消化管癌の分子病理診断用ミニcDNAアレイ及び抗体アレイの開発と実践導入

胃肠道肿瘤分子病理诊断微型cDNA芯片和抗体芯片的开发与实际应用

• 批准号: 13218083
• 负责人: 安井 弥
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13218083/
• 关键词: 消化管癌; 分子病理診断; ミニcDNAアレイ; 抗体アレイ; トランスクリプトーム; SAGE法; 遺伝子多型(SNP)

消化管癌のマイクロアレイ技術を用いた分子病理診断による癌の個性の実践導入をを目指して、次のことを行った。1)消化管癌について、serial analysis of gene expression(SAGE)法を用いて網羅的遺伝子発現解析を行った。胃の高分化腺癌、低分化腺癌及び非癌部胃粘膜を対象に解析し、generating gene type IV(Reg IV)をはじめ胃癌に特異的に高発現する種々の遺伝子が同定された。Reg IVは、realtime RT-PCRによる検索では確かに胃癌で高発現しており、ステージと相関していた。さらに、それぞれの組織型に特異的発現を示す遺伝子がいくつか同定され、それには、細胞増殖、染色体安定性、蛋白分解などに関わるものが含まれていた。胃癌特異的に発現していた数種のtagは全く未知のものであり、reverse SAGEにより遺伝子の同定を行っている。2)胃癌患者及び健常人ボランティアを対象とし、遺伝子多型(SNP)と癌の発生・進展との関連を解析した。E-cadherinでは、rSNPとリンパ節転移との間に相関傾向がみられ、MMP-1では、rSNPと胃癌の発生及びステージとの間に有意な相関が認められた。3)診断用ミニcDNAアレイを用いた分子病理診断システムを構築した。ホルマリン固定あるいは新鮮凍結された生検組織について、laser microdissectionを併用して正確にDNA及びRNAを抽出し、それぞれの臓器癌に対する診断用ミニcDNAアレイを用いて癌の個性診断を行うとともに、正常粘膜試料では、消化管癌に関連したSNP同定用ミニアレイを使用し、発癌感受性、薬剤感受性、遺伝性腫瘍の同定などを行うものである。この実践運用により、新しい癌の予防・診断・治療の展開が期待できる。4)蛋白アレイ作成のための蛋白の固相化及び抗原・抗体反応の成立の条件設定を行っており、実践導入は今後の課題である。

The application of molecular pathology in the diagnosis of digestive tract cancer 1)Digestive tract cancer detection, serial analysis of gene expression(SAGE) method is used to analyze gene expression. The expression of gene type IV(Reg IV) in highly differentiated adenocarcinoma, poorly differentiated adenocarcinoma and non-cancerous gastric mucosa was analyzed and identified. Reg IV, realtime RT-PCR detection, accurate detection of gastric cancer, high detection, high detection, high detection of gastric cancer, high detection of gastric cancer, high detection of gastric cancer In addition, the histotypy-specific development of the virus is related to cell proliferation, chromosome stability, protein breakdown, etc. Stomach-cancer-specific findings include several tags that are completely unknown, reverse SAGE, and identical. 2)Analysis of association between SNP and cancer development and progression in patients with gastric cancer and healthy individuals There is a strong correlation between E-cadherin and rSNP, and there is a strong correlation between MMP-1 and rSNP in the development and development of gastric cancer. 3)A molecular pathology diagnostic system was constructed using diagnostic MINI cDNA microarray. The use of DNA and RNA for the diagnosis of cancer, the use of SNPs for the diagnosis of cancer, the use of DNA and RNA for the diagnosis of cancer, the use of DNA and RNA for the diagnosis of cancer. The application of this new approach to cancer prevention, diagnosis and treatment is expected. 4)The establishment of protein immobilization and antigen antibody reaction conditions for protein production and implementation of the introduction of future issues

项目成果

Oue, N.: "Promoter methylation of MGMT is associated with protein loss in gastric carcinomas"Int. J. Cancer. 93・6. 805-809 (2001)

Oue, N.：“MGMT 启动子甲基化与胃癌中的蛋白质丢失有关”Int. Cancer 93・6 (2001)。

Umanski, M.: "Proton pump inhibitors reduce cell cycle abnormalities in Barrett's esophagus"Oncogene. 20・55. 7987-7991 (2001)

Umanski, M.：“质子泵抑制剂减少巴雷特食管的细胞周期异常”Oncogene 20・55 (2001)。

Kitadai, Y.: "Clinicopathological significance of vascular endothelial growth factor(VEGF)-C in human esophageal squamous cell carcinomas"Int. J. Cancer. 93・5. 662-666 (2001)

Kitadai, Y.：“血管内皮生长因子 (VEGF)-C 在人类食管鳞状细胞癌中的临床病理学意义”，Int. Cancer 93・5 (2001)。

Yasui, W.: "Molecular diagnosis of gastric cancer ; present and future"Gastric Cancer. 4・3. 113-121 (2001)

Yasui，W.：“胃癌的分子诊断；现在和未来”胃癌4・3（2001）。

Kuniyasu, H.: "Heparan sulfate enhances invasion by human colon carcinoma cell lines through expression of CD44 variant exon 3"Clin. Cancer Res.. 7・12. 4067-4072 (2001)

Kuniyasu, H.：“硫酸乙酰肝素通过 CD44 变异外显子 3 的表达增强人结肠癌细胞系的侵袭”Clin. Cancer Res. 7・12 (2001)。