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Genome wide profiling of histone variants in tumors

Genome wide profiling of histone variants in tumors
肿瘤中组蛋白变异的全基因组分析
批准号：
8938009
负责人：
YAMINI P DALAL
金额：
$36.81万
依托单位：
DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
--
资助国家：
美国
项目状态：
未结题
起止时间：
至
来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/8938009
关键词：
AddressCancer cell lineCentromereChromatin StructureChromosomal InstabilityChromosome Fragile SitesColorectal CancerEpigenetic ProcessFailureFunctional RNAFutureGenesGenomeGoalsHistonesHumanLeadLocationMapsMethodsModificationOutcomePostdoctoral FellowProcessSpecificityVariantWorkcancer cellcentromere protein Afollow-upgenome-widenew technologyresponsetumortumor progressiontumorigenic

项目摘要

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中文摘要
翻译
我们已经在结直肠癌细胞系中绘制了独特的组蛋白变体基因组，并发现它们聚集在表观遗传学独特区域的子集上。我们已经绘制了这些地区进一步使用细胞学方法，并发现了一个新的着丝粒样的区域在一个脆弱的染色体站点包括myc基因座。未来的目标包括绘制肿瘤中的组蛋白变体，以跟踪肿瘤发生过程导致的异常染色质结构的进展，并发现错误定位中涉及的重塑和过程。我们还纯化了大量的组蛋白变体，并检查了它们对肿瘤进展的反应。
英文摘要
We have mapped unique histone variant genome wide in colorectal cancer cell lines and found that that they cluster at a subset of epigenetically distinctive regions. We have mapped these regions further using cytological methods and discovered a new centromere-like region in a fragile chromosome site encompassing the myc locus. Future goals involve mapping histone variants in tumors in order to track progression of aberrant chromatin structures as a consequence of the tumorigenic process, and discovering remodelers and processes involved in the mis-localization. We are also purifying large quantities of histone variants and examining their modification status in response to tumor progression.
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会议论文
Analysis of centromere identity and structure in human cells
  • 批准号：
    7966218
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $31.78万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    YAMINI P DALAL
  • 依托单位：
    DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
Analysis of centromere identity and structure in human cells
  • 批准号：
    8553040
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $30.55万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    YAMINI P DALAL
  • 依托单位：
    DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
Analysis of centromere identity and structure in human cells
  • 批准号：
    10014571
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $47.33万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    YAMINI P DALAL
  • 依托单位：
    DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
Kinetochore Interaction with Centromere Chromatin in human cells
  • 批准号：
    8157701
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $18.97万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    YAMINI P DALAL
  • 依托单位：
    DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
海外基金