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比較ゲノム解析によるゲノム重複の研究

通过比较基因组分析研究基因组复制

基本信息

批准号：
17018001
负责人：
笠原正典
金额：
$ 2.88万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018001/
关键词：
ヌタウナギペア型免疫グロブリン受容体 VLR APAR

项目摘要

われわれは、HLA(MHC)領域とパラロガスな領域がヒトゲノムに3箇所存在することを発見し、これらのパラロガス領域とHLA領域の原型が脊椎動物進化の初期におきたと想定される2回の大規模な染色体重複(おそらくはゲノム重複)によって形成された可能性が高いことを示してきた。しかしながら、パラロガス領域を生み出した重複の性質、回数、時期に関しては十分な理解が得られていないのが現状である。そこで、本研究では、系統発生的に2度の重複の直前、直後に位置すると考えられる無顎類(特に、ヌタヌナギEptatretus burgeri)に焦点を当てて研究を進め、以下の成果を得た。1.ヌタウナギ・ゲノムに存在するMHCパラロガス領域を同定することを目的として、MHCアンカー遺伝子をコードするBACクローンを単離した。また、BACクローンを用いたfluorescence in situ hybridization法の開発をおこなった。2.免疫グロブリンやT細胞抗原レセプターの祖先と推測されるVドメインを有するpaired Ig-like receptor遺伝子群をヌタヌナギで同定し、APAR(agnathan paired receptors resembling antigen receptors)と命名、その構造解析をおこなった。3.leucine rich repeatsの再構成によって、著しい多様性を生み出す抗原レセプター遺伝子VLR(variable lymphocyte receptor)がヌタウナギに存在することを見出し、そのゲノム構造を解明した。

In the early stages of vertebrate evolution, the HLA(MHC) domain and the HLA domain prototype are thought to be two cycles of large-scale chromosome duplication, which is highly probable. The nature, number and period of repetition of the field are closely related to the understanding of the present situation. This study is focused on the development of the system and the results below. 1. The MHC domain is identical to the MHC domain, and the MHC domain is identical to the BAC domain. Development of fluorescence in situ hybridization method for BAC 2. The ancestry of T cell antigens in immune cells is presumed to be related to the existence of paired Ig-like receptor gene subgroups. APAR(agnathan paired receptors assembling antigen receptors) is named and its structure is analyzed. 3. The structure of leucine rich repeats is explained by the existence of variable lymphocyte receptor (VLR).