Elucidation of repair mechanism for oxidative damage in budding yeast based on genome-wide phenotype analyses

基于全基因组表型分析阐明芽殖酵母氧化损伤的修复机制

• 批准号: 23510250
• 负责人: ANDO Akira
• 金额: $ 3.33万
• 依托单位: National Agriculture and Food Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23510250/
• 关键词: 酸化ストレス; パン酵母; 遺伝子破壊株セット; 網羅的表現型解析; 出芽酵母

To identify gene functions involved in repair mechanism for oxidative damage in budding yeast Saccharomyces cerevisiae,we conducted genome-wide phenotype analyses using the complete collection of mutant strains deleted for each of all non-essential genes of budding yeast and the Decreased Abundance by mRNA Perturbation (DAmP) Yeast Library. The results suggest that genes related to RNA polymerases and the Ubiquitin-Proteasome system, as well as vacuolar acidification that were identified to be critical for tolerance to oxidative stress in our previous study, play important roles in tolerance to oxidative stress. We constructed a systematic library for comprehensive overexpression screens in S. cerevisiae using the systematic collection of yeast genome in a high-copy vector. Using this overexpression library, we screened strains that showed resistance or sensitivity to oxidative stress.

为了确定出芽酵母氧化损伤修复机制中涉及的基因功能，我们利用出芽酵母所有非必需基因缺失的突变菌株的完整集合和mRNA微扰（DAmP）酵母文库进行了全基因组表型分析。结果表明，RNA聚合酶和泛素-蛋白酶体系统相关基因以及空泡酸化在我们之前的研究中被确定为对氧化应激耐受至关重要的基因在氧化应激耐受中发挥重要作用。利用酵母基因组在高拷贝载体上的系统收集，构建了酿酒酵母过表达筛选系统文库。利用这个过表达文库，我们筛选了对氧化应激具有抗性或敏感性的菌株。

项目成果

平成21年産市販パン酵母の品質について

关于2009年生产的市售面包酵母的质量

• 发表时间: 2013
• 期刊: 日本イースト工業会技術懇談会報告
• 作者: 安藤聡;中村敏英;島純;皆川あけみ
• 通讯作者: 皆川あけみ

優れた発酵特性を有する酵母の探索

寻找具有优异发酵特性的酵母

• 发表时间: 2011
• 期刊: 微生物遺伝資源探索収集調査報告書
• 作者: 安藤聡;中村敏英
• 通讯作者: 中村敏英

パンづくりを支える微生物機能-酵母と乳酸菌を中心にして-

支持面包制作的微生物功能 - 关注酵母和乳酸菌 -

• 发表时间: 2013
• 期刊: 生物工学会誌
• 作者: 島純;小松崎典子;吉田綾子;安藤聡;中村敏英
• 通讯作者: 中村敏英

環境ストレス耐性に着目したバイオエタノール生産酵母開発の試み

尝试开发以环境胁迫耐受性为重点的生物乙醇生产酵母

• 发表时间: 2011
• 期刊: 生物工学会誌
• 作者: 島純;安藤聡;中村敏英
• 通讯作者: 中村敏英

Improvement of ethanol tolerance by overexpression of genes involved in yeast vacuolar ATPases (V-ATPase) function

通过过度表达参与酵母液泡 ATP 酶（V-ATP 酶）功能的基因来改善乙醇耐受性

• 发表时间: 2011
• 作者: 長谷川園子;安藤聡;小川順;高木博史;島純
• 通讯作者: 島純