DNA-katalysierte Verknüpfungs-Cyclisierungs-Reaktionen: Entwicklung einer hochselektiven, signalamplifizierenden Methode für die Mutationsanalyse

DNA 催化的连锁环化反应:开发用于突变分析的高选择性、信号放大方法

基本信息

  • 批准号:
    36411985
  • 负责人:
  • 金额:
    --
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    德国
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 财政年份:
    2007
  • 资助国家:
    德国
  • 起止时间:
    2006-12-31 至 2011-12-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Die DNA/RNA-kontrollierte chemische Ligation ist ein nützliches Werkzeug für die Nanowissenschaft, für die chemische Evolution und für die Nucleinsäureanalytik. Üblicherweise verhindert Produktinhibierung, dass mehr als ein Produktsignal pro Target entsteht. Eine Amplifizierung durch chemische Katalyse wäre wünschenswert, z.B. in der Mutationsanalyse, wenn die nachzuweisende DNA/RNA in geringen Konzentrationen vorliegt. Idealerweise könnte auf eine Polymerasekettenreaktion verzichtet werden. Zentral für die Erreichung eines katalytischen Templateffekts ist, dass die Templataffmität des Reaktionsprodukts nicht höher sein darf als die der Edukte. In diesem Projekt wird eine neue Strategie verfolgt, die auf eine globale Änderung der Produktkonformation abzielt. Eine Cyclisierung, die erst nach der Verknüpfung möglich wird, soll die Affinität für das Templat herabsetzen und damit katalytischen Turnover ermöglichen. Es ist ausserdem die Absicht, die extrem hohe Sequenzspezifität (4000fach) der PNA-Verknüpfung für eine „reale" DNA-Einzelbasenmutationsanalyse nutzbar zu machen. Hierfür werden FRET-detektierte Verknüpfungsreaktionen entwickelt, die unter den herausfordernden Bedingungen der Realtime-PCR-Analyse genomischer DNA von statten gehen. Weiterhin wird untersucht, ob eine templatgesteuerte Oligomerisierung eine Zählung repititiver Genabschnitte zulässt.
Die DNA/ rna - controlled lierte chemische ligigation ist in n<s:1> tzliches Werkzeug f<e:1>, r Die Nanowissenschaft, r Die chemische Evolution und f<e:1> r Die Nucleinsäureanalytik。Üblicherweise verhindert producktinhibierung, pass mehr也在producktsignal pro Target中。[2] [endnoternschenswert, z.B.] in der mutationanalysis, wenn die nachzuweisende DNA/RNA in geringen Konzentrationen vorliet]。Idealerweise könnte aufine Polymerasekettenreaktion verzichtet werden。中央实验室实验室实验室实验室催化反应实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室实验室。在项目管理和新战略管理中,我们将在全球范围内创建一个项目管理系统Änderung。Eine Cyclisierung, die erst nach der verkn<e:1> pfung möglich wind, soll die Affinität f<e:1> r das Templat herabsetzen and damit catalalytischen Turnover ermöglichen。Es是ausserdem Absicht死去,死好多hohe Sequenzspezifitat (4000 fach)代表der PNA-Verknupfung毛皮一张“reale DNA-Einzelbasenmutationsanalyse nutzbar祖茂堂麦臣。在实时pcr - pcr -分析基因组测序者DNA的基础上,对DNA进行了分析。weiterin wind untersut, obine templatgesteuerte Oligomerisierung eine Zählung retitiver Genabschnitte zulässt。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The role of reactivity in DNA templated native chemical PNA ligation during PCR.
PCR 过程中 DNA 模板天然化学 PNA 连接反应活性的作用
Bioorthogonal reactions challenged: DNA templated native chemical ligation during PCR
  • DOI:
    10.1039/c2sc20961f
  • 发表时间:
    2013-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Roloff, Alexander;Seitz, Oliver
  • 通讯作者:
    Seitz, Oliver
Reducing Product Inhibition in Nucleic Acid‐Templated Ligation Reactions: DNA‐Templated Cycligation
减少核酸模板化连接反应中的产物抑制:DNA模板化环化
  • DOI:
    10.1002/cbic.201300516
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    A. Roloff;O. Seitz
  • 通讯作者:
    O. Seitz
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知道了