歯根膜全遺伝子パスウェイ解析による未来型オーダーメード歯周組織再生治療の新展開

基于牙周膜全基因通路分析的未来定制牙周组织再生治疗新进展

• 批准号: 18659622
• 负责人: 村上 伸也
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18659622/
• 关键词: パスウェイ解析; DNAチップ; 歯根膜; 歯根膜細胞; 歯周組織; 歯周組織再生; ゲノム科学

1)DNAチップによる歯根膜細胞分化過程のトランスクリプトーム解析歯周組織再生過程をin vitroで再現するために、当教室で樹立した歯根膜細胞を長期培養した際の遺伝子発現をDNAチップを用いて解析を試みた。すなわち、歯根膜細胞からRNAを培養0日目、3日目、6日目、9日目、12日目、15日目、18日目に抽出し、それぞれのサンプルRNAから逆転写反応により、Cyamine dye(cy3およびcy5)にて標識されたプローブを調整し、DNAチップにハイブリダイゼーションした。そして、培養0日目のサンプルをリファレンスコントロールとして、それぞれの培養日サンプルとの間で遺伝子発現を比較した。2)クラスター分析・GeneOntology解析による歯根膜全遺伝子パスウェイの解明上記1)で得られた遺伝子発現データを統計学的処理することにより、遺伝子の発現パターンを指標とした遺伝子発現クラスター分析、および各遺伝子の生物学的機能を示すGeneOntology解析を行うことにより、歯周組織再生過程における全遺伝子トランスクリプトーム解析を行った。さらに、クラスター分析とGeneOntology解析の結果を統合することにより、統計学に基づいた歯周組織再生過程における代謝および細胞内シグナル分子の経路図(代謝・シグナルパスウェイ)を作成した。その結果、ヒト歯根膜細胞の全遺伝子プロファイリング解析の結果、ヒト歯根膜細胞の硬組織形成分化過程においてはヒト全遺伝子中3175個の遺伝子が有意な発現変化を示すことが明らかとなった。

1) the process of differentiation of root membrane cells in DNA was analyzed. The process of tissue regeneration was analyzed. The process of tissue regeneration was repeated in the process of in vitro. When the classroom was established, the cells of root membranes were cultured for a long period of time. The results showed that the cells of DNA cells were tested by immunoassay. The RNA, root membrane cells, 3-day, 6-day, 9-day, 12-day, 15-day, 18-day eyes, RNA cells, Cyamine dye (cy3 cells), and DNA (root membranes). In the first half of the day, the first day, the first day, the day and the day. 2) the GeneOntology analysis of the whole root membrane, the root membrane, The whole process of tissue regeneration is analyzed in this paper. The results of GeneOntology analysis showed that the whole process of tissue regeneration was caused by the molecular pathways of molecular pathway in cells. The results of the experiment, the results of the analysis of the whole cell cycle of the root membrane cell, the formation of the differentiation process of the hard tissue of the root membrane cell, and the intention to realize the realization of the 3175 genes in the whole cluster.

项目成果

ヒト歯根膜細胞の硬組織形成分化過程における全遺伝子発現プロファイリング解析

人牙周膜细胞硬组织形成分化过程全基因表达谱分析

• 发表时间: 2007
• 作者: Naoyuki Takahashi;et. al.;Pan Y;Ohnishi H;張 剛太;張 剛太;Yasuko Ishikawa;Yasuko Ishikawa;王 ?;石川 康子;王 〓;Wang D;石川 康子;張 剛太;康 金森;張 剛太;康 金森;張 剛太;Zhenfang Yuan;Gouta Cho;Yuan Pan;石川 康子;石川 康子;石川 康子;米田晋也
• 通讯作者: 米田晋也