Effects of DNA-protein crosslink lesions on DNA replication and transcription

DNA-蛋白质交联损伤对 DNA 复制和转录的影响

• 批准号: 21710059
• 负责人: NAKANO Toshiaki
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21710059/
• 关键词: 修復; 複製; 転写; DNA-タンパク質クロスリンク; DNA-タンパク質クロスリンク損傷; DNA複製; DnaB

DNA-protein crosslinks (DPCs) are extremely bulky genomic lesions and are not efficiently repaired by nucleotide excision repair, suggesting that DPCs will exert detrimental effects on DNA replication and transcription in cells. In this study, we have prepared model DNA substrates containing site-specific DPCs and assessed their effects on DNA replication and transcription in vitro. DPCs on the lagging strand inhibited the progression of DnaB, the replicative helicase of E. coif, in a DPC size-dependent manner. Conversely DPCs on the leading strand had no effects on the progression of DnaB. We also have prepared DNA templates containing DPCs for in vitro transcriptions studies with T7 RNA polymerase. We are currently assessing the effects of DPCs in transcribed and nontranscribed strands on transcription.

DNA-蛋白质交联链(DPC)是一种极其庞大的基因组损伤，不能通过核苷酸切除修复有效地修复，这表明DPC将对细胞中的DNA复制和转录产生不利影响。在这项研究中，我们制备了含有位点特异性DPC的模型DNA底物，并在体外评估了它们对DNA复制和转录的影响。滞后链上的DPC以DPC大小依赖的方式抑制DNAB的进展，DNAB是E.coif的复制型解旋酶。相反，前导链上的DPC对DNAB的进展没有影响。我们还制备了含有DPC的DNA模板，用于T7RNA聚合酶体外转录研究。我们目前正在评估转录和非转录链中的DPC对转录的影响。

项目成果

Homologous recombination but not nucleotide excision repair plays a pivotal role in tolerance to DNA-protein crosslinks in mammalian cells

同源重组而非核苷酸切除修复在哺乳动物细胞对 DNA-蛋白质交联的耐受性中发挥着关键作用

• 发表时间: 2009
• 期刊: Journal of Biological Chemistry 284
• 作者: Nakano;T.;et al.
• 通讯作者: et al.

試験管内反応を用いたDNA-タンパク質クロスリンク損傷の転写反応阻害の検討

使用体外反应检查 DNA-蛋白质交联损伤引起的转录反应抑制

• 发表时间: 2010
• 作者: 中野敏彰;その他(3名)
• 通讯作者: その他(3名)

Comparison of the activities of bacterial and mammalian nucleotide excision repaor for DNA-protein crosslinks

细菌和哺乳动物核苷酸切除修复对 DNA-蛋白质交联的活性比较

• 发表时间: 2009
• 期刊: Nucleic Acids Symposium. Series 53
• 作者: Nakano;T.;et.al
• 通讯作者: et.al

Activities of bacterial and human nucleotide excision repair systems for DNA-protein crosslink damage

细菌和人类核苷酸切除修复系统对 DNA-蛋白质交联损伤的活性

• 发表时间: 2009
• 作者: Toshiaki Nakano;et al.(3名)
• 通讯作者: et al.(3名)

DNA-タンパク質クロスリンク損傷の修復機構

DNA-蛋白质交联损伤的修复机制

• 发表时间: 2008
• 期刊: 放射線生物研究 43
• 作者: 戸川欣彦;秋光純;井出博
• 通讯作者: 井出博