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脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の総合的解析

脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の総合的解析
脊椎动物基因组中旁系同源区域的综合分析
批准号：
16011220
负责人：
笠原 正典
金额：
$3.52万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2004 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16011220/
关键词：
ヌタウナギBACライブラリーペア型免疫グロブリン受容体EST解析

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われわれは、HLA(MHC)領域とパラロガスな領域がヒトゲノムに3箇所存在することを発見し、これらのパラロガス領域とHLA領域の原型が脊椎動物進化の初期におきたと想定される2回の大規模な染色体重複(おそらくはゲノム重複)によって形成された可能性が高いことを示してきた。しかしながら、パラロガス領域を生み出した重複の性質、回数、時期に関しては十分な理解が得られていないのが現状である。そこで、本研究では、系統発生的に2度の重複の直前、直後に位置すると考えられる無顎類(特に、ヌタヌナギ)に焦点を当てて研究を進め、以下の成果を得た。1)哺乳類とほぼ同じゲノムサイズをもつと推定されるヌタウナギのゲノムを3倍カバーするBACライブラリー(平均インサート長約100kb)を作製した。2)上記BACライブラリー(3倍ゲノムカバレッジ分)のスクリーニングを行い、7個のMHC前駆領域をカバーするBACクローンを同定し、その塩基配列を決定した。3)ヌタウナギ白血球由来cDNAライブラリーのランダム・シークエンスを行い、約12,000クローンの5'-end,3'-endの塩基配列を決定した。4)免疫グロブリンやT細胞抗原レセプターの祖先と推測されるVドメインを有するpaired Ig-like receptor遺伝子群をヌタヌナギで同定し、APAR(agnathan paired receptors resembling antigen receptors)と命名、その構造解析をおこなった。5)ヌタウナギで、VLR(variable lymphocyte receptor)を同定し、その構造解析をおこなった。
期刊论文(11)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Identification of the rat IgA Fc receptor encoded in the leukocyte receptor complex
DOI： 10.1007/s00251-003-0626-1
发表时间： 2004-01-01
期刊： IMMUNOGENETICS
影响因子： 3.2
作者： [Maruoka, T, Nagata, T, Kasahara, M]
通讯作者： Kasahara, M
Human testicular protein TPX1/CRISP-2:: localization in spermatozoa, fate after capacitation and relevance for gamete interaction
DOI： 10.1093/molehr/gah156
发表时间： 2005-04-01
期刊： MOLECULAR HUMAN REPRODUCTION
影响因子： 4
作者： [Busso, D, Cohen, DJ, Cuasnicú, PS]
通讯作者： Cuasnicú, PS
Natural killer cell receptors in the horse:: evidence for the existence of multiple transcribed LY49 genes
DOI： 10.1002/eji.200324695
发表时间： 2004-03-01
期刊： EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY
影响因子： 5.4
作者： [Takahashi, T, Yawata, M, Kasahara, M]
通讯作者： Kasahara, M
Transcriptome analysis of hagfish leukocytes: a framework for understanding the immune system of jawless fishes.
DOI： 10.1016/j.dci.2004.04.005
发表时间： 2004-08
期刊： Developmental and comparative immunology
影响因子： 2.9
作者： [Takashi Suzuki;T. Shin-I;Y. Kohara;M. Kasahara]
通讯作者： Takashi Suzuki;T. Shin-I;Y. Kohara;M. Kasahara
共 8 条
    新しい抗体試薬の開発と臨床検査への応用
    • 批准号：
      21659143
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.11万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      笠原 正典
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    無顎類のゲノムと免疫系
    • 批准号：
      20017001
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $6.27万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      笠原 正典
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    LRRを用いた抗原認識システムの開発
    • 批准号：
      19659120
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.11万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      笠原 正典
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    無顎類のゲノムと免疫系
    • 批准号：
      18017001
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.44万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      笠原 正典
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    海外基金