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Global repeat discovery of rye A and B chromosomes using a high-throughput 454 sequence survey

Global repeat discovery of rye A and B chromosomes using a high-throughput 454 sequence survey
使用高通量 454 序列调查全球重复发现黑麦 A 和 B 染色体
批准号：
161180062
负责人：
Privatdozent Dr. Andreas Houben
金额：
$0.0万
依托单位：
Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2010
资助国家：
德国
项目状态：
已结题
起止时间：
2009-12-31 至 2013-12-31
来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/161180062?language=en
关键词：
Globalrepeatdiscoveryryechromosomes

项目摘要

项目成果

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We aim to reconstruct the first representative dataset of rye highly-repetitive sequences in silico on a whole-genome scale. We will use a high-throughput 454 sequence survey for comparative analysis of the repeat composition with other grass species, for an improved analysis of large genomes. The sequence analysis of flow-sorted rye B chromosomes (Bs) will allow insights in the evolution of Bs. The chromosomal distribution of repeat families will be determined experimentally to establish chromosome specific makers. This analysis will provide new evidence for the generation of rapid genome changes in higher eukaryotes, with particular relevance to selfish chromosomes.
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会议论文
Development of a CRISPR-FISH toolset for imaging of genomic loci in living plants and its application to study the centromere structure and the process of chromosome condensation in living cells
Analysis of a B chromosome undergoing tissue-type specific elimination during embryogenesis of Aegilops speltoides
Sizing the genetic and physical centromere of barley chromosomes as a prerequisite of understanding genome evolution in the genus Hordeum
Targeted engineering of plant centromeres
国内基金
海外基金
黄瓜WD-repeat蛋白CsTTG1与Tu互作调控果瘤形成的研究
  • 批准号：
    31701923
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    25.0万元
  • 批准年份：
    2017
  • 负责人：
    陈春花
  • 依托单位：
    山东农业大学
RY repeat类似元件调控小麦HMW-GS基因表达的分子机制
  • 批准号：
    31571652
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    64.0万元
  • 批准年份：
    2015
  • 负责人：
    李小辉
  • 依托单位：
    首都师范大学
茉莉素调控表皮毛发育的分子机理
  • 批准号：
    31400254
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    10.0万元
  • 批准年份：
    2014
  • 负责人：
    齐天从
  • 依托单位：
    清华大学
唐氏综合症关键区域编码蛋白TTC3的功能初步研究
  • 批准号：
    30970610
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万元
  • 批准年份：
    2009
  • 负责人：
    窦非
  • 依托单位：
    北京师范大学