NUCLEIC ACID BASED DETECTION AND QUANTITATION OF HIV-1 AND HIV-2

HIV-1 和 HIV-2 的核酸检测和定量

基本信息

项目摘要

Primer pairs have been developed that allow the detection and discrimination of HIV-1 and HIV-2 by PCR. When used singly, these primers and probes permit detection of between 1-10 copies of viral DNA. Greater than 90% sensitivity was seen in clinical samples for the HIV-2 primers and sensitivity was greater in samples from persons with CD4 counts less than 700. These primers can also be used in a co- amplification format with good sensitivity. These primers have been used to study the presence of HIV and related viruses in diseases of unknown etiology such as Idiopathic CD4+ T-Lymphocytopenia and Kaposi's Sarcoma. A sensitive method for amplification of RNA in the presence of UNG was developed. By this method, all steps of the PCR procedure are performed in a single tube a minimizing carryover contamination. A procedure for amplification of HIV DNA and RNA is being developed for in situ amplification and detection by PCR. This procedure is being modified for non-isotopic detection systems. These detection methods are being used to detect and quantitate virus in saliva and plasma and in infected cells from patients.
已经开发出了允许检测和 用聚合酶链式反应鉴别HIV-1和HIV-2单独使用时,这些 引物和探针可以检测到1-10个拷贝的病毒DNA。 临床样本对HIV-2的敏感性超过90% 在来自CD4携带者的样本中,引物和敏感性更高 不到700人。这些引物也可用于联合检测。 具有良好灵敏度的放大格式。这些底漆已经用过了 研究HIV及相关病毒在不明原因疾病中的存在 病因如特发性CD4+T淋巴细胞减少症和卡波西肉瘤。 建立了一种在UNG存在下扩增RNA的灵敏方法 发展起来的。通过该方法,执行了PCR程序的所有步骤 在单管中,最大限度地减少了残留污染。一种程序,用于 HIV DNA和RNA的原位扩增正在开发中 用聚合酶链式反应进行扩增和检测。此程序正在修改以用于 非同位素检测系统。这些检测方法正在被使用 检测和定量唾液、血浆和感染细胞中的病毒 从病人那里。

项目成果

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