DNAオリガミを用いた生体分子ナノシステムの構築
利用 DNA 折纸构建生物分子纳米系统
基本信息
- 批准号:11F01345
- 负责人:
- 金额:$ 1.28万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2011
- 资助国家:日本
- 起止时间:2011 至 2013
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
1)カリウムイオンによるG-四重鎖DNA形成 : まず、KCI溶液で四分子G-四重鎖の形成の直接可視化と単一分子解祈を行った。塩化カリウムの非存在下では、組み込まれた二重鎖は相互作用がなく、お互いに平行のDNAが観測された。塩化カリウムの添加によりG-四重鎖構造の形成を誘導した。さらに、KCl溶液添加によるG-四重鎖形成と、KC1を含まない緩衝液の添加でG-四重鎖が破壊できることをリアルタイムで観測できた。DNA折り紙を使って我々はストランドの向き、トポロジーおよびG-四重鎖の化学量論を制御すること成功した。2) G-四重鎖結合性リガンドによって誘導されるDNAのシナプス構造 : 次に、一方の端にリンカーを含むビオチンでbisquinoliniumピリジンジカルボキサミドによって誘発されるG-四重鎖の形成の直接観察を検討した。リガンドの存在下では、特徴的なX字構造が観測されG-四重鎖構造の形成を誘導した。リガンドによって誘導されるG-四重鎖にストレプトアビジンを添加すると、X字状の中央にタンパク質が結合しリガンドが四重鎖に結合していることを示した。3)分子シャペロンとしてのHIV-1ヌクレオカプシドタンパク質 : HIV-1ヌクレオカプシドタンパク質は、核酸シャペロンと呼ばれ、これまでのところ化学量論、NCP-NCPの相互作用、G-四重鎖形成にシャペロン活性についてはあまりよく分かっていない。我々は、DNA折り紙を使って前駆体タンパク質NCPl5、成熟NCp7の性質について直接的およびリアルタイム分析を行った。タンパク質粒子は、主に溶液中では単量体の形態で存在することが見出され、二量体及び多量体は、溶液中および、四重鎖構造に結合状態で観察された。G-四重鎖への結合形成や解離の様子がリアルタイムに観察され、中間体の状態もまた可視化した。
1) G-quadruple lock DNA formation: direct visualization of four-molecule G-quadruple lock formation in KCI solution and single-molecule dissociation. In the absence of a chemical reaction, the double lock interaction occurs in parallel with the DNA reaction. The formation of G-quadruple lock structure is induced by the addition of G-quadruple lock structure. In addition, KCl solution is added to the G-quadruple lock formation, KC1 is added to the buffer solution, and the G-quadruple lock formation is detected. DNA folding paper was successfully prepared by chemical analysis of DNA fragments and G-quadruple locks. 2)The structure of G-quadruple-lock binding region induced by bisquinolinium was studied by direct detection of G-quadruple-lock formation. The formation of G-quadruple-locked structures is induced by the detection of X-shaped structures characterized by the presence of free radicals. The G-quadruple lock is connected to the center of the X shape and is connected to the quadruple lock. 3) HIV-1 molecular selection process: HIV-1 molecular selection process, nucleic acid selection process, molecular weight theory, NCP-NCP interaction, G-quadruple lock formation process, molecular activity, molecular selection process. DNA analysis is performed on the properties of NCP15 and mature NCP7. The existence of single, binary and multiple-volume particles in solution and four-fold lock structure was observed. G-quadruple lock formation and dissociation of components are observed and the state of the intermediate is visualized.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Direct and Single-Molecule Visualization of the Solution-State Structures of G-Hairpin and G-Triplex Intermediates
- DOI:10.1002/anie.201308903
- 发表时间:2014-04-14
- 期刊:
- 影响因子:16.6
- 作者:Rajendran, Arivazhagan;Endo, Masayuki;Sugiyama, Hiroshi
- 通讯作者:Sugiyama, Hiroshi
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- DOI:10.1039/c3ra45676e
- 发表时间:2014
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:A. Rajendran;M. Endo;K. Hidaka. P. L. T. Iran. M. P.
- 通讯作者:K. Hidaka. P. L. T. Iran. M. P.
DNA Origami: Synthesis and Self‐Assembly
- DOI:10.1002/0471142700.nc1209s48
- 发表时间:2012-03
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:A. Rajendran;Masayuki Endo;H. Sugiyama
- 通讯作者:A. Rajendran;Masayuki Endo;H. Sugiyama
Structural DNA nanotechno logy: DNA as a nanoscale material
结构 DNA 纳米技术:DNA 作为纳米级材料
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hasitha Muthumala waidyasooriya;Masanori Hariyama and Michitaka Kameyama;A. Rajendran
- 通讯作者:A. Rajendran
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- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hasitha Muthumala Waidyasooriya;Hirokazu Takahashi;Yasuhiro Takei;Masanori Hariyama and Michitaka Kameyama;A. Rajendran
- 通讯作者:A. Rajendran
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