発光タグHiBiTの高機能化・多機能化を通した新規発生遺伝子解析手法の確立
発光タグHiBiTの高機能化・多機能化を通した新規発生遺伝子解析手法の確立
批准号:
21K06202
负责人:
蒲池 雄介
金额:
$2.66万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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モデル動物におけるゲノム編集技術を用いたノックアウトやノックインによる遺伝子機能の解明が進展しているが、タグの挿入のようなゲノム編集ラインの確立は時間を要するステップである。したがって、一つのペプチドタグを高機能化・多機能化できれば、実験目的ごとのノックインやノックアウトの必要性を低下させ、研究の迅速化につながることが期待される。本研究は、発光タグとして開発されたHiBiTの高機能化・多機能化を通して遺伝子機能の解析の高度化・迅速化をもたらす方法を開発し、これをゼブラフィッシュ胚発生過程における転写因子の研究へと応用することを目的として実施する。HiBiTタグは、NanoLucの2断片(HiBiTとLgBiT)の相補に基づく発光検出が可能なタグとして開発された11アミノ酸からなるペプチドタグであるが、両者は高い親和性で相互作用し得るため、アフィニティタグとしても利用できる可能性がある。一方、細胞内におけるタンパク質検出にナノボディが利用される場合が近年増加している。そこで、親和性が高いことが知られるALFAタグ-ナノボディ(NbALFA)の組み合わせとHiBiTタグとLgBiTの組み合わせの比較を行うことで、HiBiTとLgBiTの相互作用を利用するシステムの有効性を調べた。ALFAタグ-NbALFAの相互作用を利用したプロテインノックダウンが報告されていることから、HiBiTタグあるいはALFAタグを付加した緑色蛍光タンパク質GFP、F-boxを融合したLgBiTおよびF-boxを融合したNbALFAを用意した。それぞれの組合せをゼブラフィッシュ胚で発現させ、相互作用を通してGFPのタンパク質分解が生じるかを調べた。その結果、いずれの場合も両者の相互作用に依存したGFPの蛍光消失がほぼ同様に観察できたことから、HiBiTとLgBiTの相互作用はALFAタグ-NbALFと同様に利用できることが示唆された。この結果は、HiBiTタグが幅広いin vivo実験で利用可能なことを示唆する。
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ゼブラフィッシュ胚における緑色および赤色蛍光タンパク質バリアントの比較
斑马鱼胚胎中绿色和红色荧光蛋白变异的比较
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[神崎智宏, 蒲池雄介]
通讯作者:
蒲池雄介
岡田 啓汰さんらの論文が英国科学雑誌「Nucleic Acids Research」に掲載されました
Keita Okada等人的论文发表在英国科学杂志《Nucleic Acids Research》上
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
ゲノム編集で生じたインデル頻度を分析するサンガー法に基づいたウェブツールの比較
基于Sanger方法分析基因组编辑引起的插入缺失频率的网络工具比较
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[青木伽奈枝, 梅園理玖, 濵本崇典, 山﨑麻衣, 蒲池雄介]
通讯作者:
蒲池雄介
dual-guide CRISPR RNAと野生型またはHiFi Cas9からなるリボヌクレオタンパク質複 合体の切断効率に影響を与えるcrRNAの配列特徴
crRNA 的序列特征影响由双向导 CRISPR RNA 和野生型或 HiFi Cas9 组成的核糖核蛋白复合物的切割效率
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[青木伽奈枝, 岡田啓汰, 椙尾浩大, 田部井輝侑, 今井捷智, 盆子原友希, 蒲池雄介]
通讯作者:
蒲池雄介
生きたゼブラフィッシュ胚のジェノタイピング法の確立
斑马鱼活体胚胎基因分型方法的建立
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[椙尾浩大, 蒲池雄介]
通讯作者:
蒲池雄介
共 6 条
Sox遺伝子の機能と発現制御機構の多様化から探る系統発生のゲノム基盤
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批准号:20017019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.25万
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财政年份:2008
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
Sox遺伝子の機能と発現制御機構の多様化から探る系統発生のゲノム基盤
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批准号:18017019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.86万
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财政年份:2006
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
小型魚類を利用した網羅的な転写制御カスケード同定法の開発
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批准号:16013228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2004
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
小型魚類を利用した眼形成遺伝子の挿入突然変異法による探索
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批准号:16027229
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.26万
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财政年份:2004
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
HMGドメイン転写因子SOXによるN-カドヘリン遺伝子の発現制御
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批准号:12215091
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2000
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
転写活性化におけるSOX2とPax6のパートナーシップと水晶体分化の分子機構
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批准号:12680715
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2000
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
転写制御因子SOXの機能発現に関わる相互作用因子の解析
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批准号:10780460
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
Sox遺伝子群と眼発生過程の組織間相互作用
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批准号:08780707
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
HMGドメインタンパク質SOXによるδ-クリスタリンエンハンサーの制御機構
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批准号:08250212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
水晶体分化に関わる転写制御因子(Sox,Pax)の解析
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批准号:07780656
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1995
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
HMGドメインタンパク質SOX-2による転写活性化機構の解析
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批准号:07258215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1995
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负责人:蒲池 雄介
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依托单位:
海外基金