単一細胞マイクロアレイ法による生命現象解明の基盤創出

创建使用单细胞微阵列方法阐明生物现象的平台

• 批准号: 19370098
• 负责人: 斎藤 通紀
• 金额: $ 9.73万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19370098/
• 关键词: 単一細胞; 遺伝子発現; マイクロアレイ; 初期発生; 胚盤胞; 生殖細胞; ジーンタゲティング; 細胞分化

代表研究者らは、単一細胞から定量的かつ再現性良く発現遺伝子を増幅し、High density oligonucleotide microarrayにて解析可能とする系を確立(Kurimoto K et al.,Nuc.Acids Res.,34,e42,2006;Nature Protocols,2,739-752,2007)した。この単一細胞マイクロアレイ法を用いた解析を発展させ、生殖細胞形成過程におけるBlimp1及びPrdm14を核とした転写制御因子ネットワークの解析を行い、生殖細胞形成過程が、1)体細胞化の抑制、2)潜在的多能性の再獲得、3)エピゲノムリプログラミング、を包括する過程であり、Blimp1はそれらすべての過程に必須の中心的因子であること、Prdm14は後2者に必須であることを明らかにした(Kurimoto et al.,Genes&Development,22,1617-1635,2008:Yamaji M et al.,Nature Genetics,40,1016-1022,2008)。また、ドイツマックスプランク研究所の柊卓志博士を共同研究者として、マウス初期胚における細胞系譜分化機構の解析、本方法論を用いて、神経幹細胞からの神経系形成過程(Kawaguchi et al.,Development,135,3113-3124,2008)、glioblastoma stem cellの同定、X-reactivationを起こす分子機構の解析を共同研究として推進している。

领先的研究人员已经建立了一个系统，该系统可以定量和可重复地放大从单个细胞表达的基因，并允许使用高密度寡核苷酸微阵列进行分析（Kurimoto K等人，Nuc. Acid，34，E42，2006; Nature Protastions; Nature Protastiss，2，739-752，2007）。 We developed this analysis using the single cell microarray method and analyzed transcriptional regulatory factor networks nuclei in the germ cell formation process, and revealed that the germ cell formation process involves 1) suppression of somatic cell formation, 2) reacquiring potential pluripotentiation, and 3) epigenome reprogramming, and that Blimp1 is an essential central factor for all of these processes, and that Prdm14 is essential for the second two （Kurimoto等，《基因与发展》，22，1617-1635，2008：Yamaji M等人，自然遗传学，40，1016-1022，2008）。此外，德国马克斯·普朗克研究所的Hiiragi Takushi博士是一名合作者，一直在促进早期小鼠胚胎中细胞谱系分化机制的分析，利用这种方法来促进神经干细胞的神经系统形成过程这会导致X反应。

项目成果

A comprehensive, non-invasive visualization of primordial germ cell development in mice by the Blimp1-mVenus and stella-ECFP double transgenic reporter

通过 Blimp1-mVenus 和 stella-ECFP 双转基因报告基因对小鼠原始生殖细胞发育进行全面、非侵入性可视化

• 发表时间: 2008
• 期刊: Reproduction 136
• 作者: Ohinata;Y.;et al.
• 通讯作者: et al.

単一細胞マイクロアレイ法の応用と発展

单细胞微阵列方法的应用与发展

• 发表时间: 2008
• 作者: T.;Matsumura・Y.;Jin・Y.;Kabumoto・Y.;Takegahara・Y.;Sugawara・K.;Oguma・W.i.;Lencer・Y.;Fujinaga;阪尾 寿々 他;斎藤 通紀
• 通讯作者: 斎藤 通紀

A signaling principle for the specification of germ cell fate in mice

小鼠生殖细胞命运规范的信号原理

• 发表时间: 2008
• 作者: 為国愛・舘田英典;他1名;Mitinori Saitou
• 通讯作者: Mitinori Saitou

A Signaling Principle for the Specification of the Germ Cell Lineage in Mice

• DOI: 10.1016/j.cell.2009.03.014
• 发表时间: 2009-05-01
• 期刊: CELL
• 影响因子: 64.5
• 作者: Ohinata, Yasuhide;Ohta, Hiroshi;Saitou, Mitinori
• 通讯作者: Saitou, Mitinori

Single-cell gene profiling defines differential progenitor subclasses in mammalian neurogenesis

• DOI: 10.1242/dev.022616
• 发表时间: 2008-09-15
• 期刊: DEVELOPMENT
• 影响因子: 4.6
• 作者: Kawaguchi, Ayano;Ikawa, Tomoko;Matsuzaki, Fumio
• 通讯作者: Matsuzaki, Fumio