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統合失調症における体細胞変異と染色体脆弱性の脳ゲノム研究

关于精神分裂症体细胞突变和染色体脆弱性的脑基因组研究

基本信息

批准号：
21659273
负责人：
那波宏之
金额：
$ 1.92万
依托单位：
Niigata University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

統合失調症や自閉症の大規模ゲノム研究において、患者には弧発性de novoの遺伝子変異が多く見られることから、これら精神疾患とゲノム不安定性との関連が重要視されている。しかし、統合失調症におけるゲノム不安定性の神経科学的意味やその変異細胞の分布(生殖細胞列vs体細胞系列)は不明のままであった。そこで本研究では、ヒト脳神経細胞での体細胞ゲノムの不安定性を評価し、統合失調症との関連を分析することにした。本年度は、統合失調症患者と精神疾患に罹患していない患者からの凍結死後脳(各50例)の脳ゲノムDNAを用いて、そのゲノムコピー数変異解析を実施した。アジレント社の1M・DNAマイクロアレイを使ってこの50ペアのDNAに対して、コピー数変異解析を実施した。ADAM2アルゴリズムを用いて閾値6.0でゲノムコピー数変異の遺伝子領域を検索したところ、1ペアの比較で大体100箇所のゲノムコピー数変異領域が検出された。その半数以上が既知のヒト個人に由来するコピー数変異領域と一致した。ゲノムコピー数変異を閾値5.0に落として50ペアの解析結果から、疾患群に共通する(浸透率の高い)ゲノム領域を探索した。その結果、報告のある染色体6番の組織適合性抗原遺伝子を含む約6ゲノム領域が疾患関連のコピー数変異領域として同定された。現在、個々のコピー数変異データを前年度に得られた不安定マイクロサテライト領域と対比させ、体細胞ゲノム不安定と関連しているか分析中である。

Large scale studies of schizophrenia and autism have shown that the relationship between schizophrenia and autism is important in many cases. The neuroscientific implications of schizophrenia and the distribution of heterocytes (germ cell series versus somatic cell series) are unclear. This study is aimed at evaluating the relationship between neurogenesis and somatic neurogenesis and schizophrenia. This year, the number of patients with schizophrenia and psychiatric disorders who died after freezing (50 cases each) was analyzed. The 1M DNA sequence was analyzed using the 50-bit DNA sequence. ADAM2 has a threshold value of 6.0 and a comparison value of approximately 100 items. More than half of the people who know each other have different origins. The number of different threshold values 5.0 to 50, the number of common disease groups (high permeability) to explore the field The results showed that the tissue-adapted antigen gene of chromosome 6 was similar to that of chromosome 6. Now, the number of different types of cells in the past year has been determined.