フィンガー間相互作用を用いたバイオセンサーの開発
开发利用手指交互的生物传感器
基本信息
- 批准号:21657034
- 负责人:
- 金额:$ 2.05万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- 财政年份:2009
- 资助国家:日本
- 起止时间:2009 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Zicタンパク質の立体構造解析で明らかになった2つのZnフィンガーが一体化した構造について、同様の構造が一般的に見られるのかを検討した。これまでに構造決定されたタンパク質の中ではGliやZap1が同様な構造を示し、これらの立体構造を重ね合わせてみると、トリプトファンが2つのZnフィンガーをつなぐような位置を占めていた。アミノ酸の配列ではC-W-C-H-Hが2回繰り返されているので、「タンデムCWCH2」と名付け、同様の配列をもつ遺伝子をデータベース上で検索した。その結果、587のタンデムCWCH2を含む配列を同定することができた。次にこれらをアミノ酸配列の類似性や文献に記載されている機能情報などをもとに分類・整理したところ、11の遺伝子群にまとめられた。次に、タンデムCWCH2を含む遺伝子の分布を生物を進化の系統樹に重ねてみると、タンデムCWCH2は襟鞭毛虫を含めた動物と真菌を中心に分布していることがわかった。アミノ酸配列の類似性を統計学的に解析したところ、タンデムCWCH2の原型は動物と真菌の共通祖先にまで遡れるという結果が得られました。一方で一般的なC2H2 Znフィンガーは真核生物に広く分布していることが知られている。また配列をもとに構造解析を行った結果、タンデムCWCH2の特徴は、トリプトファンが保存される以外に3つあることが、明らかになった:a)特定の位置のアミノ酸は高頻度で特定のアミノ酸に占められる。b)二つのCWCH2をつなぐアミノ酸配列が一般的なZnフィンガーに比べて長い。c)一般的なZnフィンガーには見られない挿入配列が認められる場合がある。ただし、b,c)のアミノ酸配列は保存性は低い。これらの特微は2つのZnフィンガーが結合して一体化するために進化の過程で獲得してきた変化ではないかと考えられた。これらの知見をもとに、より詳細なフィンガー間相互作用の相互作用の解析を蛍光共鳴エネルギー転移(FRET)やモデル動物を用いて進め、フィンガー間相互作用をもとにしたプローブの開発を進めた。
Zic structure analysis of the quality of the three-dimensional structure is clear, and the structure of the same kind is common. This structure determines the quality of the material, and the structure of the material is similar to that of the material. The structure of the material is similar to that of the material. The structure of the material is similar to that of the material. The structure of the material is different from that of the material. The structure of the material is different from that of the material. The acid sequence is C-W-C-H-H, and the sequence is C-W-C-H-H. The sequence is C-W-C-H. The results of 587 are as follows: The second is the similarity of the acid sequence and the literature records the functional information of the acid sequence. CWCH2 contains the distribution of genes, the phylogenetic tree of organisms, and the central distribution of flagellates. The similarity of the amino acid sequences was statistically analyzed, and it was concluded that the prototype of TADENDROME CWCH2 is a common ancestor of animals and fungi. A general distribution of C2H2Zn in eukaryotes The results of the structural analysis of CWCH2 are as follows: (a) The high frequency of specific acid in specific position and the high frequency of specific acid in specific position. b) Two CWCH2 acid combinations are common and longer than those of Zn. c) General Zn b,c) The acid composition is low in preservation. The process of evolution is to obtain the special characteristics of Zn and Zn. Analysis of the interaction between the two groups: optical resonance and the interaction between the two groups.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Xenopus Zic3 has an inhibitory role for beta-catenin dependent Transcription activation
Xenopus Zic3 对 β-catenin 依赖性转录激活具有抑制作用
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:K.Hasegawa;S.Nakata;S.Tanaka;川口泰雄;藤見峰彦
- 通讯作者:藤見峰彦
Disorganized innervation and neuronal loss in the inner ear of Slitrk6-deficient mice.
- DOI:10.1371/journal.pone.0007786
- 发表时间:2009-11-11
- 期刊:
- 影响因子:3.7
- 作者:Katayama K;Zine A;Ota M;Matsumoto Y;Inoue T;Fritzsch B;Aruga J
- 通讯作者:Aruga J
Slitrk6欠損マウスに見られた内耳の感覚神経発生異常
在 Slitrk6 缺陷小鼠中观察到异常的内耳感觉神经发生
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:三浦健一郎;稲場直子;河野憲二;有賀純
- 通讯作者:有賀純
シナプス接着分子Lrfh2/SALM1は興奮性シナプスの機能制御および行動発現に重要である
突触粘附分子 Lrfh2/SALM1 对于兴奋性突触的功能控制和行为表达很重要
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:石川博一;森田鉄兵;本間道夫;饗場弘二;Minoru Hatayama;有賀純;Kumiko Sakai-Kato;Kei-ichi Katayama;有賀純;畑山実;藤見峰彦;小川実幸;有賀純;松本圭史;守村直子
- 通讯作者:守村直子
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