Biosynthèse, activité biologique et impact sur le microbiote colique des bactériocines de bactéries lactiques: Approche génomique, protéomique fonctionelle et métabolomique

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Les bactériocines sont des composés de nature protéique naturellement produits par plusieurs souches bactériennes et sont dotées d'une activité antimicrobienne dirigée contre des bactéries proches de la souche productrice. L'activité inhibitrice des bactériocines contre des bactéries pathogènes a été largement démontrée dans plusieurs modèles alimentaires tels que les produits laitiers, carnés et végétaux. Récemment, la production de bactériocines a été évoquée comme un mécanisme d'action important impliqué dans l'activité antimicrobienne des probiotiques au niveau gastro-intestinal. Les probiotiques bactériocinogènes ont alors été présentées comme l'une des alternatives des plus prometteuses aux antibiotiques pour la lutte contre les germes multirésistants. Malgré l'abondance de littérature concernant les bactériocines, les données scientifiques relatives à la biosynthèse, à l'activité et à l'innocuité des ces molécules bioactives dans les conditions physiologiques du tractus digestif demeurent très rares. Dans le cadre de cette programmation de recherche, nous adopterons une approche pluridisciplinaire combinant la génomique, la protéomique fonctionnelle et la métabolomique pour l'étude de la biosynthèse et de l'activité biologique de certaines bactériocines de bactéries probiotiques au niveau digestif. Nous étudierons également l'impact des souches bactériocinogènes et de leur bactériocines sur la composition, la dynamique et le profil métabolique du microbiote colique. La programmation scientifique proposée est une suite logique de nos travaux antérieurs qui nous ont permis d'étudier le comportement des probiotiques bactériocinogènes dans la section proximale du tube digestif. Ce programme répond à l'une des priorités de recherche du secteur fort prometteur des probiotiques en permettant de générer de nouvelles connaissances fondamentales et des preuves scientifiques directes sur la biosynthèses des bactériocines dans le tractus gastro-intestinal et à caractériser les interactions de ces molécules avec le microbiote colique. À plus long terme, ces résultats peuvent servir de base pour la conception de nouvelles formules probiotiques fonctionnelles d'utilisation plus crédible, plus efficace, sécuritaire et mieux ciblée.