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ウイルスゲノム組み込みと生体機能情報のリアルタイム血中可視化による子宮頸癌の制御

通过病毒基因组整合和生物功能信息的实时血液可视化控制宫颈癌

基本信息

批准号：
22K07484
负责人：
伊東文生
金额：
$ 2.66万
依托单位：
St. Marianna University School of Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2026-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

子宮頸癌では、ヒトパピローマウイルス（HPV）ゲノムがヒトゲノムに組み込まれることが発癌の一因であり、その制御は最重要課題の一つである。研究代表者らは、HPVゲノムのヒトゲノムへの新規の組み込み解析法および咽頭洗浄廃液を用いた「面」によるHPVジェノタイピング法の開発に成功した。これらを発展させ、血液のみでHPV組み込み部位および関連する生体機能情報を可視化することができるかを明らかにすることは重要である。本研究では、HPVゲノムのヒトゲノムへの組み込み部位をG-NaVI法で同定し、血液中の循環腫瘍DNAで同部位を検出できる系を開発することを目的とした。また、血液を対象に癌特異的シグナルの可視化と遊離DNA、無標識循環腫瘍細胞の検出系を確立することを目指した。いくつかのDNA抽出キットを用いて、G-NaVI法に適した抽出方法を決定した。抽出したDNAを断片化後、いくつかのキャプチャーキットを用いて、HPVゲノムキャプチャーに最適な方法を決定した。HPVゲノム組み込みヒトDNAを回収し、Baitsを除去したのち、ロングリード次世代シーケンサーを用いて配列を決定することに成功した。次世代シーケンサーで検出されたHPV組み込み部位を増幅するPCRプライマーを設計し、サンガーシーケンサーで配列決定を行い、結果の検証を行った。HPVを対象に、血液検体のみでHPVゲノム組み込み部位および関連する生体機能情報を可視化することにより、癌超早期診断や発癌リスク判定などの個別化医療への応用につながる研究成果をあげることができた。

Cervical cancer test, HPV test group The most important issue of み込まれることが発cancer であり and そのcontrol は. Research representative, らは, HPV ゲノムのヒトゲノムへの新guiの集团み込みanalytical method およびpharynx Wash your head and remove the liquid. Use the "face" method to test the HPV test method successfully.これらを発出させ、bloodのみでHPV group み込みparts およびrelated する生Visualization of functional information is important. In this study, the G-NaVI method was used to determine the location of the HPV test group.し, the same part of the circulating tumor DNA in the blood is the source of the blood. Detection and detection of cancer-specific blood cancer cells, visualization of cell-free DNA, and identification of unlabeled circulating tumor cells have been established. The DNA extraction method was determined using the G-NaVI method and the G-NaVI method. After the DNA was extracted and fragmented, the DNA was extracted and fragmented. Use the best method to determine the best way to detect HPV infection. HPV ゲノムgroup み込みヒトDNA を recovery し, Baits を removal したのち, The next generation of ロングリードシーケンサーを uses the いて arrangement to determine the success of the することにした. Next generation シーケンサーで検出されたHPV group み込みparts をincreased するPCR プライマーをDesignし、サンガーシーケンサーでdeterminationを行い、Resultsの検证を行った. HPV を対 elephant に、blood 検 Body のみでHPV ゲノムgroup み込みparts およびrelated するbiofunction information をvisualization することにより, ultra-early diagnosis of cancer, diagnosis of cancer, personalized medicine, research results of につながる, をあげることができた.