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フィンガー間相互作用を用いたバイオセンサーの開発

开发利用手指交互的生物传感器

基本信息

批准号：
21657034
负责人：
有賀純
金额：
$ 2.05万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

Zicタンパク質の立体構造解析で明らかになった2つのZnフィンガーが一体化した構造について、同様の構造が一般的に見られるのかを検討した。これまでに構造決定されたタンパク質の中ではGliやZap1が同様な構造を示し、これらの立体構造を重ね合わせてみると、トリプトファンが2つのZnフィンガーをつなぐような位置を占めていた。アミノ酸の配列ではC-W-C-H-Hが2回繰り返されているので、「タンデムCWCH2」と名付け、同様の配列をもつ遺伝子をデータベース上で検索した。その結果、587のタンデムCWCH2を含む配列を同定することができた。次にこれらをアミノ酸配列の類似性や文献に記載されている機能情報などをもとに分類・整理したところ、11の遺伝子群にまとめられた。次に、タンデムCWCH2を含む遺伝子の分布を生物を進化の系統樹に重ねてみると、タンデムCWCH2は襟鞭毛虫を含めた動物と真菌を中心に分布していることがわかった。アミノ酸配列の類似性を統計学的に解析したところ、タンデムCWCH2の原型は動物と真菌の共通祖先にまで遡れるという結果が得られました。一方で一般的なC2H2 Znフィンガーは真核生物に広く分布していることが知られている。また配列をもとに構造解析を行った結果、タンデムCWCH2の特徴は、トリプトファンが保存される以外に3つあることが、明らかになった:a)特定の位置のアミノ酸は高頻度で特定のアミノ酸に占められる。b)二つのCWCH2をつなぐアミノ酸配列が一般的なZnフィンガーに比べて長い。c)一般的なZnフィンガーには見られない挿入配列が認められる場合がある。ただし、b,c)のアミノ酸配列は保存性は低い。これらの特微は2つのZnフィンガーが結合して一体化するために進化の過程で獲得してきた変化ではないかと考えられた。これらの知見をもとに、より詳細なフィンガー間相互作用の相互作用の解析を蛍光共鳴エネルギー転移(FRET)やモデル動物を用いて進め、フィンガー間相互作用をもとにしたプローブの開発を進めた。

Zic structure analysis of the quality of the three-dimensional structure is clear, and the structure of the same kind is common. This structure determines the quality of the material, and the structure of the material is similar to that of the material. The structure of the material is similar to that of the material. The structure of the material is similar to that of the material. The structure of the material is different from that of the material. The structure of the material is different from that of the material. The acid sequence is C-W-C-H-H, and the sequence is C-W-C-H-H. The sequence is C-W-C-H. The results of 587 are as follows: The second is the similarity of the acid sequence and the literature records the functional information of the acid sequence. CWCH2 contains the distribution of genes, the phylogenetic tree of organisms, and the central distribution of flagellates. A statistical analysis of the similarity of acid alignment between CWCH2 and protozoa and fungi was conducted. A general distribution of C2H2Zn in eukaryotes The results of the structural analysis of CWCH2 are as follows: (a) The high frequency of specific acid in specific position and the high frequency of specific acid in specific position. b) Two CWCH2 acid combinations are common and longer than those of Zn. c) General Zn b,c) The acid composition is low in preservation. This unique feature has been transformed through the process of evolution when the two elements of Zn are combined and integrated. Analysis of the interaction between the two groups: optical resonance and the interaction between the two groups.