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脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の総合的解析

脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の総合的解析
脊椎动物基因组中旁系同源区域的综合分析
批准号：
14011219
负责人：
笠原 正典
金额：
$3.71万
依托单位：
The Graduate University for Advanced Studies
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2002 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14011219/
关键词：
パラロガス領域ゲノム重複MHC無顎類

项目摘要

项目成果

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われわれは、HLA(MHC)領域とパラロガスな領域がヒトゲノムに3箇所存在することを発見し、これらのパラロガス領域とHLA領域の原型が脊椎動物進化の初期におきたと想定される2回の大規模な染色体重複(おそらくはゲノム重複)によって形成された可能性が高いことを示してきた。今日では、本パラロガス群はヒトゲノムで同定された数多くのパラロガス領域のプロトタイプとしての地位を確立しつつある。しかしながら、1)パラロガス領域を生み出した重複の性質、回数、時期、2)重複ののちにゲノムに生じた変化、に関しては十分な理解が得られていないのが現状である。そこで、本研究では、1)系統発生的に2度の重複の直前、直後に位置すると考えられる無顎類(特に、ヌタヌナギ)に焦点を当てて、MHCパラロガス群のBACクローンを用いた解析を行うとともに、2)ゲノム解析が終了しつつあるヒトおよびマウスを対象として、重複後に生じたゲノム構造の変化を明らかにすることを目的として研究を遂行し、以下の成果を得た。1)哺乳類とほぼ同じゲノムサイズをもっと推定されるヌタウナギのゲノムを3倍カバーするBACライブラリー(平均インサート長約100kb)を作製した。2)上記BACライブラリー(3倍ゲノムカバレッジ分)のスクリーニングを行い、7個のMHC前駆領域をカバーするBACクローンを同定し、その塩基配列を決定した。3)ヌタウナギ白血球由来cDNAライブラリーのランダム・シークエンスを行い、約12,000クローンの5'-end,3'-endの塩基配列を決定した。4)MHCパラロガス群に属するホヤ遺伝子を体系的に同定し、染色体重複後に生じたゲノム構造の変化を解析した。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Welch, A.Y.et al.: "Identification of the mouse killer immunoglobulin-like receptor-like (Kin) gene family mapping to chromosome X."Immunogenetics. 54. 782-790 (2003)
Welch, A.Y.等人：“定位到 X 染色体的小鼠杀伤性免疫球蛋白样受体样 (Kin) 基因家族的鉴定。”免疫遗传学。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Nagata, T., et al.: "The leukocyte common antigen (CD45) of the Pacific hagfish, Eptatretus stoutii : implications for the primordial function of CD45"Immunogenetics. 54. 286-291 (2002)
Nagata, T. 等人：“太平洋盲鳗 Eptatretus stoutii 的白细胞共同抗原 (CD45)：对 CD45 原始功能的影响”免疫遗传学。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Kasahara, M.: "Polyploid origin of the human genome. In : D.N.Cooper(ed.) : Encyclopedia of the Human Genome"Nature Publishing Group(印刷中). (2003)
Kasahara, M.：“人类基因组的多倍体起源。见：D.N.Cooper（编辑）：人类基因组百科全书”自然出版集团（2003 年）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Liu, Y., et al.: "Xenopus class II A genes : studies of genetics, polymorphism, and expression"Dev. Comp. Immunol. 26. 735-750 (2002)
Liu, Y., et al.：“爪蟾 II A 类基因：遗传学、多态性和表达的研究”Dev.
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
新しい抗体試薬の開発と臨床検査への応用
  • 批准号：
    21659143
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.11万
  • 财政年份：
    2009
  • 负责人：
    笠原 正典
  • 依托单位：
    Hokkaido University
無顎類のゲノムと免疫系
  • 批准号：
    20017001
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $6.27万
  • 财政年份：
    2008
  • 负责人：
    笠原 正典
  • 依托单位：
    Hokkaido University
LRRを用いた抗原認識システムの開発
  • 批准号：
    19659120
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.11万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    笠原 正典
  • 依托单位：
    Hokkaido University
無顎類のゲノムと免疫系
  • 批准号：
    18017001
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $5.44万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    笠原 正典
  • 依托单位：
    Hokkaido University
海外基金