Comprehensive analysis of cardiomyopathy-related signaling networks based on quantitative phosphoproteomics

基于定量磷酸蛋白质组学的心肌病相关信号网络综合分析

• 批准号: 23790889
• 负责人: WAKABAYASHI Masaki
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23790889/
• 关键词: 心筋症; リン酸化プロテオミクス; 定量プロテオミクス; プロテオミクス; シグナルネットワーク; LC-MS/MS; 心不全

In this study, a novel method for reproducible, unbiased, and quantitative extraction of tissue proteins was successfully developed. Using this method combined with an optimized protocol for phosphopeptide enrichment and LC-MS/MS analysis, more than 6,000 phosphopeptides were identified and quantified from two kinds of mouse models for cardiomyopathy and a control one, and 20% of the identified peptides showed more than two-fold changes in MS signals. From these data, I am attempting to identify specific signal networks closely related to the onset and development of cardiomyopathy.

在这项研究中，一种新的方法，可重复的，公正的，和定量提取组织蛋白质成功地开发。利用该方法结合优化的磷酸肽富集和LC-MS/MS分析方案，从两种心肌病小鼠模型和对照小鼠模型中鉴定和定量了6,000多个磷酸肽，其中20%的鉴定肽在MS信号中显示出2倍以上的变化。从这些数据中，我试图确定与心肌病的发生和发展密切相关的特定信号网络。

项目成果

ナノバイオ技術と最新創薬応用研究

纳米生物技术和最新药物发现应用研究

• 发表时间: 2012
• 作者: Bennett TL;Kraft SM;Reaves BJ;Mima J;O'Brien KM;Starai VJ;宮ノ入洋平;高橋清大
• 通讯作者: 高橋清大

ジメチル標識ペプチドのRP-LCにおける保持挙動評価と 定量プロテオミクスの高効率化

二甲基标记肽在 RP-LC 中的保留行为评估和定量蛋白质组学的高效性

• 发表时间: 2012
• 作者: Takahashi K;Hirose K;Kawashima S;Niwa Y;Wakashin H;Iwata A;Tokoyoda K;Renauld JC;Iwamoto I;Nakayama T;Nakajima H.;Masaki Wakabayashi;若林真樹
• 通讯作者: 若林真樹

高感度LC-MS/MSシステムを用いた極微量組織試料のプロテオーム解析技術の確立

使用高灵敏度LC-MS/MS系统建立超痕量组织样品蛋白质组分析技术

• 发表时间: 2011
• 作者: Shitan;N.;Yazaki;K.;R.Kamada;若林真樹; 増田豪; 石濱泰
• 通讯作者: 若林真樹; 増田豪; 石濱泰

微量組織試料に対する定量的リン酸化プロテオーム解析法の確立

小组织样本定量磷酸化蛋白质组分析方法的建立

• 发表时间: 2011
• 作者: 前田容子;他;若林真樹; 塚原麻伊; 吉原宏樹; 増田豪; 石濱泰
• 通讯作者: 若林真樹; 塚原麻伊; 吉原宏樹; 増田豪; 石濱泰

Enhanced identification of phosphopeptides by peptide dimethylation coupled with titania chromatography

通过肽二甲基化结合二氧化钛色谱增强磷酸肽的鉴定

• 发表时间: 2012
• 作者: 東出直樹;Masaki Wakabayashi
• 通讯作者: Masaki Wakabayashi