統合失調症における体細胞変異と染色体脆弱性の脳ゲノム研究

关于精神分裂症体细胞突变和染色体脆弱性的脑基因组研究

• 批准号: 21659273
• 负责人: 那波 宏之
• 金额: $ 1.92万
• 依托单位: Niigata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21659273/
• 关键词: 統合失調症; ゲノム不安定性; 体細胞変異; コピー数; CNV; マイクロサテライト

統合失調症や自閉症の大規模ゲノム研究において、患者には弧発性de novoの遺伝子変異が多く見られることから、これら精神疾患とゲノム不安定性との関連が重要視されている。しかし、統合失調症におけるゲノム不安定性の神経科学的意味やその変異細胞の分布(生殖細胞列vs体細胞系列)は不明のままであった。そこで本研究では、ヒト脳神経細胞での体細胞ゲノムの不安定性を評価し、統合失調症との関連を分析することにした。本年度は、統合失調症患者と精神疾患に罹患していない患者からの凍結死後脳(各50例)の脳ゲノムDNAを用いて、そのゲノムコピー数変異解析を実施した。アジレント社の1M・DNAマイクロアレイを使ってこの50ペアのDNAに対して、コピー数変異解析を実施した。ADAM2アルゴリズムを用いて閾値6.0でゲノムコピー数変異の遺伝子領域を検索したところ、1ペアの比較で大体100箇所のゲノムコピー数変異領域が検出された。その半数以上が既知のヒト個人に由来するコピー数変異領域と一致した。ゲノムコピー数変異を閾値5.0に落として50ペアの解析結果から、疾患群に共通する(浸透率の高い)ゲノム領域を探索した。その結果、報告のある染色体6番の組織適合性抗原遺伝子を含む約6ゲノム領域が疾患関連のコピー数変異領域として同定された。現在、個々のコピー数変異データを前年度に得られた不安定マイクロサテライト領域と対比させ、体細胞ゲノム不安定と関連しているか分析中である。

Identity disorder や autism の large-scale ゲ ノ ム research に お い て, patient に は arc 発 sex DE novo の heritage 伝 sub - different が く see ら れ る こ と か ら, こ れ ら mental disorders と ゲ ノ ム labile と の masato even が important visual さ れ て い る. し か し, identity disorder に お け る ゲ ノ ム labile の 経 scientific means god や そ の - idioblasts の distribution (germ cell column vs somatic cell series) は unknown の ま ま で あ っ た. そ こ で this study で は, ヒ ト 脳 god 経 cells で の somatic ゲ ノ ム の labile を review 価 し, identity disorder と の masato even を analysis す る こ と に し た. This year は に と mental illness, identity disorder patients suffering from し て い な い patients か ら の freeze to death after 脳 (50 cases) の 脳 ゲ ノ ム を DNA with い て, そ の ゲ ノ ム コ ピ ー number - different analytical を be applied し た. ア ジ レ ン ト club の 1 m. DNA マ イ ク ロ ア レ イ を make っ て こ の 50 ペ ア の DNA に し seaborne て, コ ピ ー number - different analytical を be applied し た. ADAM2 ア ル ゴ リ ズ ム を with い て threshold nt 6.0 で ゲ ノ ム コ ピ ー number - traces of different の 伝 sub-fields を 検 cable し た と こ ろ, 1 ペ ア の is overall 100 で the の ゲ ノ ム コ ピ ー number - different areas が 検 out さ れ た. More than half of the が know that そ ヒト individuals に origin するコピ the number varies in fields と consistency た た. ゲ ノ ム コ ピ ー several variations on different を threshold numerical に fell 5.0 と し て 50 ペ ア の analytical results か ら, common disease group of に す る (high penetration rate の い) ゲ ノ ム を exploration し た. そ の result, report の あ る chromosome 6 times の organization fit antigen heritage 伝 son を containing む about six ゲ ノ ム field masato が disease even の コ ピ ー number - different areas と し て with fixed さ れ た. Now, a 々 の コ ピ ー number - different デ ー タ を annual に before ら れ た unrest マ イ ク ロ サ テ ラ イ と ト field than さ seaborne せ, somatic ゲ ノ ム unrest と masato even し て い る か analysis で あ る.