合成キラル金属ポルフィリンの反応機構と選択性の計算化学による研究
合成キラル金属ポルフィリンの反応機構と選択性の計算化学による研究
批准号:
14F04334
负责人:
榊 茂好
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2017-03-31
中文摘要
生体酵素である、Prostaglandin endoperoxide H synthases (PGHSs)のバイオミメティック触媒である、ポルフィリン錯体("ツインコロネット"型錯体)によって触媒されるジエンの位置選択的および立体選択的酸素化のメカニズムを理論化学計算で調べることを目標とし、さらにPGHSsの反応機構を理解することを試みた。手法としては、two-layer ONIOM (QM/MM)法及びAFIR法を用いた。特に、溶液中で最も熱力学的に安定な反応前駆体、中間活性種の生成過程、位置選択的水素の引き抜き反応、そして、ジエンの酸化過程について、詳細に調べた。選択的過程については、遷移状態構造の系統的かつ効率的な探索をAFIR法を応用し実行した。また、この錯体は300原子を超える系であり、応用する分子力場の依存性が高いことが考えられる。そのため、我々は、様々な種類の分子力場(AMOEBA09[分極可能],MMM3, MMFF, OPLS-AA, CHARMM22)を適用し、反応経路などに違いを詳細に検討した。その結果、反応経路の概略および位置選択性の決定過程が解明された。また、ノンヘム鉄(III)-スーパーオキソ系においては、中間体を含めた詳細な電子構造の解析とともに、2-ヒドロキシ2-アザマンタン、フェニルヒドラジンを基質とした、水素引き抜きの反応性について調べた。方法は、上述のtwo-layer ONIOM(QM/MM)法を使用した。その結果、反応機構の概略を解明した。
英文摘要
生体酵素である、Prostaglandin endoperoxide H synthases (PGHSs)のバイオミメティック触媒である、ポルフィリン錯体("ツインコロネット"型錯体)によって触媒されるジエンの位置選択的および立体選択的酸素化のメカニズムを理論化学計算で調べることを目標とし、さらにPGHSsの反応機構を理解することを試みた。手法としては、two-layer ONIOM (QM/MM)法及びAFIR法を用いた。特に、溶液中で最も熱力学的に安定な反応前駆体、中間活性種の生成過程、位置選択的水素の引き抜き反応、そして、ジエンの酸化過程について、詳細に調べた。選択的過程については、遷移状態構造の系統的かつ効率的な探索をAFIR法を応用し実行した。また、この錯体は300原子を超える系であり、応用する分子力場の依存性が高いことが考えられる。そのため、我々は、様々な種類の分子力場(AMOEBA09[分極可能],MMM3, MMFF, OPLS-AA, CHARMM22)を適用し、反応経路などに違いを詳細に検討した。その結果、反応経路の概略および位置選択性の決定過程が解明された。また、ノンヘム鉄(III)-スーパーオキソ系においては、中間体を含めた詳細な電子構造の解析とともに、2-ヒドロキシ2-アザマンタン、フェニルヒドラジンを基質とした、水素引き抜きの反応性について調べた。方法は、上述のtwo-layer ONIOM(QM/MM)法を使用した。その結果、反応機構の概略を解明した。
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Artificial Force Induced Reaction Method for Systematic Determination of Complex Reaction Mechanisms.
用于系统测定复杂反应机理的人工力诱导反应方法。
DOI:
10.1002/tcr.201600052
发表时间:
2016
期刊:
Chemical record
影响因子:
6.6
作者:
[W. M. C. Sameera, Akhilesh Kumar Sharma, S. Maeda, K. Morokuma]
通讯作者:
K. Morokuma
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[W. M. C. Sammera]
通讯作者:
W. M. C. Sammera
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[R. Ramozzi, W. M. C. Sameera, K. Morokuma]
通讯作者:
K. Morokuma
京都大学福井謙一記念研究センター
京都大学福井健一纪念研究中心
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Carbon-carbon bond formation reactions: DFT and AFIR studies
碳-碳键形成反应:DFT 和 AFIR 研究
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[W. M. C. Sammera, W.M.C. Sameera]
通讯作者:
W.M.C. Sameera
共 10 条
Preventing Mechanism of Luminescence of Photo-Functional Molecules: Theoretical Study
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批准号:16F16704
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2016
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
金属錯体の高精度大規模理論計算法の開発-反応と物性の微視的理解と制御
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批准号:21350009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.15万
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财政年份:2009
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
金属錯体の配位によるフラーレンやカーボンナノチューブなどの電子状態制御
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批准号:17651057
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2005
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
動的錯体の自在制御に関する理論的研究
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批准号:14044082
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2002
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
生体タンパクを反応場に用いた効率良い光触媒反応の開発
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批准号:09875195
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1997
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
触媒サイクルにおける有機金属錯体の反応挙動と分子認識に関する理論的研究
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批准号:07216258
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1995
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
遷移金属錯体の配位過程と反応過程における分子認識機能に関する理論的研究
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批准号:06227256
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1994
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
新しい酵素添加酵素モデル銅錯体の開発とオレフィンの不斉エポキシ化触媒反応への応用
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批准号:63540492
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1988
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
新しいキラル遷移金属錯体によるチトクロムC及びb5の基質立体選択的電子移動反応
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批准号:61540451
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1986
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
異常低原子価遷移金属錯体の特異的電子状態とその CO_2 固定化能に関する研究
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批准号:60540306
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1985
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
長寿命化した電荷移動励起銅(I)錯体触媒による水の光還元水素生成反応に関する研究
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批准号:59540397
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1984
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
第一遷移周期金属錯体の光触媒作用に関する研究
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批准号:56750571
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1981
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
錯体触媒による光エネルギー利用システムの基礎及び応用研究
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批准号:X00210----475642
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1979
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
配位子への求核反応における遷移金属錯体の触媒作用とその電子構造に関する研究
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批准号:X00210----174147
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.19万
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财政年份:1976
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负责人:榊 茂好
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依托单位:
海外基金