T.)]
通讯作者： T.)
Transcriptome Analysis using Solexa 2007/09/21
使用 Solexa 进行转录组分析 2007/09/21
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [Sakakibara Y, Irie T, Suzuki Y, Yamashita R, Wakaguri H, Kanai A, Chiba J, Takagi T, Mizushima-Sugano J, Hashimoto S, Nakai K, Sugano S, Suzuki Y, Suzuki Y]
通讯作者： Suzuki Y
Formulation of food design protocol for dysphagia by quantitative analysis of biological information
  • 批准号：
    17H02133
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.4万
  • 财政年份：
    2017
  • 负责人：
    SUZUKI Yutaka
  • 依托单位：
    University of Yamanashi
Development and evaluation of auscultating type diagnostic support system - about Eustachian tube insufflation Method -
  • 批准号：
    25750185
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额：
    $2.66万
  • 财政年份：
    2013
  • 负责人：
    SUZUKI Yutaka
  • 依托单位：
    University of Yamanashi
Centralization, Decentralization and Contingency Dependent Governance in the European Union: A Game Theoretical Analysis
  • 批准号：
    23530383
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $1.25万
  • 财政年份：
    2011
  • 负责人：
    SUZUKI Yutaka
  • 依托单位：
    Hosei University
Integrated transcriptome analysis of cancer cells in response to hypoxic shock using next generation sequencer
  • 批准号：
    22681027
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
  • 资助金额：
    $16.31万
  • 财政年份：
    2010
  • 负责人：
    SUZUKI Yutaka
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
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